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ヒヨドリバナに感染するジェミニウイルスの分子生態学

感染鹎的双生病毒的分子生态学

基本信息

批准号：
09874162
负责人：
矢原徹一
金额：
$ 1.34万
依托单位：
Kyushu University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
1997
资助国家：
日本
起止时间：
1997 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

ヒヨドリバナ属には有性生殖型と無性生殖型がある。ヒヨドリバナはジェミニウイルスの感染を受け、無性生殖型の方がより高い率で感染される。ジェミニウイルスは遺伝子レベルでよく研究されている植物ウイルスである。その知識を活用し、ホストと病原体の相互作用系で予測される淘汰の検出をめざすのが本研究の目的である。これまでの研究から、ホストレンジを決定するC4遺伝子を含むDNA領域をPCRで増幅し、PCR-SSCP法で多重感染を検出し、その上でSSCPタイプの配列を決定する技術的準備が整っている。また、ヨツバヒヨドリ有性集団とヒヨドリバナ無性集団が隣接する伊豆半島天城山北斜面で調査データを蓄積している。この調査地で各SSCPタイプから複数のPCR産物の配列を決定し、日本各地から得られたウイルスとの系統関係を調査した。ウイルスの系統は地理的にまとまる傾向を示さず、地域集団間の移住が頻繁に起きていると考えられる。ただし、各SSCPタイプ内の配列変異は単系統となり、いくつかのSSCPタイプも姉妹関係にあることがわかった。これらの分化は集団内で起きたものと考えられる。そこで、有性生殖ホスト集団内で起きたと考えられるアミノ酸置換数と地理的に異なる集団間で起きたと考えられるアミノ酸置換数を比較した結果、前者ではC4のアミノ酸置換数がC4以外の領域のそれより多く、後者では逆の関係が得られた。この結果は統計的に有意であり、有性ホスト集団内ではアミノ酸置換が加速されることが示唆された。

This is a sexual reproduction type and asexual reproduction type. The infection rate of asexual reproduction type is relatively high.ジェミニウイルスは遗伝子レベルでよく研究されている植物ウイルスである。The purpose of this study is to use this knowledge to predict and eliminate the interaction system of pathogens. This research is aimed at determining the C4 gene, PCR amplification in the DNA domain, PCR-SSCP detection of multiple infections, and technical preparation for SSCP alignment determination. The survey data accumulated on the north slope of Mount Tiancheng in the Izu Peninsula is adjacent to each other. The alignment of multiple PCR products was determined for each SSCP site, and the systematic relationship between SSCP sites was investigated in Japan. It is not easy to find a geographical trend, but it is easy to find a geographical trend. Each SSCP is assigned to a different system, and each SSCP is assigned to a different relationship. The group was divided into two groups. The number of acid substitutions within the group of sexual reproduction is compared with the number of acid substitutions within the group of geographical reproduction. The former is the number of acid substitutions outside the group of C4, and the latter is the inverse relationship. The results were statistically significant, and there was no evidence of acid substitution within the group.