Sizing up viruses: application of emerging structural techniques for the characterisation of recombinant adeno-associated viruses (rAAVs)

评估病毒:应用新兴结构技术表征重组腺相关病毒(rAAV)

基本信息

  • 批准号:
    2613613
  • 负责人:
  • 金额:
    --
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    英国
  • 项目类别:
    Studentship
  • 财政年份:
    2021
  • 资助国家:
    英国
  • 起止时间:
    2021 至 无数据
  • 项目状态:
    未结题

项目摘要

Background:Recent developments in the application of recombinant adeno-associated viruses (rAAVs) and other forms of nucleic acid encapsulation which aim to deliver genetic material to cells, have highlighted the urgent need for a comprehensive package of analytical tools for the structural characterisation of these particles and their target interactions. Challenges arise around the characterisation of the fully assembled particles and the detailed structural changes associated with capsid assembly, manufacture and storage.In addition to capsid structure, there are clear deficits in our understanding of the higher-order structure of the single stranded (ss)DNA encapsidated in these biopharmaceutical formulations and what determines it, in part due to a lack of suitably efficient structural and analytical tools. This is particularly important as the field attempts to package nucleic acid exceeding the 4.7 kbp that is naturally accommodated, in an attempt to then deliver these large therapeutic genetic cargoes to cancer cells, and fight malignancy.Experimental Approach:In this CASE PhD studentship at the University of Leeds, in collaboration with AstraZeneca, the student will deploy established and develop novel structural biology techniques, with an emphasis on structural mass spectrometry methods. These are capable of providing valuable insights into rAAV capsid structure, ssDNA packaging, and the relationship between these, and changes that occur under biopharmaceutically relevant conditions.Supplementary Work:The student will be trained in orthogonal structural imaging methods for the higher-order structure and function of both fully assembled rAAVs and their individual parts. Furthermore,there will be exposure to additional MS techniques such as top-down denaturing and native intact mass MS, cross-linking mass spectrometry (XL-MS) and Ion-mobility mass spectrometry (IM-MS) for oligonucleotides, ssDNA, viral proteins, encapsidated viral particles and non-covalent ligand studies. Finally, there will be the possibility to reproduce in-house established methods at other laboratories for inter-instrument/laboratory reproducibility studies.Training Locations:University of Leeds and AstraZeneca - Cambridge.
背景:重组腺相关病毒(rAAV)和其他形式的核酸包封(旨在将遗传物质递送至细胞)的应用的最新进展突出了对用于这些颗粒及其靶标相互作用的结构表征的综合分析工具包的迫切需要。挑战出现在周围的表征完全组装的颗粒和详细的结构变化与衣壳组装,制造和storage. Fine衣壳结构,有明确的缺陷,在我们的理解在这些生物制药配方中的单链(ss)DNA的高级结构,是什么决定它,部分原因是缺乏适当有效的结构和分析工具。这是特别重要的,因为该领域试图包装超过4.7 kbp的核酸,这是自然容纳,试图然后提供这些大的治疗遗传货物的癌细胞,并打击malignancy.Experimental方法:在这种情况下,博士生在利兹大学,与阿斯利康合作,学生将部署建立和开发新的结构生物学技术,重点是结构质谱方法。这些都能够提供有价值的见解rAAV衣壳结构,ssDNA包装,这些之间的关系,并在生物制药相关conditions.Supplementary工作下发生的变化:学生将接受培训,在正交结构成像方法的高阶结构和功能的完全组装的rAAV和它们的个别部分。此外,还将暴露于其他MS技术,如自上而下变性和天然完整质谱MS、交联质谱(XL-MS)和离子迁移率质谱(IM-MS),用于寡核苷酸、ssDNA、病毒蛋白、单核苷酸化病毒颗粒和非共价配体研究。最后,将有可能在其他实验室复制内部建立的方法,用于仪器间/实验室间重现性研究。培训地点:利兹大学和阿斯利康-剑桥。

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

其他文献

吉治仁志 他: "トランスジェニックマウスによるTIMP-1の線維化促進機序"最新医学. 55. 1781-1787 (2000)
Hitoshi Yoshiji 等:“转基因小鼠中 TIMP-1 的促纤维化机制”现代医学 55. 1781-1787 (2000)。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
LiDAR Implementations for Autonomous Vehicle Applications
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
生命分子工学・海洋生命工学研究室
生物分子工程/海洋生物技术实验室
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
吉治仁志 他: "イラスト医学&サイエンスシリーズ血管の分子医学"羊土社(渋谷正史編). 125 (2000)
Hitoshi Yoshiji 等人:“血管医学与科学系列分子医学图解”Yodosha(涉谷正志编辑)125(2000)。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Effect of manidipine hydrochloride,a calcium antagonist,on isoproterenol-induced left ventricular hypertrophy: "Yoshiyama,M.,Takeuchi,K.,Kim,S.,Hanatani,A.,Omura,T.,Toda,I.,Akioka,K.,Teragaki,M.,Iwao,H.and Yoshikawa,J." Jpn Circ J. 62(1). 47-52 (1998)
钙拮抗剂盐酸马尼地平对异丙肾上腺素引起的左心室肥厚的影响:“Yoshiyama,M.,Takeuchi,K.,Kim,S.,Hanatani,A.,Omura,T.,Toda,I.,Akioka,
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:

的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('', 18)}}的其他基金

An implantable biosensor microsystem for real-time measurement of circulating biomarkers
用于实时测量循环生物标志物的植入式生物传感器微系统
  • 批准号:
    2901954
  • 财政年份:
    2028
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Studentship
Exploiting the polysaccharide breakdown capacity of the human gut microbiome to develop environmentally sustainable dishwashing solutions
利用人类肠道微生物群的多糖分解能力来开发环境可持续的洗碗解决方案
  • 批准号:
    2896097
  • 财政年份:
    2027
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Studentship
A Robot that Swims Through Granular Materials
可以在颗粒材料中游动的机器人
  • 批准号:
    2780268
  • 财政年份:
    2027
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Studentship
Likelihood and impact of severe space weather events on the resilience of nuclear power and safeguards monitoring.
严重空间天气事件对核电和保障监督的恢复力的可能性和影响。
  • 批准号:
    2908918
  • 财政年份:
    2027
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Studentship
Proton, alpha and gamma irradiation assisted stress corrosion cracking: understanding the fuel-stainless steel interface
质子、α 和 γ 辐照辅助应力腐蚀开裂:了解燃料-不锈钢界面
  • 批准号:
    2908693
  • 财政年份:
    2027
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Studentship
Field Assisted Sintering of Nuclear Fuel Simulants
核燃料模拟物的现场辅助烧结
  • 批准号:
    2908917
  • 财政年份:
    2027
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Studentship
Assessment of new fatigue capable titanium alloys for aerospace applications
评估用于航空航天应用的新型抗疲劳钛合金
  • 批准号:
    2879438
  • 财政年份:
    2027
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Studentship
Developing a 3D printed skin model using a Dextran - Collagen hydrogel to analyse the cellular and epigenetic effects of interleukin-17 inhibitors in
使用右旋糖酐-胶原蛋白水凝胶开发 3D 打印皮肤模型,以分析白细胞介素 17 抑制剂的细胞和表观遗传效应
  • 批准号:
    2890513
  • 财政年份:
    2027
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Studentship
CDT year 1 so TBC in Oct 2024
CDT 第 1 年,预计 2024 年 10 月
  • 批准号:
    2879865
  • 财政年份:
    2027
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Studentship
Understanding the interplay between the gut microbiome, behavior and urbanisation in wild birds
了解野生鸟类肠道微生物组、行为和城市化之间的相互作用
  • 批准号:
    2876993
  • 财政年份:
    2027
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Studentship

相似国自然基金

“Bottom-up”策略构筑金属纳米粒子-多孔有机聚合物复合催化材料
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2022
  • 资助金额:
    33 万元
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
碳锰双功能催化剂低温协同脱除烧结烟气NOx与UP-POPs研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2022
  • 资助金额:
    54 万元
  • 项目类别:
    面上项目
基于MS/MS和UP-MMCA的新生儿甲基丙二酸血症二阶筛查新方法构建与临床应用研究
  • 批准号:
    82101824
  • 批准年份:
    2021
  • 资助金额:
    30 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
简便快速bottom-up法制备含氮空位中心的纳米金刚石晶体
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2019
  • 资助金额:
    60 万元
  • 项目类别:
    面上项目
长效GnRHa“flare-up”效应通过AMPK通路抑制子宫腺肌症患者卵泡发育的机制
  • 批准号:
    81801418
  • 批准年份:
    2018
  • 资助金额:
    21.0 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
基于MOFs衍生的多孔纳米复合金属氧化物的制备及其低温催化降解UP-POPs机理研究
  • 批准号:
    21777159
  • 批准年份:
    2017
  • 资助金额:
    64.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
几类非Kahler复流形的研究
  • 批准号:
    11701414
  • 批准年份:
    2017
  • 资助金额:
    23.0 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
几类非散度型方程解的性质研究
  • 批准号:
    11601140
  • 批准年份:
    2016
  • 资助金额:
    19.0 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
非均匀介质中非线性拋物型方程的奇性分析
  • 批准号:
    11501076
  • 批准年份:
    2015
  • 资助金额:
    18.0 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
具非线性梯度项的Monge-Ampere方程的大解
  • 批准号:
    11571295
  • 批准年份:
    2015
  • 资助金额:
    48.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似海外基金

Characterization of seasonal CoV immunity and operationalization of a novel controlled human infection model for the betacoronavirus OC43
β冠状病毒 OC43 的季节性 CoV 免疫特征和新型受控人类感染模型的操作
  • 批准号:
    10663727
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
Impact of TNF on Oncolytic Virotherapy
TNF 对溶瘤病毒治疗的影响
  • 批准号:
    10731525
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
Mitoquinone/mitoquinol mesylate as oral and safe Postexposure Prophylaxis for Covid-19
米托醌/甲磺酸米托喹诺作为 Covid-19 的口服且安全的暴露后预防
  • 批准号:
    10727092
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
Balancing epithelial cell resistance and resilience to respiratory viral infections
平衡上皮细胞抵抗力和对呼吸道病毒感染的抵抗力
  • 批准号:
    10555886
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
Innate immunity against viral infection in intestinal epithelial cells of C. elegans
秀丽隐杆线虫肠上皮细胞对病毒感染的先天免疫
  • 批准号:
    10680767
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
Preclinical and IND enabling studies for treatment of advanced lung cancer and other cancers metastatic to lung by pulmonary delivery of engineered Influenza A Virus (eIAV)
通过经肺递送工程甲型流感病毒 (eIAV) 治疗晚期肺癌和其他转移至肺部的癌症的临床前和 IND 研究
  • 批准号:
    10822598
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
Project 3: Skin hypoxia, MCPyV infection, and MCC tumorigenesis
项目3:皮肤缺氧、MCPyV感染和MCC肿瘤发生
  • 批准号:
    10714175
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
Hepatoselective Dihydroquinolizinone (HS-DHQ) Molecules for Treatment and Prevention of Hepatitis A Virus (HAV) Infection
用于治疗和预防甲型肝炎病毒 (HAV) 感染的肝选择性二氢喹嗪酮 (HS-DHQ) 分子
  • 批准号:
    10698516
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
Solving Opportunities for Spillover (SOS): Frequency and Mechanisms of Cross-species Transmission of Henipaviruses in Bangladesh
解决溢出机会 (SOS):孟加拉国亨尼帕病毒跨物种传播的频率和机制
  • 批准号:
    10587319
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
Engineering the biology of AAV secretion and production
AAV 分泌和生产的生物学工程
  • 批准号:
    10656028
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了