Protein unfolding on single molecule level - relating the radius of gyration to the hydrodynamic radius

单分子水平上的蛋白质展开 - 将回转半径与流体动力学半径联系起来

• 批准号: 59081828
• 负责人: Dr. Thomas Dertinger
• 金额: --
• 依托单位: Department of Physics
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Fellowships
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2006-12-31 至 2008-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/59081828?language=en
• 关键词: Protein; unfolding; single; molecule; level

Proteine sind aus Aminosäuren aufgebaute Heteropolymere. Damit Proteine funktionieren, müssen sie sich zunächst in ihren sogennanten nativen Zustand falten. Diesen Vorgang, bei dem die zweidimensionale Kette von Aminosäuren eine spezifische dreidimensional Strukur bildet, nennt man Proteinfaltung. Die Funktion von Proteinen hängt wesentlich von ihrer dreidimensionalen Struktur ab. Fehlfaltungen führen zu nichtfunktionierenden oder im schlimmsten Fall zu schlecht funktionierenden Proteinen. Während schon viel über den nativen und vollständig entfalteten Zustand von Proteinen bekannt ist, sind die Eigenschaften von transienten Konformationen, wie z.B.des „collapsed state“ Gegenstand aktueller Forschung. Diese transienten Konformationen sind physiologisch höchst relevant aber schwierig zu detektieren / messen, da sie entweder kurzlebig sind, oder wie der „collapsed state“, mit nativ gefalteten Proteinen koexisiteren und oft nur einen geringen Anteil der gesamten Proteinmenge ausmachen. Die Messung und Charakterisierung dieser transienten Zustände ist Ziel dieses Projektes. Es soll sowohl unter Gleichgewichts- als auch unter nicht Gleichgewichtsbedingungen auf Einzelmolekül Ebene in vitro geschehen. Die Kombination von Einzelmolekül Förster-Resonanz-Energie-Transfer (sm-FRET) mit der kürzlich entwickelten Zwei-Fokus Fluoreszenz Korrelations Spektroskopie (2fFCS) ermöglicht es, sowohl lokale als auch globale Protein-Konformationsparameter gleichzeitig zu messen. Aus diesen Messungen können Informationen über ein sich entfaltendes / faltendes Protein (z.B. remanente Strukturen) gezogen werden. Als ein Model System wird das Protein Baranse gewählt, weil es mindestens zwei Faltungszwischenzustände aufweist, die momentan nicht gut charakterisiert sind.

蛋白质是由异多聚体的氨基组成的。他妈的蛋白质功能，必须让她在自己的家乡长大。这个Vorgang，在这个二维的Kette von Aminosäuren的一个特殊的三维结构的图像，nennt man Protefaltung。Die Funktion von Proteinen hängt wesentlich von irer dreidimensionalen Struktur ab. Fehlfaltungen führen zu nichtfunktionierenden or der im schlimmsten Fall zu schlecht funktionierenden Proteinen.蛋白质的天然性和潜在性是非常重要的，它是瞬时变形的特征，就像“崩溃状态”的研究一样。这种短暂的变形是一种生理学上的变化，与测量/测量密切相关，因为它们开始时很危险，或者像“崩溃状态”一样，具有天然的蛋白质稳定性，并且通常只有一种蛋白质能正常工作。这些测量和特性是暂时性的。Es soll sowohl unter Gleichgewichts- als auch unter Gleichgewichts bedingungen auf Einzelmolekül Ebene in vitro geschehen.结合了双焦点共振光谱（2fFCS）的共振能量转移（sm-FRET）方法，局部也可以获得全局蛋白质构象参数。Aus diesen Messungen können Informationen über ein sich entfaltendes / faltendes Protein（z.B. remanente Strukturen）gezogen韦尔登.一个模型系统将使蛋白质平衡变得更好，因为它的思想是复杂的，目前还没有很好的特征。