ゲノム編集とscRNA-seq解析を用いた天疱瘡や類天疱瘡発症の分子病態解明

使用基因组编辑和 scRNA-seq 分析阐明天疱疮和类天疱疮发展的分子发病机制

• 批准号: 22K10209
• 负责人: 古村 南夫
• 金额: $ 2.41万
• 依托单位: Fukuoka Dental College
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K10209/
• 关键词: 自己免疫水疱症; バイオマーカー; ゲノム編集; シングルセルRNAシークエンシング; 疾患バイオマーカー; 口腔粘膜

自己免疫水疱症の発症に関わる自己抗体が標的とする表皮細胞の細胞間結合蛋白抗原の遺伝子をゲノム編集でノックアウトした粘膜／皮膚由来ケラチノサイトを構築し、最新鋭の次世代シーケンサーによるシングルセルRNAシークエンシングにて包括的RNAトランスクリプトーム解析することを目的とする。CRISPR/Cas9 システムを用いたゲノム編集により、自己免疫水疱症の抗原であるデスモグレイン３をノックアウトし、口腔粘膜3次元のケラチノサイト（初代培養正常細胞／HaCaT細胞）培養系を構築した。デスモグレイン3の発現消失とその影響について、蛍光抗体法や免疫ブロット法により確認した。デスモグレイン3のCas9-gRNAプラスミドは本学で既に作製されたものを用いた。自己免疫水疱症天疱瘡のもう一つの抗原であるデスモグレイン１のノックアウトについては確立できていないため、今後確立手段についてさらに検討を重ねる必要がある。ノックアウト細胞は2次元および3次元培養にて、患者血清抗体やモノクローナル抗体を添加したものと無添加群を対照として、シングルセルRNAシーケンシングにてmRNAとmiRNA発現プロファイルを確認後、相互比較し包括的トランスクリプトーム解析を行う予定としており、アウトソーシングでの解析法などの詳細についての調査および準備を始めた。アウトソーシングでの解析法については、費用やサポート体制についての詳細に関する調査を今後さらに進めるとともに、解析事項の必要性の検討を行い解析対象の絞り込みなどによって、研究を推進していく予定である。

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