超好熱菌におけるDNA再構成に関する研究
超好熱菌におけるDNA再構成に関する研究
批准号:
08750928
负责人:
藤原 伸介
金额:
$0.64万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
财政年份:
1996
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1996 至 --
中文摘要
超好熱菌(hyperthermophilic archaea)はその生育環境の特殊性から原始生命体に最も近い生物と考えられている。我々は鹿児島県小宝島より超好熱菌Pyrococcus属KOD1株を分離した。KOD1株のDNA再構成を研究することで、複製、組換え、再編機構の原始メカニズムの予測を試みた。DNA合成酵素(KOD1ポリメラーゼ)のDNA合成速度の高さ(138bases/sec)、修復能の高さは既知の酵素のなかで最高であることは昨年報告したが、プロセッシビティの高さについても検討したところ、300塩基以上という結果を得た。また、KOD1ポリメラーゼの介在配列(インテイン)は制限酵素をコードしていることをこれまでに明らかにしているが、その認識配列を検討したところ、14塩基を認識していることが示された。また、認識特性は塩濃度(KCl)に高く依存し、塩濃度によって認識配列が変ることが示された。このことは細胞内のカリウムイオン濃度によって、DNA再編が制御されていることを示唆するものである。DNA再編と蛋白質誘導との関係を明確にするために、DNAポリメラーゼ、制限酵素をコードする2種類のインテイン産物を精製し、マウスを免疫することで抗体を調製した。現在、この抗体を用いて誘導条件下での各蛋白質の発現をモニターし、染色体DNAの再編をサザンハイブリダイゼーション法で検討している。さらに、DNAポリメラーゼ遺伝子周辺の遺伝子配位について検討したところ、分子シャペロニン、組換え蛋白質、リボースリン酸ピロリン酸キナーゼ、メチル基転移酵素などが確認された。このことから、ゲノム上では遺伝子発現、調節に関与する蛋白質遺伝子の集中が考えられた。
英文摘要
超好熱菌(hyperthermophilic archaea)はその生育環境の特殊性から原始生命体に最も近い生物と考えられている。我々は鹿児島県小宝島より超好熱菌Pyrococcus属KOD1株を分離した。KOD1株のDNA再構成を研究することで、複製、組換え、再編機構の原始メカニズムの予測を試みた。DNA合成酵素(KOD1ポリメラーゼ)のDNA合成速度の高さ(138bases/sec)、修復能の高さは既知の酵素のなかで最高であることは昨年報告したが、プロセッシビティの高さについても検討したところ、300塩基以上という結果を得た。また、KOD1ポリメラーゼの介在配列(インテイン)は制限酵素をコードしていることをこれまでに明らかにしているが、その認識配列を検討したところ、14塩基を認識していることが示された。また、認識特性は塩濃度(KCl)に高く依存し、塩濃度によって認識配列が変ることが示された。このことは細胞内のカリウムイオン濃度によって、DNA再編が制御されていることを示唆するものである。DNA再編と蛋白質誘導との関係を明確にするために、DNAポリメラーゼ、制限酵素をコードする2種類のインテイン産物を精製し、マウスを免疫することで抗体を調製した。現在、この抗体を用いて誘導条件下での各蛋白質の発現をモニターし、染色体DNAの再編をサザンハイブリダイゼーション法で検討している。さらに、DNAポリメラーゼ遺伝子周辺の遺伝子配位について検討したところ、分子シャペロニン、組換え蛋白質、リボースリン酸ピロリン酸キナーゼ、メチル基転移酵素などが確認された。このことから、ゲノム上では遺伝子発現、調節に関与する蛋白質遺伝子の集中が考えられた。
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Yan,Z.et al.: "In vitro stabilization and in vivo solubilization of foreign proteins by the B subunit of an archaeon chaperonin from Pyrococcus sp.KOD1." Appl.Environ.Microbiol.63・2. 785-789 (1997)
Yan, Z. 等人:“来自火球菌 sp.KOD1 的古细菌伴侣蛋白 B 亚基对外源蛋白的体外稳定和体内溶解。Appl.Environ.Microbiol.63·2 (1997)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Jongsa reejit,B.et al.: "Gene cloning,sequencing and enzymatic properties of glutamate synthase from the hyperthermophitic archaeon Pyrococcus sp.KOD1" Mol.Gen.Genet.(印刷中). (1997)
Jongsa reejit, B. 等人:“来自超嗜热古菌火球菌 sp.KOD1 的谷氨酸合酶的基因克隆、测序和酶特性”Mol.Gen.Genet(出版中)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
FUJIWARA,S.et al: "Unusual enzyme characteristics of aspartyl-tRNA synthetase from hyperthermophilic archaeon Pyrococcus sp. KOD1" FEBS Lett.394. 66-70 (1996)
FUJIWARA,S.等人:“来自超嗜热古菌火球菌属 KOD1 的天冬氨酰-tRNA 合成酶的异常酶特征”FEBS Lett.394。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
今中忠行ら: "超好熱菌シャペロニンのin vivo及びin vitroでの効果" 化学と生物. 34・11. 707-709 (1996)
Tadayuki Imanaka 等人:“超嗜热伴侣蛋白的体内和体外效应”化学与生物学 34・11(1996)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
Tachibana,Y.et al.: "Cloning and expression of the α-amylase gene from hyperthermophilic archaeon Pyrococcus sp.KOD1 and characterization of the enzyme" J.Ferment.Bioeng.82・3. 224-232 (1996)
Tachibana, Y. 等人:“来自超嗜热古菌火球菌 sp.KOD1 的 α-淀粉酶基因的克隆和表达以及酶的表征”J.Ferment.Bioeng.82·3 (1996)。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 11 条
Functional mechanisms of branched chain polyamines in thermophiles
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批准号:21H02112
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$10.98万
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财政年份:2021
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负责人:藤原 伸介
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依托单位:
超好熱菌シャペロニンに関する基礎的研究及びそれを用いたタンパク質安定化システムの構築
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批准号:02F00204
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.09万
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财政年份:2002
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负责人:藤原 伸介
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依托单位:
超好熱菌の細胞分裂タンパク質に関する研究
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批准号:11750692
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1999
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负责人:藤原 伸介
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依托单位:
海外基金