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キナーゼ基質網羅的同定とゲノム変異依存的リン酸化シグナル解析

激酶底物的全面鉴定和基因组突变依赖性磷酸化信号的分析

基本信息

批准号：
21J15068
负责人：
新苗智也
金额：
$ 0.96万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-28 至 2023-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21J15068/
关键词：
プロテオミクスキナーゼホスファターゼ

项目摘要

今年度は、新規キナーゼ基質網羅的同定法およびチロシンホスファターゼの包括的活性測定法の確立を目指した。新規キナーゼ基質網羅的同定法に関しては、近接依存性ビオチン標識、キナーゼ摂動リン酸化プロテオミクス、リン酸化モチーフ解析の3つのアプローチにより、CK2およびPKAの基質同定に成功した。また、同定された基質周辺でのがんに関連するアミノ酸変異の影響を評価し、発がん性変異がリン酸化シグナルに影響を与えうることを示した。チロシンホスファターゼの包括的活性測定法に関しては、チロシンホスファターゼ（PTP）と強く結合する非加水分解性のリン酸化チロシン模倣体（F2Pmp）を組み込んだペプチド型プローブに着目した。本研究では、配列を系統的にデザインした17種のF2Pmpペプチドプローブを合成した。これらプローブを用いることで、プローブ配列依存的にPTPと結合することを示したと共に、classical PTPの包括的濃縮を達成した。また、F2PmpプローブによるPTP濃縮の大規模情報を取得することにより、これまでは行えなかったPTPのpY基質指向性情報とF2PmpプローブによるPTP濃縮の相関の詳細な解析を可能とし、その相関を明らかにした。本研究により、F2Pmpプローブ配列の効率的な設計が可能になったと考えられる。さらに、本研究ではF2PmpプローブがPTP活性依存的にPTPと結合することを示し、本プローブを用いることにより、EGF刺激において、複数のPTPの活性が経時的に変動することを示した。これらの手法はリン酸化ネットワーク全体の理解に資する重要な基盤となると考えられる。

This year, the new method for determining the activity of the matrix includes the establishment of a method for determining the activity of the matrix. The new method of matrix identification of the matrix network is related to the proximity dependency of the matrix identification, the dynamic acidification, the acidification, the analysis of the matrix identification of the matrix, and the success of the CK2. The influence of different factors on the stability of the matrix is evaluated. The activity assay method for the determination of the activity of the compound includes the following steps: forming a non-hydrolytic compound (F2Pmp); In this study, 17 kinds of F2PMP were synthesized by using the same method. This is the first time I've ever seen a PTP. Detailed analysis of PTP concentration related to F2 PMP concentration is possible and relevant to obtaining large-scale information about PTP concentration. In this study, F2Pmp was designed to match the efficiency of the system. In this study, F2Pmp was stimulated by EGF, and PTP activity was dependent on PTP binding. This is an important basis for understanding all aspects of the process.