森林資源保全のための樹木DNAバーコードの充実と精度の向上に関する研究

DNA バーコードとは、短いDNA 配列情報で、種の同定を行う手法であり、樹木のいかなる部位（葉、材、根、花粉など）からでもDNA が抽出できて、樹種の特定が出来るDNA バーコード情報の構築を目指している。これまで、森林総研と東北大学との共同による木材標本、さく葉標本、さらに大学演習林などに協力して収集した標本等、7000個体、1039種のさく葉標本とそのDNA を収集している。ユニバーサルなプライマーが無く、解析が困難な葉緑体DNA のmatK 部分遺伝子領域を、累計で747種3500サンプル明らかにした。しかしながら実験に困難を伴うため、新たなプライマーを開発してテスト中である。DNA バーコードの種の識別能力は、rbcL部分配列では45.1%、trnH-psbA で68.8%、matK で65.7% であった。3領域を併せると、日本産樹木では77%程度の種識別が出来る。その結果、ブナ科、クスノキ科などでは、属を識別するのも困難な分類群が存在することが明らかとなった。標本の個体情報および塩基配列情報は、JBOLI（Japanese Barcode of Life Initiative）が一員であるCBOL（Consortium for the Barcodeof Life）が運営する国際的なデータベースシステムBOLD（Barcode of Life Data Systems）に入力されており、一部の情報は、DNAバーコードデータベース (JBOL-DB)によって公開されている。

DNA バーコードとは、短いDNA 配列情報で、種の同定を行う手法であり、樹木のいかなる部位（葉、材、根、花粉など）からでもDNA が抽出できて、樹種の特定が出来るDNA バーコード情報の構築を目指している。これまで、森林総研と東北大学との共同による木材標本、さく葉標本、さらに大学演習林などに協力して収集した標本等、7000個体、1039種のさく葉標本とそのDNA を収集している。ユニバーサルなプライマーが無く、解析が困難な葉緑体DNA のmatK 部分遺伝子領域を、累計で747種3500サンプル明らかにした。しかしながら実験に困難を伴うため、新たなプライマーを開発してテスト中である。DNA バーコードの種の識別能力は、rbcL部分配列では45.1%、trnH-psbA で68.8%、matK で65.7% であった。3領域を併せると、日本産樹木では77%程度の種識別が出来る。その結果、ブナ科、クスノキ科などでは、属を識別するのも困難な分類群が存在することが明らかとなった。標本の個体情報および塩基配列情報は、JBOLI（Japanese Barcode of Life Initiative）が一員であるCBOL（Consortium for the Barcodeof Life）が運営する国際的なデータベースシステムBOLD（Barcode of Life Data Systems）に入力されており、一部の情報は、DNAバーコードデータベース (JBOL-DB)によって公開されている。