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NIGMS Administrative Supplements to Support Undergraduate Summer Research

NIGMS Administrative Supplements to Support Undergraduate Summer Research
NIGMS 支持本科生暑期研究的行政补充
批准号:
10393964
负责人:
MARK BORODOVSKY
金额:
$0.53万
依托单位国家:
美国
项目类别:
财政年份:
2018
资助国家:
美国
项目状态:
已结题
起止时间:
2018-09-01 至 2023-06-30

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
父母补助金行政补充R 01 GM 128145 解决计算基因组注释的开放性挑战 PI Mark Borodovsky 摘要 提高真核基因组中的基因发现是亲本的一个大而重要的组成部分 提议与安德烈Zaznaev,格鲁吉亚技术院长的名单大三学生,谁是非常 有兴趣在计算生物学方面做出贡献,我们将致力于其他目标, 该提案-开发一种改进的真核基因组基因预测算法 其特点是其复杂性-基因组GC的长程和短程不均匀性 混合物.本科生将创建用于生成GC库的工具- 每个基因组中蛋白质编码区的依赖模型。他还将开发一个扩展 基因发现算法的一部分,它将能够使用新的模型。
英文摘要
Administrative Supplement to Parent Grant R01 GM128145 Addressing Open Challenges of Computational Genome Annotation PI Mark Borodovsky Abstract Improving gene finding in eukaryotic genomes is a large and important part of the parent proposal. With Andrey Zaznaev, the Georgia Tech Deans’s list junior student, who is very interested in making contribution in computational biology, we will work on additional aim of the proposal – developing an improved algorithm for gene prediction in eukaryotic genomes that are distinguished by their complexity - long- and short-range inhomogeneity of genome GC composition. The undergraduate student will create tools for generating a library of GC- dependent models of protein-coding regions in each genome. He also will develop an extension of the gene finding algorithm that will be able to use the new models.
期刊论文(9)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI: 10.3389/fbinf.2021.704157
发表时间: 2021
期刊: FRONTIERS IN BIOINFORMATICS
影响因子: --
作者: [Gemayel, Karl, Lomsadze, Alexandre, Borodovsky, Mark]
通讯作者: Borodovsky, Mark
DOI: 10.1186/s12859-021-04482-0
发表时间: 2021-11-25
期刊: BMC bioinformatics
影响因子: 3
作者: [Gabriel L, Hoff KJ, Brůna T, Borodovsky M, Stanke M]
通讯作者: Stanke M
DOI: 10.1093/jhered/esad054
发表时间: 2023-10-27
期刊: JOURNAL OF HEREDITY
影响因子: 3.1
作者: [Schiebelhut,Lauren M., DeBiasse,Melissa B., Dawson,Michael N.]
通讯作者: Dawson,Michael N.
VARUS: sampling complementary RNA reads from the sequence read archive.
VARUS:从序列读取存档中采样互补 RNA 读取。
DOI: 10.1186/s12859-019-3182-x
发表时间: 2019
期刊: BMC bioinformatics
影响因子: 3
作者: [Stanke,Mario, Bruhn,Willy, Becker,Felix, Hoff,KatharinaJ]
通讯作者: Hoff,KatharinaJ
Addressing Open Challenges of Computational Genome Annotation
  • 批准号:
    9975182
  • 项目类别:
  • 资助金额:
    $34.24万
  • 财政年份:
    2018
  • 负责人:
    MARK BORODOVSKY
  • 依托单位:
Addressing Open Challenges of Computational Genome Annotation
  • 批准号:
    9761554
  • 项目类别:
  • 资助金额:
    $34.41万
  • 财政年份:
    2018
  • 负责人:
    MARK BORODOVSKY
  • 依托单位:
Improving Accuracy of Gene Prediction Programs of the G*
  • 批准号:
    6581987
  • 项目类别:
  • 资助金额:
    $4.69万
  • 财政年份:
    2002
  • 负责人:
    MARK BORODOVSKY
  • 依托单位:
Improving Accuracy of Gene Prediction Programs of the G*
  • 批准号:
    6686405
  • 项目类别:
  • 资助金额:
    $3.45万
  • 财政年份:
    2002
  • 负责人:
    MARK BORODOVSKY
  • 依托单位:
海外基金