ジェミニウイルスと宿主植物の分子共進化

双生病毒与宿主植物的分子协同进化

• 批准号: 06273207
• 负责人: 矢原 徹一
• 金额: $ 0.77万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 1994
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1994 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-06273207/
• 关键词: ジェミニウイルス; ヒヨドリバナ; 分子進化; 共進化

本研究のゴールは、ジェミニウイルスと宿主植物(ヒヨドリバナ)が分子レベルで共進化していることを実証することである。ジェミニウイルスは植物ウイルスとしては例外的なDNAウイルスである。突然変異体に関する研究から、ウイルスDNAがコードしている6つのタンパク質のうち主として複製タンパク質が宿主の幅を決めていると考えられている。そこで、このタンパク質の遺伝子DNAを特異的に増幅するプライマーを設計し、その分子進化パターンの比較を試みた。ジェミニウイルスの一種TLCVの感染による特徴的な病斑をあらわしたヒヨドリバナを福岡県、佐賀県、神奈川県で採集し、病斑を持つ葉から全DNAを抽出し、精製後、上記のプライマーで約570塩基対のDNA断片を増幅し、その塩基配列を決定した。横浜市から採集した1個体の宿主植物からは、3つの異なるDNA断片が増幅された。これまでに決定した8つのクローンの系統関係を、既知の4種のジェミニウイルスを外群として、最節約法で推定した結果から、ヒヨドリバナに感染するジェミニウイルスは大きく2つの系統に分化しており、2つの系統のウイルスがしばしば共感染することがわかった。一方の系統には、病斑から区別されていたTYLCVが内群として含まれた。このウイルスはイスラエル産の植物から単離されたものであり、2つの系統のうち少なくとも一方は国外にも広く分布することがわかった。この結果から、ジェミニウイルスはきわめて分散力が大きいことが示唆される。2つの系統ら得られた配列の間で同義・異議置換率を推定し、20アミノ酸ごとに平均してウインドウ解析を行った。その結果、同義・異議置換率がほぼ等しくなる場所が2ヵ所あることがわかった。これらの場所では、同義置換率が相対的に低下しており、何らかの自然選択が作用したフットプリントである可能性が示唆された。

In this study, the host plants of のゴールは and ジェミニウイルスと(ヒヨドリバがmolecule レベルでCOevolutionしていることを実证することである.ジェミニウイルスは Plant ウイルスとしては EXCEPTIONAL なDNA ウイルスである. All of a sudden, the research on allogeneic aliens has been carried out, and the research on DNA has changedク性のうち主として COPY タンパク之host の片をdetermine めていると考えられている.そこで、このタンパク性の缝子DNAをSpecific に Increased amplitude するプライマーをDesignし、そのMolecular evolution パターンのComparison をtrialみた.ジェミニウイルスの A kind of TLCV infection and special lesions をあらわしたヒヨドリバナをFukuoka Prefecture, Saga Prefecture, Kanagawa Prefecture でCollection, disease After extracting and refining the whole DNA of the spotted leaves, the above-mentioned DNA fragments of approximately 570 radial bases were enlarged, and the base alignment was determined. Yokohama City collected 1 individual host plant and 3 different DNA fragments.これまでにdeterminationした8つのクローンのsystem relationshipを、knownの4kindsのジェミニウイルスをOutgroup として, The most economical method で Presumption したResult から, ヒヨドするジェミニウイルスは大きく2つのSystemにdifferentiationしており、2つのsystemのウイルスがしばしばco-infection することがわかった. One party's system is different, and the difference between lesions is that TYLCV is within the group.このウイルスはイスラエルproduced plant から単里されたものであり、2つのsystemのうち小なくとも方は外にも広く distribution することがわかった.このRESULTS から、ジェミニウイルスはきわめてDispersion force が大きいことが见憆される. 2つのsystemらgetsられたmatchingの间でsynonyms・objection replacement rateをESTIMATIONし、20アミノ acidごとにmeanしてウインドウanalyticを行った.そのRESULTS, SYNONYMS, OBJECTIONS, がほぼ, etc. しくなるplaceが2ヵ所あることがわかった.これらの Place では, synonymous replacement rate が 対 にlow しており, らかThe effect of natural selection is the possibility of selection.