STRUCTURAL STUDIES OF VIRUSES

这个子项目是许多研究子项目中利用 资源由NIH/NCRR资助的中心拨款提供。子项目和 调查员(PI)可能从NIH的另一个来源获得了主要资金， 并因此可以在其他清晰的条目中表示。列出的机构是 该中心不一定是调查人员的机构。 我们研究病毒的结构和它们的成分。我们对病毒组装途径、病毒与宿主的相互作用和进入机制感兴趣。我们广泛使用电子显微镜来研究病毒，或病毒的片段，这些病毒不能结晶。相对较低分辨率的图谱可以通过对蛋白质组分的结晶学研究来增强。 1.黄病毒：西尼罗河病毒的结构(Mukhop adhyay等人，科学，2003年)。目前有衍射分辨率约为16A的晶体可供选择。 黄病毒组分的结构，如E蛋白(Zhang et al.2004年，结构12)和衣壳蛋白单独或与前体膜蛋白形成复合体；病毒酶(Zhang等人结构，2007年)，与E形成复合体的Fab结构(Kaufmann等人，2006年)。 2.甲型病毒：甲型病毒成分的结构，如E1、E2蛋白、衣壳蛋白单独存在以及与药物形成复合体。 3.细小病毒科：几种细小病毒的衣壳结构(Simpson等人JMB 2002；Kaufmann等人。PNAS 2004)。晶体可用于对虾病毒和蚕病毒、人类细小病毒和老鼠病毒。目前正在尝试使PPV和B19衣壳蛋白的PLA2独特区域结晶。晶体可用于中和抗体的Fab片段。 4.小核糖核酸病毒：脊髓灰质炎病毒受体、DAF和ICAM-1等配体的结构(Zhang等人，J Virol，2004；肖等人，2005)。 5.T4噬菌体的结构成分：到目前为止，我们已经解决了大约40个蛋白质中的大约15个(例如Fokine等人)。2005年；孙默。单元格2007)。我们有T4鞘蛋白片段的晶体，其他尾蛋白，HOC和SoC头部蛋白以及终止酶。 6.其他噬菌体的结构成分：phiX174的H引导蛋白(Beral et al.JMB 2004)，phiKZ的溶菌酶(Fokine等人，JMB 2005)，phi29的gp13，GP9细胞裂解酶(Morais等人)。Moll Cell 2005)。 7.迷你病毒结构蛋白 更多，但没有空间

This subproject is one of many research subprojects utilizing the resources provided by a Center grant funded by NIH/NCRR. The subproject and investigator (PI) may have received primary funding from another NIH source, and thus could be represented in other CRISP entries. The institution listed is for the Center, which is not necessarily the institution for the investigator. We study the structure of viruses and their components. We are interested in viral assembly pathways, viral interaction with the host and entry mechanisms. We make extensive use of electron microscopy to study viruses, or fragments of viruses, that cannot be crystallized. The relatively low resolution maps can be augmented by crystallographic studies of the protein components. 1. Flaviviruses: Structure of West Nile virus (Mukhopadhyay et al Science 2003). Crystals are available that diffract currently to about 16A resolution. Structure of components of flaviviruses such as E protein (Zhang et al. 2004, Structure 12) and capsid protein alone or in complex with precursor membrane protein; viral enzymes (Zhang et al Structure 2007) , Fab structures in complex with E (Kaufmann et al PNAS 2006). 2. Alphaviruses:Structure of components of alphaviruses such as E1 and E2 protein, capsid protein alone and in complex with drugs. 3. Parvoviridae:Capsid structures of several parvoviruses (Simpson et al JMB 2002; Kaufmann et al. PNAS 2004). Crystals are available for a shrimp virus and a silk worm viruses, a human parvovirus and a mouse virus. Attempts are being made to crystallize the PLA2 unique region of the capsid protein of PPV and B19. Crystals are available for Fab fragments of neutralizing antibodies. 4. Picornaviruses:Structure of ligands such as polio virus receptor, DAF and ICAM-1 (Zhang et al J Virol 2004; Xiao et al 2005). 5. Structural components of T4 phage:We have solved about 15 out of about 40 proteins so far (e.g. Fokine et al. 2005; Sun Mol. Cell 2007). We have crystals of T4 sheath protein fragments, other tail proteins, the hoc and soc head proteins and the terminase enzymes. 6. Structural components of other phages:The H pilot protein of phiX174 (Bernal et al. JMB 2004),the lysozyme of phiKZ (Fokine et al.JMB 2005), gp13, gp9 cell lysing enzymes of phi29 (Morais et al. Moll Cell 2005). 7.Mimivirus structural proteins more, but no space