ニューロンの多階層エピジェネティクス情報の潜在変数モデルによる記憶の解明

使用神经元多级表观遗传信息的潜在变量模型阐明记忆

• 批准号: 22K19823
• 负责人: 岸 雄介
• 金额: $ 4.16万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-06-30 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K19823/
• 关键词: エピゲノム; ニューロン; 老化; テンソル分解; エピジェネティクス; 潜在変数モデル

ニューロンの老化におけるエピゲノム変化を調べるために2ヶ月齢と2年齢以上のマウスを用意し、大脳皮質と海馬を回収した。そして、NeuN陽性のニューロン核を単離し、RNA-seq、ATAC-seqとCUT&Tagにて9種類のエピゲノム修飾を調べた。このエピゲノム情報を用いて、分担者のの水野忠快先生との共同研究によりATACとCUT&Tagの10種類の統合的解析を実施した。その結果、海馬の若齢・老齢ニューロンは遺伝子発現では区別できないが、エピゲノム情報により区別できることがわかった。この結果は、まさに本研究が目指す多階層エピゲノム情報からニューロンや個体の状態ができるということを示唆している。

2 years old, 2 years old, 2 years 9 kinds of DNA modification including RNA, ATAC-seq and CUT&Tag The analysis of 10 kinds of integration of ATAC and CUT&Tag was carried out by Mr. Mizuno, the co-author of this paper. The result of the study is that the hippocampus has been identified by the information provided. The results of this study indicate that multi-level information and individual status can be displayed.

项目成果

Nuclear morphology of cortical excitatory neurons is regulated by visual experience and aging

皮质兴奋性神经元的核形态受视觉体验和衰老的调节

• 发表时间: 2022
• 作者: Tanita M. Frey;Tomonari Murakami;Kenichi Ohki;Yukiko Gotoh;Yusuke Kishi
• 通讯作者: Yusuke Kishi

Age-associated reduction of nuclear shape dynamics in excitatory neurons of the visual cortex

视觉皮层兴奋性神经元核形状动力学与年龄相关的减少

• DOI: 10.1101/2022.08.22.504704
• 发表时间: 2022
• 期刊: bioRxiv
• 作者: Tanita Frey;Tomonari Murakami;Koichiro Maki;Takumi Kawaue;Ayaka Sugai;Naotaka Nakazawa;Taiji Adachi;Mineko Kengaku;Kenichi Ohki;Yukiko Gotoh;Yusuke Kishi
• 通讯作者: Yusuke Kishi

ニューロン老化におけるエピゲノムの役割の解明

阐明表观基因组在神经元衰老中的作用

• 发表时间: 2022
• 作者: 岸雄介;佐伯麻衣;Merve Bilgic;後藤由季子
• 通讯作者: 後藤由季子

Dynamic changes in the chromatin and nuclear state during neuronal differentiation ニューロン分化過程におけるクロマチンと核の変化

神经元分化过程中染色质和核状态的动态变化

• 发表时间: 2022
• 作者: 岸雄介;佐伯麻衣;後藤由季子
• 通讯作者: 後藤由季子