Mechanism of induction of the homologous global carbon regulators YvoA and DasR in bacteria

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Bakterien können ihre Nahrung aus den unterschiedlichsten Kohlenstoffquellen beziehen. Deren Verwertung wird präzise von global und spezifisch agierenden Transkriptionsfaktoren kontrolliert wie z. B. YvoA in Bacillus subtilis und DasR in Streptomyces coelicolor. Die homologen Proteine YvoA und DasR gehören zur GntR-Überfamilie bakterieller Repressoren, genauer gesagt zur HutC-Familie. Bis jetzt sind nur Strukturfragmente dieser Familie bekannt. Kristallstrukturen gibt es von isolierten C-terminalen Domänen, aber in keiner dieser Strukturen konnte die Effektorbindestelle identifiziert werden. Weil darüber hinaus der N-terminale DNA-Bindekopf in diesen Strukturen fehlt, gibt es keine Vorstellung über den allosterischen Mechanismus, welcher, ausgelöst durch die Bindung eines niedermolekularen Effektor-Moleküls an die C-terminale Repressordomäne, eine Konformationsänderung in der DNA-Bindedomäne herbeiführt, das Ablösen des Repressors von der DNA bewirkt und die Gentranskription ermöglicht. Ziel des Antrags ist, den allosterischen Mechanismus aufzuklären, mittels dessen YvoA und DasR die Gentranskription reguliert. Wir erwarten, dass unsere Ergebnisse auf andere HutC-Mitglieder übertragbar sind.