子嚢菌門の糸状菌に保存された生殖期特異的ウイルス除去機構を担う因子群の同定

子囊菌门丝状真菌中负责生殖阶段特异性病毒清除机制的一组因素的鉴定

基本信息

  • 批准号:
    22K19144
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 4.16万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
  • 财政年份:
    2022
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2022-06-30 至 2025-03-31
  • 项目状态:
    未结题

项目摘要

アカパンカビはモデル生物としてショウジョウバエに次ぐ古い歴史を持つのにも関わらず、研究代表者らの報告までアカパンカビに感染する菌類ウイルスの発見に至らなかった(Honda et al, Nature comm, 2020)。この長い未発見の理由の一つに、糸状菌アカパンカビの生殖期にウイルスを除去する未解明な分子機構が挙げられる。本研究では、この特殊な分子機構を分子レベルに紐解くことを目的とする。研究代表者の先行研究により、ウイルス除去機構を担う因子群は生殖期のみに発現していることが示唆されている。そこで、ウイルス感染させた正常株の無性・有性生活環時のRNA-seq解析を行い、上記の条件に一致する因子群候補の抽出を行った。その結果、ウイルス感染で発現が変動する遺伝子のほぼすべてが無性・有性生活環で一致した。免疫を過剰に応答にすることを防ぐ新規遺伝子ZAO-1を欠損させると、生殖期特異的なウイルス除去機構が部分的に機能しなくなることを見出している。そこで上記同様にRNA-seq解析を行ったところ、この欠損株では、遺伝子全体で3割近くの発現が大きく変動することがわかった。これらの解析結果から、当初の計画ではウイルス除去機構を担う因子群を抽出することが困難であることが判明したため、新たな実験系を構築し、ウイルス除去機構を担う因子群の抽出・同定を目指すことにする。
The report of the representative of the study on the occurrence of fungal infection in the laboratory was published in Honda et al, Nature comm, 2020. The reason why this has not been discovered for a long time is that the reproductive period of the bacteria is not clear. The molecular mechanism is not clear. This study is aimed at solving the problems of molecular mechanism. The research representative's previous research was conducted to eliminate the mechanism of factor group and the development of reproductive period. RNA-seq analysis of asexual and sexual life cycles of normal plants and extraction of candidate factor groups under the conditions described above As a result, the infection appears to be active, and the virus is not active. The immune response is to prevent damage to the new gene ZAO-1, and to remove some of the mechanisms specific to reproductive stages. The same RNA-seq analysis was carried out on all three segments of the genome. The analysis results show that the original plan is to remove the mechanism and extract the new mechanism.

项目成果

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科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
モデル生物アカパンカビを用いた植物病原糸状菌とウイルスの相互作用の包括的解析
利用模式生物粗糙脉孢菌综合分析植物病原真菌与病毒之间的相互作用
  • DOI:
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Negishi T;Kitagawa S;Horii N;Tanaka Y;Haruta N;Sugimoto A;Sawa H;Hayashi KI;Harata M;Kanemaki MT.;本田 信治
  • 通讯作者:
    本田 信治
非ドメイン型バイオポリマーを介した菌類ウイルス・宿主間の特殊な共生関係
非结构域型生物聚合物介导的真菌病毒与宿主之间的特殊共生关系
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Ou Fu;Yasuhiko Minokoshi;Ken-Ichiro Nakajima;本田 信治
  • 通讯作者:
    本田 信治
RNA Editing of Genomic Neighbors Controls Antiviral Response in Fungi
邻近基因组的 RNA 编辑控制真菌的抗病毒反应
  • DOI:
    10.2139/ssrn.4425943
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Honda Shinji;Yokoyama Ayumi;Suzuki Nobuhiro
  • 通讯作者:
    Suzuki Nobuhiro
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  • 通讯作者:
    本田 信治

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