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Structure determination of the 7-helix transmembrane protein receptor pSRII by solution NMR

通过溶液 NMR 测定 7 螺旋跨膜蛋白受体 pSRII 的结构

基本信息

批准号：
BB/G011915/1
负责人：
Daniel Nietlispach
金额：
$ 47.97万
依托单位：
University of Cambridge
依托单位国家：
英国
项目类别：
Research Grant
财政年份：
2009
资助国家：
英国
起止时间：
2009 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://gtr.ukri.org/projects?ref=BB%2FG011915%2F1
关键词：
Structure determination helix transmembrane protein

项目摘要

Most living organisms are assembled from a very large number of cells. Each of these cells is a specialist that contributes through a large number of activities to the support of an organism. Cells are composed mostly of a liquid interior that accommodates the precious machinery including the building blocks of life and all the information to produce proteins. A water insoluble protective lipid layer called a membrane surrounds the cell. To function properly and also when necessary to adjust the interior workings of the cell to changing external demands the cell needs to be continuously supplemented with nutrients and instructions that come from the outside. To help with this, a large number of molecules, called membrane proteins such as e.g. ligand receptors are embedded in the lipid layer, where they span the membrane. They are the liaison centres of the cell and communicate between interior and exterior worlds to shuttle information and material across the cell-interface. Their involvement in so many complex information transfer processes and their implication in a large number of diseases have made them prime targets for the majority of existing drugs on the market. Biologists and chemists study the properties of such molecules in order to better understand the cellular and biomolecular processes. One important aspect is to understand the three-dimensional organization of these molecules. While this can be obtained quite routinely and with great success for water-soluble molecules, it is much more difficult to achieve for membrane embedded proteins using the traditional structure determination techniques of X-ray crystallography and nuclear magnetic resonance (NMR). Consequently structure determination of insoluble membrane proteins is still in its early stages. Our proposal aims at the development of the NMR technique to solve the structure of such membrane proteins. We concentrate our studies on a particular member, for us a model system that belongs to a family of proteins with many analogies to receptors. The latter have proven particularly evasive to structural studies so far and our research efforts will improve this situation.

大多数生物体都是由大量的细胞组成的。这些细胞中的每一个都是专家，通过大量的活动来支持有机体。细胞主要由液体内部组成，容纳了宝贵的机器，包括生命的构建模块和生产蛋白质的所有信息。一层不溶于水的保护性脂质层，称为细胞膜，包围着细胞。为了正常运作，以及在必要时调整细胞的内部工作以适应不断变化的外部需求，细胞需要不断补充来自外部的营养和指令。为了帮助这一点，大量的分子，称为膜蛋白，例如配体受体嵌入脂质层中，在那里它们跨越膜。它们是细胞的联络中心，在内部和外部世界之间进行沟通，在细胞界面上穿梭信息和物质。它们参与了如此多复杂的信息传递过程，并在大量疾病中发挥作用，这使它们成为市场上大多数现有药物的主要目标。生物学家和化学家研究这些分子的性质，以便更好地理解细胞和生物分子过程。一个重要的方面是了解这些分子的三维结构。虽然这可以很常规地获得并且对于水溶性分子具有很大的成功，但是对于膜包埋的蛋白质，使用X射线晶体学和核磁共振（NMR）的传统结构测定技术来实现要困难得多。因此，不溶性膜蛋白的结构测定仍处于早期阶段。我们的建议旨在发展核磁共振技术，以解决这种膜蛋白的结构。我们将研究集中在一个特定的成员上，对我们来说，这是一个模型系统，它属于一个蛋白质家族，与受体有许多相似之处。到目前为止，后者已被证明特别回避结构研究，我们的研究工作将改善这种情况。

项目成果

期刊论文数量（10）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Recent Developments in Biomolecular NMR

生物分子核磁共振的最新进展

DOI：
10.1039/9781849735391-00271
发表时间：
2012
期刊：
影响因子：
0
作者：
Bostock M
通讯作者：
Bostock M

Structure determination of the seven-helix transmembrane receptor sensory rhodopsin II by solution NMR spectroscopy.

DOI：
10.1038/nsmb.1807
发表时间：
2010-06
期刊：
Nature structural & molecular biology
影响因子：
16.8
作者：
通讯作者：

A generalized approach for NMR studies of lipid-protein interactions based on sparse fluorination of acyl chains

基于酰基链稀疏氟化的脂质-蛋白质相互作用的核磁共振研究通用方法

DOI：
10.1039/c8cc02483a
发表时间：
2018
期刊：
Chemical Communications
影响因子：
4.9
作者：
De Biasio A
通讯作者：
De Biasio A

A generalized approach for NMR studies of lipid-protein interactions based on sparse fluorination of acyl chains.

基于酰基链稀疏氟化的脂质-蛋白质相互作用的核磁共振研究通用方法。

DOI：
10.17863/cam.36348
发表时间：
2018
期刊：
影响因子：
0
作者：
De Biasio A
通讯作者：
De Biasio A

Solution NMR studies of integral polytopic a-helical membrane proteins: the structure determination of the seven-helix transmembrane receptor sensory rhodopsin II, pSRII.

整体多面α螺旋膜蛋白的溶液核磁共振研究：七螺旋跨膜受体感觉视紫红质II，pSRII的结构测定。

DOI：
10.1007/978-1-62703-023-6_3
发表时间：
2012
期刊：
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
影响因子：
0
作者：
Gautier A
通讯作者：
Gautier A

DOI：
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Yutaka Ito

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Masahiro Shirakawa and Yutaka Ito

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Journal of Biomolecular NMR 28・2
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Masayoshi Honda;Sundaresan Rajesh;Daniel Nietlispach;Tsutomu Mikawa;Takehiko Shibata;Yutaka Ito
通讯作者：
Yutaka Ito