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Strategic Alliance Funding: MRC Weatherall Institute of Molecular Medicine (WIMM) at the University of Oxford 22-27

战略联盟资助：牛津大学 MRC Weatherall 分子医学研究所 (WIMM) 22-27

基本信息

批准号：
MC_UU_00021/2
负责人：
金额：
$ 191.73万
依托单位：
University of Oxford
依托单位国家：
英国
项目类别：
Intramural
财政年份：
2022
资助国家：
英国
起止时间：
2022 至无数据
项目状态：
未结题

来源：
https://gtr.ukri.org/projects?ref=MC_UU_00021%2F2
关键词：
Strategic Alliance Funding MRC Weatherall

项目摘要

Modern biomedical research is driven by advanced technologies, the generation of massive multidimensional datasets and advanced computational analysis is critical for their use. Similarly, research institutes must be able to adopt cutting-edge experimental approaches, such as single cell technologies. However, the huge complexity of these data puts even more pressure on computational biology and machine learning approaches.In this proposal we laid out our strategic plan to redevelop and focus the computational infrastructure of the WIMM to meet these challenges. To build on existing expertise, to centralise and build synergy between these expert groups. We have made key hires, from diverse fields such as mathematics and computer science, with such expertise. We are developing critical computational talent, by promoting and mentoring young computational scientists from the WIMM. A critical goal for us is to expand and democratise these skills in the WIMM, through new training programmes, in particular with students. We have now completely modernised our High Performance Cluster in both speed and capacity and instituted a sustainable charging business model for long term stability.

现代生物医学研究是由先进技术驱动的，大量多维数据集的生成和先进的计算分析对它们的使用至关重要。同样，研究机构必须能够采用尖端的实验方法，如单细胞技术。然而，这些数据的巨大复杂性给计算生物学和机器学习方法带来了更大的压力。在这个提案中，我们提出了我们的战略计划，重新开发和关注WIMM的计算基础设施，以应对这些挑战。在现有专业知识的基础上，集中这些专家组的力量，并在这些专家组之间建立协同作用。我们从数学和计算机科学等不同领域招聘了具有此类专业知识的关键人才。我们正在通过促进和指导来自WIMM的年轻计算科学家来培养关键的计算人才。我们的一个关键目标是通过新的培训项目，特别是针对学生的培训项目，在WIMM中推广和普及这些技能。我们现在已经在速度和容量方面完全实现了高性能集群的现代化，并建立了可持续的收费业务模式，以实现长期稳定。

项目成果

期刊论文数量（10）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

C16orf72/HAPSTR1/TAPR1 functions with BRCA1/Senataxin to modulate replication-associated R-loops and confer resistance to PARP disruption.

DOI：
10.1038/s41467-023-40779-9
发表时间：
2023-08-17
期刊：
NATURE COMMUNICATIONS
影响因子：
16.6
作者：
Sharma, Abhishek Bharadwaj;Ramlee, Muhammad Khairul;Kosmin, Joel;Higgs, Martin R.;Wolstenholme, Amy;Ronson, George E.;Jones, Dylan;Ebner, Daniel;Shamkhi, Noor;Sims, David;Wijnhoven, Paul W. G.;Forment, Josep;Gibbs-Seymour, Ian;Lakin, Nicholas D.
通讯作者：
Lakin, Nicholas D.

Single-cell analysis of signalling and transcriptional responses to type I interferons

I 型干扰素信号传导和转录反应的单细胞分析

DOI：
10.1101/2023.07.03.547491
发表时间：
2023
期刊：
影响因子：
0
作者：
Rigby R
通讯作者：
Rigby R

Intelectin-1 binds and alters the localization of the mucus barrier-modifying bacterium Akkermansia muciniphila.

DOI：
10.1084/jem.20211938
发表时间：
2023-01-02
期刊：
The Journal of experimental medicine
影响因子：
0
作者：
通讯作者：

Integration of single-cell RNA-Seq and CyTOF data characterises heterogeneity of rare cell subpopulations

DOI：
10.12688/f1000research.121829.1
发表时间：
2022-05
期刊：
F1000Research
影响因子：
0
作者：
E. Repapi;D. Agarwal;G. Napolitani;David Sims;Stephen S. Taylor
通讯作者：
E. Repapi;D. Agarwal;G. Napolitani;David Sims;Stephen S. Taylor

GSDMB is increased in IBD and regulates epithelial restitution/repair independent of pyroptosis.

IBD中的GSDMB增加，并调节上皮恢复/修复，而与凋亡无关。

DOI：
10.1016/j.cell.2021.12.024
发表时间：
2022-01-20
期刊：
Cell
影响因子：
64.5
作者：
Rana N;Privitera G;Kondolf HC;Bulek K;Lechuga S;De Salvo C;Corridoni D;Antanaviciute A;Maywald RL;Hurtado AM;Zhao J;Huang EH;Li X;Chan ER;Simmons A;Bamias G;Abbott DW;Heaney JD;Ivanov AI;Pizarro TT
通讯作者：
Pizarro TT