森林資源保全のための樹木DNAバーコードの充実と精度の向上に関する研究

丰富和提高森林资源保护树木DNA条形码准确性的研究

• 批准号: 25292098
• 负责人: 吉村 研介
• 金额: $ 10.73万
• 依托单位: Forestry and Forest Products Research Institute
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2013
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2013-04-01 至 2016-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-25292098/
• 关键词: 分類形質; 遺伝育種; DNAバーコード; 日本産樹木

DNA バーコードとは、短いDNA 配列情報で、種の同定を行う手法であり、樹木のいかなる部位（葉、材、根、花粉など）からでもDNA が抽出できて、樹種の特定が出来るDNA バーコード情報の構築を目指している。これまで、森林総研と東北大学との共同による木材標本、さく葉標本、さらに大学演習林などに協力して収集した標本等、7000個体、1039種のさく葉標本とそのDNA を収集している。ユニバーサルなプライマーが無く、解析が困難な葉緑体DNA のmatK 部分遺伝子領域を、累計で747種3500サンプル明らかにした。しかしながら実験に困難を伴うため、新たなプライマーを開発してテスト中である。DNA バーコードの種の識別能力は、rbcL部分配列では45.1%、trnH-psbA で68.8%、matK で65.7% であった。3領域を併せると、日本産樹木では77%程度の種識別が出来る。その結果、ブナ科、クスノキ科などでは、属を識別するのも困難な分類群が存在することが明らかとなった。標本の個体情報および塩基配列情報は、JBOLI（Japanese Barcode of Life Initiative）が一員であるCBOL（Consortium for the Barcodeof Life）が運営する国際的なデータベースシステムBOLD（Barcode of Life Data Systems）に入力されており、一部の情報は、DNAバーコードデータベース (JBOL-DB)によって公開されている。

DNA バ ー コ ー ド と は, short い DNA match column intelligence で, kind of の with fixed line を う gimmick で あ り, trees の い か な る parts (leaf, wood, roots, pollen な ど) か ら で も が DNA extraction で き て, tree species specific が の る DNA バ ー コ ー ド intelligence の build を refers し て い る. こ れ ま で, forest 総 research と Northeastern University と の common に よ る wood specimens, さ く leaf specimens, さ ら exercises に university Lin な ど に together し て 収 set し た specimens, 7000 individuals, 1039 kinds of の さ く leaf specimens と そ の DNA を 収 set し て い る. ユ ニ バ ー サ ル な プ ラ イ マ ー が く, parsing が difficult な chloroplast DNA の matK could identify some legacy subareas 伝 を, cumulative で 747 3500 サ ン プ ル Ming ら か に し た. <s:1> ながら ながら practical に difficult を accompanied by うため new たなプラ を を を を を を を を を てテスト in progress である. DNA バ ー コ ー ド の の recognition ability は, rbcL department assign column で は 45.1%, trnH - psbA で 68.8%, matK could identify で 65.7% で あ っ た. The three domains を and せると, the Japanese native trees で and 77% of the species are identified が and る. そ の results, ブ ナ, ク ス ノ キ secco な ど で は, を recognition す る の も difficult な taxa が exist す る こ と が Ming ら か と な っ た. Specimen individual information および base coordination information が JBOLI (Japanese Barcodeof Life Initiative) が member であるCBOL (Consortium for the barcode of Life) が luck 営 す る international な デ ー タ ベ ー ス シ ス テ ム BOLD (Barcode of Life Data Systems) に さ into force れ て お り, a の intelligence は, DNA バ ー コ ー ド デ ー タ ベ ー ス (JBOL - DB) に よ っ て public さ れ て い る.

项目成果

日本産樹木DNAバーコードの分解能

日本树木 DNA 条形码的解析

• 发表时间: 2015
• 作者: 吉村研介;鈴木節子;勝木俊雄;能城修一,吉丸博志
• 通讯作者: 能城修一,吉丸博志

DNA barcoding on Japanese woody plants

日本木本植物的 DNA 条形码

• 发表时间: 2014
• 作者: Kensuke Yoshimura;Suzuki Setsuko;Toshio Katsuki;Shuichi Noshiro;Hiroshi Yoshimaru
• 通讯作者: Hiroshi Yoshimaru