海洋保護区設置にむけた宝石サンゴ類の重要海域および再生産機構の解明

阐明建立海洋保护区的珍贵珊瑚的重要区域和繁殖机制

• 批准号: 22KJ1108
• 负责人: 高田 健司
• 金额: $ 2.18万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2023
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2023-03-08 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22KJ1108/
• 关键词: 宝石サンゴ; 八放サンゴ; 環境DNA; デジタPCR; メタゲノム解析; 分布推定; 生息環境推定; 海洋保護区

初年度は、宝石サンゴの生息域・生物量・生息環境を推定するために、宝石サンゴの飼育水槽から環境DNAを検出する実験と新たな海域での野外海水・環境データ(化学・物理データ)収集、生物データを取得するためのメタゲノム解析の設備準備や知識習得を行った。まずは、飼育実験下で採水した海水から宝石サンゴ由来の環境DNAを検出できるか検証するため、設計した宝石サンゴ特異的なプライマーとプローブを用いたデジタルPCRによる絶対定量を行った。その結果、宝石サンゴ由来の環境DNAを検出できただけでなく、サンゴの群体数が増えれば、環境DNAの量も比例して増えることを確認した。また、昨年度に引き続き、日本国内の宝石サンゴの生息域と思われる海域でROV調査およびCTDによる海水採取を行い、今年度は奄美諸島から九州西部にかけて、40地点から生物統計モデルに必要な環境データ(化学・物理データ)を、11地点から野外の海水サンプルを入手した。採取した海水はフィルターでろ過し、昨年度と来年度の調査サンプルと次年度に合わせて解析するため、長期保存できるように固定した。環境データのうち生物データに関しては、次年度に行う18S領域を用いたメタゲノム解析に向けて、実験試薬・備品の整備や解析パイプラインの学習をおこなった。設備準備や知識習得を踏まえて、次年度に向けた実験計画の見直しを行った。初年度における研究活動中の研究成果公表ついては、第一著者として国際学会で口頭発表を1つ行った。

Early annual は, gem サ ン ゴ の interest-bearing domain, biomass, habitats を presumption す る た め に, gem サ ン ゴ の rearing tank か ら environmental DNA を 検 out す る be 験 と new た な waters で の field, water environment, デ ー タ (chemical, physical デ ー タ) 収 set, biological デ ー タ を obtain す る た め の メ タ ゲ ノ ム parsing の equipment for line を っ や knowledge acquisition Youdaoplaceholder0. ま ず は, rearing be 験 で mining water し た seawater か ら gem サ ン ゴ origin の environmental DNA を 検 out で き る か 検 card す る た め, design し た gem サ ン ゴ specific な プ ラ イ マ ー と プ ロ ー ブ を with い た デ ジ タ ル PCR に よ る off line quantitative を seaborne っ た. そ の results, gem サ ン ゴ origin の environmental DNA を 検 out で き た だ け で な く, サ ン ゴ の group number が raised え れ ば proportion, environmental DNA の も し て raised え る こ と を confirm し た. ま た, yesterday's annual に き 続 き, Japan's domestic の gem サ ン ゴ の interest-bearing domain と think わ れ る waters で ROV survey お よ び CTD に よ る water take を い, our は I beautiful islands か ら western kyushu に か け て, 40 locations か ら biometric モ デ ル に な environment necessary デ ー タ (chemical, physical デ ー タ) を, 11 locations か ら の wild waters Youdaoplaceholder0 プ プ を を を get サ た. Take し た seawater は フ ィ ル タ ー で annual と ろ し, yesterday to annual の investigation サ ン プ ル と annual に close わ せ て parsing す る た め, long-term preservation で き る よ う に fixed し た. Environmental デ ー タ の う ち biological デ ー タ に masato し て は, annual に を う 18 s field use い た メ タ ゲ ノ ム parsing に to け て, be, try 験 薬 gearing up spare の や, parsing パ イ プ ラ イ ン の learning を お こ な っ た. Equipment preparation や knowledge acquisition を step まえて the following year に towards the けた practical project plan see the direct を を field った. In the initial year of the における research activities, the public presentation of the <s:1> research results て て て, the first author と <s:1> て, and the oral presentation of the first author to the international society で を.

项目成果

Population genetic analysis for deep-sea corals and reef-building corals in Japan using genome-wide SNP data

使用全基因组 SNP 数据对日本深海珊瑚和造礁珊瑚进行种群遗传分析

• 发表时间: 2022
• 作者: Yuta Fujisawa;Pier-luc Champagne;Yoshimitsu Itoh;Takuzo Aida;Kenji Takata
• 通讯作者: Kenji Takata

Hidden linegaes and potential deep to shallow connectivity of the brooding coral, Seriatopora hystrix

孵化珊瑚（Seriatopora hystrix）的隐藏线系和潜在的深浅连接

• 发表时间: 2022
• 作者: Yuta Fujisawa;Yiling Nan;Atsushi Asano;Yu Yanagisawa;Keiichi Yano;Yoshimitsu Itoh;Takuzo Aida;Kenji Takata
• 通讯作者: Kenji Takata