Discovering novel genetic alterations in highly complicated genetic regions of pediatric brain tumors

在儿科脑肿瘤高度复杂的遗传区域中发现新的遗传改变

• 批准号: 22K19591
• 负责人: 鈴木 啓道
• 金额: $ 4.16万
• 依托单位: National Cancer Center Japan
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-06-30 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K19591/
• 关键词: 脳腫瘍; 遺伝子変異; 全ゲノムシークエンス; 変異解析

本研究課題では、解析が十分に行われていない繰り返し領域や相同性の高い領域を解析する手法を確立し、ドライバー遺伝子異常が未だ同定されていない小児悪性脳腫瘍を解析対象とし、原因遺伝子変異を同定することを目的として研究を進めている。Group 4髄芽腫において、新規の遺伝子異常を同定した。Group 4髄芽腫は発達段階にある胎児脳の菱脳唇脳室下帯に存在する神経前駆細胞が起源細胞と考えられ、CBFA2T2・CBFA2T3・PRDM6・KDM6Aを含んだCBFA複合体に異常が生じることで発生していることを明らかにした。CBFA複合体に異常が生じることで、神経前駆細胞は正常な分化が阻害され、正常な神経細胞に分化できなくなる。神経前駆細胞は出生時には神経に分化して消失していなければならないが、分化異常のため出生後も遺残することにより髄芽腫の発生母地となることを明らかにした。解析困難領域の解析手法を整えており、寛容なマッピングを用いた解析困難領域の解析を対象疾患計501例に対して行った。さらに精度をあげるために、フィルタリングの改良などを行う予定である。また、ショートタンデムリピートの解析も進んでおり、対象疾患約400例の解析に対して解析を行った。現在のところ、疾患特異的である有意な異常伸長は同定されていない。引き続き解析を進めていく。また、既知のショートタンデムリピートとトランスポソンによる転移因子を解析するアルゴリズムの導入を行い、今後解析を進めていく。

The subject of this research is the same as the field of similarity and the method of analysis and technique has been established. The abnormality is not the same as the determination of the cause of the disease. Group 4: The buds are swollen and the new rules are abnormal. Group 4. The presence of swollen buds in the lower part of the labial cavity, the origin of the cells in the prenatal period, and the presence of CBFA2T2・C BFA2T3・PRDM6・KDM6A contains the abnormality of the CBFA complex. The CBFA complex causes abnormal growth, prevents the normal differentiation of pre-neuronal cells, and prevents the differentiation of normal neuronal cells. The prenatal cells of the God's body are not differentiated at the time of birth, and they disappear and are differentiated differently. After Chang's birth, he was born in the mother's place of birth. Analytical techniques for analyzing difficult areas are を正えており, and 寛対なマッピングを用いたanalyzing difficult areas is a 501-case disease plan に対して行った.さらに precision をあげるために、フィルタリングの Improved などを行う Predetermined である.また, ショートタンデムリピートのanalytic も入んでおり, のanalytic に対してanalytic を行った about 400 cases of elephant disease. Now it's a disease-specific disease-specific disease-specific disease-specific abnormal elongation. Hingき続きanalyticsをjinめていく.また、known as the のショートタンデムリピートとトランスポソンによる転movable Factor を analysis す る ア ル ゴ リ ズ ム の import を row い, future analysis を advance め て い く.

项目成果

Whole genome multi-omics landscape of Oligodenderoglioma, IDH-mutant and 1p/19q-codeleted

少突神经胶质瘤、IDH 突变和 1p/19q 编码缺失的全基因组多组学景观

• 发表时间: 2022
• 作者: Yusuke Funakoshi;Takuma Nakashima;Shohei Nambu;Atsuhito Uneda;Kotoe Katayama;Seiya Imoto;Ryosuke Hanaya;Shota Tanaka,Ryuta Saito;Koji Yoshimoto;Yoshitaka Narita;Hiromichi Suzuki
• 通讯作者: Hiromichi Suzuki

脳腫瘍診断に対する遺伝子検査

脑肿瘤诊断的基因检测

• 发表时间: 2022
• 作者: Yusuke Funakoshi;Takuma Nakashima;Shohei Nambu;Atsuhito Uneda;Kotoe Katayama;Seiya Imoto;Ryosuke Hanaya;Shota Tanaka,Ryuta Saito;Koji Yoshimoto;Yoshitaka Narita;Hiromichi Suzuki;Hiromichi Suzuki;Hiromichi Suzuki;Hiromichi Suzuki;Hiromichi Suzuki
• 通讯作者: Hiromichi Suzuki

髄芽腫における新規遺伝子変異と起源細胞の同定

髓母细胞瘤新基因突变和细胞起源的鉴定

• 发表时间: 2022
• 作者: Yusuke Funakoshi;Takuma Nakashima;Shohei Nambu;Atsuhito Uneda;Kotoe Katayama;Seiya Imoto;Ryosuke Hanaya;Shota Tanaka,Ryuta Saito;Koji Yoshimoto;Yoshitaka Narita;Hiromichi Suzuki;Hiromichi Suzuki;Hiromichi Suzuki;Hiromichi Suzuki
• 通讯作者: Hiromichi Suzuki

Whole-genome sequencing and comprehensive molecular profiling of Astrocytoma, IDH-mutant

IDH 突变型星形细胞瘤的全基因组测序和全面分子分析

• 发表时间: 2022
• 作者: Yusuke Funakoshi;Takuma Nakashima;Shohei Nambu;Atsuhito Uneda;Kotoe Katayama;Seiya Imoto;Ryosuke Hanaya;Shota Tanaka,Ryuta Saito;Koji Yoshimoto;Yoshitaka Narita;Hiromichi Suzuki
• 通讯作者: Hiromichi Suzuki

全ゲノムシークエンスによるIDH変異型diffuse gliomaの変異・構造異常解析

使用全基因组测序分析 IDH 突变弥漫性神经胶质瘤的突变和结构异常

• 发表时间: 2022
• 作者: 舟越勇介;中島拓真;畝田篤仁;南部翔平;田中將太;石田穣治;齋藤竜太;花谷亮典;吉本幸司;成田善孝;鈴木啓道
• 通讯作者: 鈴木啓道