EWOD-MALDI-MS for High-Throughput Proteomics

用于高通量蛋白质组学的 EWOD-MALDI-MS

基本信息

  • 批准号:
    7489875
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 31.93万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    美国
  • 项目类别:
  • 财政年份:
    2006
  • 资助国家:
    美国
  • 起止时间:
    2006-09-06 至 2010-08-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

Proteomics research requires methods and instruments that can collect, store, catalogue and analyze vast amounts of information. To accelerate progress in proteomics research, we propose to develop electrowetting-on-dielectric (EWOD)-based microfluidics that will enable sample processing steps to be integrated with creation of high-throughput arrays for matrix assisted laser desorption/ionization mass spectrometry (MALDI-MS). In EWOD, electric fields are used to manipulate liquid surface tension. By applying a sequence of potentials across electrodes fabricated under a dielectric layer, droplets can be created from a reservoir, moved to specific locations, joined, mixed and divided. EWOD-based microfluidic devices are reconfigurable, and can handle neutral and charged analytes and particulates, in water or organic solvents. The research plan addresses five objectives: 1) EWOD device design and fabrication; 2) chracterization of EWOD as a sample preparation tool for MALDI-MS; 3) EWOD-based sample purification and processing; 4) integration of EWOD-MALDI-MS with micro-HPLC and CD separations, using a new method, "valet parking MALDI," and 5) two applications of EWOD-MALDI-MS: (a) detection of disease markers in saliva, and (b) generation of protein arrays for functional proteomics. Because it has the protential to integrate many sample processing steps with creation of high-throughput arrays for MALDI-MS, the proposed method will represent a major advance over existing technologies for proteomics. More broadly, the EWOD-based devices and sample processing protocols we develop will be applicable in a wide range of array-based methods in bioanalytical chemistry anad chemical biology.
蛋白质组学研究需要能够收集、存储、编目和分析大量蛋白质的方法和仪器 大量的信息。为了加快蛋白质组学研究的进展,我们建议开发 基于电介质上电润湿(EWOD)的微流体,这将使样品处理步骤能够 与用于基质辅助激光解吸/电离质谱的高通量阵列的创建相结合 质谱法(MALDI-MS)。在EWOD中,电场用于操纵液体表面张力。通过 通过在电介质层下制造的电极上施加一系列电势, 从水库中产生,移动到特定的位置,加入,混合和分裂。基于EWOD的微流控 装置是可重新配置的,并且可以处理水中或水中的中性和带电分析物和颗粒, 有机溶剂本研究计画包含五个目标:1)EWOD装置的设计与制作; 2) EWOD作为MALDI-MS样品制备工具的表征; 3)基于EWOD的样品纯化 4)EWOD-MALDI-MS与微型HPLC和CD分离的集成,使用新的 方法,“代客泊车MALDI”,和5)EWOD-MALDI-MS的两个应用:(a)疾病检测 唾液中的标志物,和(B)产生用于功能蛋白质组学的蛋白质阵列。因为它有潜力 为了将许多样品处理步骤与MALDI-MS的高通量阵列的创建相结合, 所提出的方法将代表现有蛋白质组学技术的重大进步。更广泛地说, 我们开发的基于EWOD的设备和样品处理协议将适用于广泛的 生物分析化学和化学生物学中的基于阵列的方法。

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Incubated protein reduction and digestion on an electrowetting-on-dielectric digital microfluidic chip for MALDI-MS.
  • DOI:
    10.1021/ac101833b
  • 发表时间:
    2010-12-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    7.4
  • 作者:
    Nelson, Wyatt C.;Peng, Ivory;Lee, Geun-An;Loo, Joseph A.;Garrell, Robin L.;Kim, Chang-Jin CJ
  • 通讯作者:
    Kim, Chang-Jin CJ
Dynamic contact angles and hysteresis under electrowetting-on-dielectric.
Protein intrinsically disordered regions have a non-random, modular architecture.
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