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Analysis of miRNA polygenic network on hybrid sterility locus by novel forward genetics

通过新型正向遗传学分析杂交不育位点上的 miRNA 多基因网络

基本信息

批准号：
22KJ0365
负责人：
森本健斗
金额：
$ 1.98万
依托单位：
University of Tsukuba
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2023
资助国家：
日本
起止时间：
2023-03-08 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究は、精子形成に必須のmiRNA(以後、C1-XmiRs)の特定とその制御メカニズムの解明を目指し、特定の染色体領域だけに二つ以上のIndel変異やStructural Variantsを同時的かつランダムに導入する新規手法を開発している。C1-XmiRsが存在するゲノム領域にランダムに変異を誘導するため、これまでに各C1-XmiRゲノム領域を標的とするsgRNAを発現する合計17種のドナーベクターを、ランダムな組み合わせで染色体に導入したES細胞を作製した。続けて、このES細胞にCas9ベクターをトランスフェクションし、C1-XmiRsゲノム領域に変異を誘導した単一細胞由来のESクローンをこれまでに87クローン得た。ドナーベクターライブラリーの導入効率および導入されたsgRNAの組合せを確認するために、これら87のESクローンにおいて多検体次世代シークエンス解析を行い、1～16種類(平均4.7種類)のsgRNAベクターが導入されていることが明らかになった。続いて、導入されたsgRNAとCas9によってIndel変異やStructural Variantsを導入できたか確認したところ、25～93％の標的C1-XmiRゲノム領域でIndel変異やStructural Variantsが導入されていることが確認できた。また、これらの変異は導入されたsgRNAの組み合わせから期待される変異と一致していた。以上の結果は、本手法が特定の染色体領域に多種多様な変異を同時的かつランダムに導入したことを明確に示す。精子形成に必須のC1-XmiRsの特定とその制御メカニズムの解明するため、これらのC1-XmiRsランダム変異をF0世代で迅速に解析できるキメラマウス作出法を確立した。現在、C1-XmiRsランダム変異ESクローンからキメラマウスを発生させ、順次表現型比較解析を実施している。

In this study, the specificity of miRNA (hereinafter, C1-XmiRs) necessary for sperm formation, the specificity of the specific chromosomal domain, the specificity of the specific chromosomal domain, and the specificity of the specific chromosomal domain are analyzed. Variants かつランダムに introduced new rules at the same time かつランダムるを开発している. C1-XmiRs are present in the field and are different in the field of C1-XmiRs. A total of 17 types of sgRNA are now available, including 17 kinds of sgRNA and ランダムなgroup combinations, and the chromosomes are introduced into ES cells and are produced. C1-XmiRs The field of ゲノムに変differentをinducedした単一cell originのESクローンをこれまでに87クローンgetた.ドナーベクターライブラリーの Import efficiency および Import されたsgRN Aのcombinationせをconfirmationするために、これら87のESクローンにおいて多検body next generation シークエンスanalytic を行い, 1~16 types (average 4.7 types) sgRNA ベクターが imported されていることが明らかになった. Structural Variantsできたかconfirmationしたところ、25～93%のtarget C1-XmiRゲノムfieldでIndel変differentやStructural Variantsがimportされていることがconfirmできた.また、これらの変different は Import されたsgRNAのgroup み合わせからLooking forward to される変different と consistence していた. As a result of the above, this method clearly demonstrates the simultaneous introduction of various polymorphisms in a specific chromosome field. C1-XmiRs are necessary for sperm formation and are specific and controlled. 1-XmiRsランダム変differentをF0 generationで Rapid analysisできるキメラマウス法をEstablishmentした. Now, C1-XmiRs ランダム変different ESクローンからキメラマウスを発生させ, sequential phenotype comparative analysis を実士している.