プライマー分析による新しいDNA多型検出法の開発

利用引物分析开发新的 DNA 多态性检测方法

• 批准号: 09557036
• 负责人: 梅津 和夫
• 金额: $ 7.81万
• 依托单位: Yamagata University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 1997
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1997 至 1998
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-09557036/
• 关键词: CASPA; 型特異的プライマー; 塩基置換; PCR; SNP; CASPA法; PCR法; プライマー法

PCR法は僅かの期間に高度の発展を遂げ,個人識別や病気の診断などの多くの分野で必須の判定法の一つとなった。最近、特に単一ヌクレオチド多型(SNP)が多方面から注目され、この目的のためにも多様な検出法が開発されている。今回われわれは、これまで誰からも注目されていなかった「残つたプライマーを分析することでSNPを判定する新しい方法」に挑戦した。その結果、本法はSNPの有力な判定法の一つになることが判明したので、このプライマー分析法を、CASPA法(consumed allele-specific primer analysis)と命名。CASPA法の原理はPCRにおいて消費された蛍光標識の型特異的プライマーをDNAシ―ケンサ310で定量するものである。つまり、ある型特異的なプライマーが減少すればこのプライマーに対応する部位に塩基置換が存在することを意味している。本法の利点は蛍光色素を用いているので高感度なこと、PCR産物を検出する方法でないので近接する塩基置換部位に多数のプライマーを同時に設定できること、分解の高度なDNAにも対応できる事などを挙げる事が出来る。今後は、SNPの分析の一方法としてCASPA法が広く活用されることを期待する。

PCR is a method for identifying individuals and identifying the severity of disease. Recently, the development of a new method of multiple-target detection has been introduced. This time, we are challenged by the "new method for SNP determination through analysis of residual information". The results of this method are as follows: 1. The strong determination method of SNP is named CASPA (consumed allele-specific primer analysis). The principle of CASPA is that PCR is used to detect the presence of fluorescent markers and type-specific DNA markers. There is a strong sense of substitution at the site of a type-specific mutation. The method has the advantages of high sensitivity and PCR product detection, and high sensitivity and PCR product detection. In the future, a method for SNP analysis is expected to be widely used.

项目成果

Watanabe,G.et al: "ABO blood group genotyping by allele-specific primer Analysis(CASPA)method" Legal medicine and forensic sciences. 6. 591-594 (1999)

Watanabe，G.et al：“通过等位基因特异性引物分析（CASPA）方法进行ABO血型基因分型”法律医学和法医学。

"TH01型の簡易判定法について" 日本法医学雑誌. 51(6). 433-437 (1997)

“关于TH01型的简单测定方法”日本法医学杂志51(6)433-437(1997)。

Watanabe, G., Umetsu, K. et al: "ABO blood group genotyping consumed allele-specific primer analysis (CASPA) method"Legal Medicine and Forensic Sciences. 6. 591-594 (1998)

Watanabe，G.，Umetsu，K.等：“ABO血型基因分型消耗等位基因特异性引物分析（CASPA）方法”法律医学和法医学。