MERGING PHYSICAL BIOINFORMATICS AND MOLECULAR SIMULATIONS INVESTIGATING THE FUN

融合物理生物信息学和分子模拟研究的乐趣

基本信息

  • 批准号:
    7723131
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 0.05万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    美国
  • 项目类别:
  • 财政年份:
    2008
  • 资助国家:
    美国
  • 起止时间:
    2008-08-01 至 2009-07-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

This subproject is one of many research subprojects utilizing the resources provided by a Center grant funded by NIH/NCRR. The subproject and investigator (PI) may have received primary funding from another NIH source, and thus could be represented in other CRISP entries. The institution listed is for the Center, which is not necessarily the institution for the investigator. The primary goals of my research program are to carry out comparative investigations of the formation and function of protein-RNA complexes involved in the translation process across all three domains of life. The computer time requested in this LRAC renewal will be applied specifically to characterize the interactions of tRNA with cysteinyl-tRNA synthetase and elongation factor Tu, the folding of the ribosomal proteins, and the ribosomal protein mediated assembly of ribosomal RNA. In addition to the projects addressing protein synthesis in modern translation, we will study the RNA world scenario of non-ribosomal peptide formation catalyzed by clay surfaces. Our approach involves integrating evolution and bioinformatic data into both full atom molecular dynamics simulations and coarse-grained models. This is a continuing research program that is currently using computing resources allocated under LRAC grant MCA03S027S.
这个子项目是许多利用 由NIH/NCRR资助的中心赠款提供的资源。子项目和 研究者(PI)可能从另一个NIH来源获得了主要资金, 因此可以在其他CRISP条目中表示。所列机构为 研究中心,而研究中心不一定是研究者所在的机构。 我的研究计划的主要目标是进行蛋白质-RNA复合物的形成和功能的比较研究,这些蛋白质-RNA复合物参与了生命的所有三个领域的翻译过程。本LRAC更新中要求的计算机时间将专门用于表征tRNA与半胱氨酰-tRNA合成酶和延伸因子Tu的相互作用、核糖体蛋白的折叠以及核糖体蛋白介导的核糖体RNA组装。除了解决现代翻译中蛋白质合成的项目外,我们还将研究粘土表面催化的非核糖体肽形成的RNA世界场景。我们的方法包括将进化和生物信息学数据整合到全原子分子动力学模拟和粗粒度模型中。这是一个持续的研究计划,目前正在使用根据LRAC资助MCA 03 S 027 S分配的计算资源。

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

Zaida Luthey-Schulten其他文献

Zaida Luthey-Schulten的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('Zaida Luthey-Schulten', 18)}}的其他基金

MULTISEQ: SEQUENCE AND STRUCTURE ANALYSIS SOFTWARE
MULTISEQ:序列和结构分析软件
  • 批准号:
    8363660
  • 财政年份:
    2011
  • 资助金额:
    $ 0.05万
  • 项目类别:
WHOLE CELL SIMULATION
全细胞模拟
  • 批准号:
    8363668
  • 财政年份:
    2011
  • 资助金额:
    $ 0.05万
  • 项目类别:
MERGING PHYSICAL BIOINFORMATICS AND MOLECULAR SIMULATIONS INVESTIGATING THE FUN
融合物理生物信息学和分子模拟研究的乐趣
  • 批准号:
    8171816
  • 财政年份:
    2010
  • 资助金额:
    $ 0.05万
  • 项目类别:
MULTISEQ: SEQUENCE AND STRUCTURE ANALYSIS SOFTWARE
MULTISEQ:序列和结构分析软件
  • 批准号:
    8172046
  • 财政年份:
    2010
  • 资助金额:
    $ 0.05万
  • 项目类别:
MULTISEQ: SEQUENCE AND STRUCTURE ANALYSIS SOFTWARE
MULTISEQ:序列和结构分析软件
  • 批准号:
    7955621
  • 财政年份:
    2009
  • 资助金额:
    $ 0.05万
  • 项目类别:
MERGING PHYSICAL BIOINFORMATICS AND MOLECULAR SIMULATIONS INVESTIGATING THE FUN
融合物理生物信息学和分子模拟研究的乐趣
  • 批准号:
    7956084
  • 财政年份:
    2009
  • 资助金额:
    $ 0.05万
  • 项目类别:
MERGING PHYSICAL BIOINFORMATICS AND MOLECULAR SIMULATIONS INVESTIGATING THE FUN
融合物理生物信息学和分子模拟研究的乐趣
  • 批准号:
    7601314
  • 财政年份:
    2007
  • 资助金额:
    $ 0.05万
  • 项目类别:
MULTISEQ: A VMD MULTIPLE ALIGNMENT PLUG-IN
MULTISEQ:VMD 多重比对插件
  • 批准号:
    7181602
  • 财政年份:
    2005
  • 资助金额:
    $ 0.05万
  • 项目类别:
MERGING PHYSICAL BIOINFORMATICS AND MOLECULAR SIMULATIONS INVESTIGATING THE FUN
融合物理生物信息学和分子模拟研究的乐趣
  • 批准号:
    7181703
  • 财政年份:
    2004
  • 资助金额:
    $ 0.05万
  • 项目类别:
CENTER FOR MACROMOLECULAR MODELING & BIOINFORMATICS
高分子建模中心
  • 批准号:
    9099904
  • 财政年份:
    1997
  • 资助金额:
    $ 0.05万
  • 项目类别:

相似海外基金

Conference: Global Bioinformatics Education Summit 2024 — Energizing Communities to Power the Bioeconomy Workforce
会议:2024 年全球生物信息学教育峰会 — 激励社区为生物经济劳动力提供动力
  • 批准号:
    2421267
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 0.05万
  • 项目类别:
    Standard Grant
Open Access Block Award 2024 - EMBL - European Bioinformatics Institute
2024 年开放获取区块奖 - EMBL - 欧洲生物信息学研究所
  • 批准号:
    EP/Z532678/1
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 0.05万
  • 项目类别:
    Research Grant
Conference: The 9th Workshop on Biostatistics and Bioinformatics
会议:第九届生物统计与生物信息学研讨会
  • 批准号:
    2409876
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 0.05万
  • 项目类别:
    Standard Grant
PAML 5: A friendly and powerful bioinformatics resource for phylogenomics
PAML 5:用于系统基因组学的友好且强大的生物信息学资源
  • 批准号:
    BB/X018571/1
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 0.05万
  • 项目类别:
    Research Grant
PDB Management by The Research Collaboratory for Structural Bioinformatics
结构生物信息学研究合作实验室的 PDB 管理
  • 批准号:
    2321666
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 0.05万
  • 项目类别:
    Cooperative Agreement
Building a Bioinformatics Ecosystem for Agri-Ecologists
为农业生态学家构建生物信息学生态系统
  • 批准号:
    BB/X018768/1
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 0.05万
  • 项目类别:
    Research Grant
Integrative viral genomics and bioinformatics platform
综合病毒基因组学和生物信息学平台
  • 批准号:
    MC_UU_00034/5
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 0.05万
  • 项目类别:
    Intramural
Collaborative Research: IIBR: Innovation: Bioinformatics: Linking Chemical and Biological Space: Deep Learning and Experimentation for Property-Controlled Molecule Generation
合作研究:IIBR:创新:生物信息学:连接化学和生物空间:属性控制分子生成的深度学习和实验
  • 批准号:
    2318829
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 0.05万
  • 项目类别:
    Continuing Grant
Planning Proposal: CREST Center in Bioinformatics
规划方案:CREST生物信息学中心
  • 批准号:
    2334642
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 0.05万
  • 项目类别:
    Standard Grant
Bioinformatics Core
生物信息学核心
  • 批准号:
    10404414
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 0.05万
  • 项目类别:
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了