超好熱菌シャペロニンに関する基礎的研究及びそれを用いたタンパク質安定化システムの構築
超好熱菌シャペロニンに関する基礎的研究及びそれを用いたタンパク質安定化システムの構築
批准号:
02F00204
负责人:
藤原 伸介
金额:
$1.09万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2002
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2002 至 2003
中文摘要
原始生命の低温適応は多様性獲得と密接な関係があったと考えられる。本研究では超好熱菌には低温で誘導される分子シャペロンが存在すると考え、生育限界下限の温度で培養したときに誘導されてくるタンパク質の中から分子シャペロンとしての機能をもつものの探索を試みた。超好熱菌にThermococcus kodakaraensisを用い、生育下限限界温度で発現するタンパク質について二次元電気泳動を利用したプロテオーム解析を行った。70℃で培養した細胞中には90℃で培養した時には見られないいくつかのタンパク質が見られた。このうち、発現の傾向が顕著なものを選び、アミノ酸配列分析を行ったところ、ひとつは分子シャペロニンのひとつCpkAであることが確認された。これまでの研究からCpkAは低温特異的な分子シャペロニンではないかと予想されていたが、今回の実験によりそのことが確かめられた。現在、この遺伝子を破壊したcpkA遺伝子欠損株の構築を行っている。CpkAのホモログを他の好熱性生物で調べたところ、生育温度が下がるに連れてゲノム上に複数のオルソログをパラロガスに有する傾向が見られる。例えばThermococcus kodakaraensisよりも生育温度が高い同じ目のPyrococcus属や同じEuryarchaeota門で生育温度の高いメタン菌Methanococcus jannashiiではいずれもオルソログはひとつしか存在しない。一方、同じ、Euryarchaeota門でも生育温度の低い菌は複数のCpkAホモログをパラロガスにもつ。これらは進化の過程でゲノム上で派生したパラログと考えられた。以上の知見はCpkAは超好熱菌が低温適応するために獲得した分子シャペロン(シャペロンニン)であったことを強く示唆する。
英文摘要
原始生命の低温適応は多様性獲得と密接な関係があったと考えられる。本研究では超好熱菌には低温で誘導される分子シャペロンが存在すると考え、生育限界下限の温度で培養したときに誘導されてくるタンパク質の中から分子シャペロンとしての機能をもつものの探索を試みた。超好熱菌にThermococcus kodakaraensisを用い、生育下限限界温度で発現するタンパク質について二次元電気泳動を利用したプロテオーム解析を行った。70℃で培養した細胞中には90℃で培養した時には見られないいくつかのタンパク質が見られた。このうち、発現の傾向が顕著なものを選び、アミノ酸配列分析を行ったところ、ひとつは分子シャペロニンのひとつCpkAであることが確認された。これまでの研究からCpkAは低温特異的な分子シャペロニンではないかと予想されていたが、今回の実験によりそのことが確かめられた。現在、この遺伝子を破壊したcpkA遺伝子欠損株の構築を行っている。CpkAのホモログを他の好熱性生物で調べたところ、生育温度が下がるに連れてゲノム上に複数のオルソログをパラロガスに有する傾向が見られる。例えばThermococcus kodakaraensisよりも生育温度が高い同じ目のPyrococcus属や同じEuryarchaeota門で生育温度の高いメタン菌Methanococcus jannashiiではいずれもオルソログはひとつしか存在しない。一方、同じ、Euryarchaeota門でも生育温度の低い菌は複数のCpkAホモログをパラロガスにもつ。これらは進化の過程でゲノム上で派生したパラログと考えられた。以上の知見はCpkAは超好熱菌が低温適応するために獲得した分子シャペロン(シャペロンニン)であったことを強く示唆する。
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Fujiwara, S: "Extremophiles : development of their special functions and potential resources"J. Biosci. Bioeng.. 94・6. 518-525 (2002)
藤原S:“极端微生物:其特殊功能和潜在资源的开发”J. Biosci. 94・6(2002)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
藤原伸介, 福崎英一郎: "特殊環境場での酵素反応・疎水環境,超臨界流体環境中での耐熱性酵素による反応"現代化学. 378. 14-20 (2002)
Shinsuke Fujiwara、Eiichiro Fukusaki:“特殊环境、疏水环境中的酶反应以及超临界流体环境中耐热酶的反应”Gendai Kagaku。 378. 14-20 (2002)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
Higashibata, H: "Surface histidine residue of archaeal histone affects DNA compaction and thermostability"FEMS Microbiol.Lett.. 224. 17-22 (2003)
Higashibata, H:“古菌组蛋白的表面组氨酸残基影响 DNA 压缩和热稳定性”FEMS Microbiol.Lett.. 224. 17-22 (2003)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
Kudou, M: "Prevention of thermal inactivation and aggregation of lysozyme by polyamines."Eur.J.Biochem.. 270・22. 4547-4554 (2003)
Kudou, M:“通过多胺防止溶菌酶的热失活和聚集”。Eur.J.Biochem.. 270・22(2003)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
Shiraki, K: "Genetic, Enzymatic, and Structual Analyses of Phenylalanyl-tRNA Synthetase from Thermococcus kodakaraensis KDD1"J.Biochem.. 134・4. 567-574 (2003)
Shiraki, K:“来自Thermococcus kodakaraensis KDD1 的苯丙氨酰-tRNA 合成酶的遗传、酶学和结构分析”J.Biochem.. 134・4 (2003)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
共 6 条
Functional mechanisms of branched chain polyamines in thermophiles
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批准号:21H02112
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$10.98万
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财政年份:2021
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负责人:藤原 伸介
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依托单位:
超好熱菌の細胞分裂タンパク質に関する研究
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批准号:11750692
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1999
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负责人:藤原 伸介
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依托单位:
超好熱菌におけるDNA再構成に関する研究
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批准号:08750928
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1996
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负责人:藤原 伸介
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依托单位:
海外基金