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Integrative viral genomics and bioinformatics platform

综合病毒基因组学和生物信息学平台

基本信息

批准号：
MC_UU_00034/5
负责人：
David Robertson
金额：
$ 1082.69万
依托单位：
University of Glasgow
依托单位国家：
英国
项目类别：
Intramural
财政年份：
2023
资助国家：
英国
起止时间：
2023 至无数据
项目状态：
未结题

来源：
https://gtr.ukri.org/projects?ref=MC_UU_00034%2F5
关键词：
Integrative viral genomics bioinformatics platform

项目摘要

Genome sequencing and associated computer-based analysis and methods have fundamentally transformed our understanding of viruses and the diseases they cause. The purpose of the integrative viral genomics and bioinformatics (iVGB) platform is to support CVR researchers and external collaborators across a range of virus-focused research projects, providing specialist expertise, resources and training to the wider UK and international virology community. The platform consists of the genomics and the bioinformatics teams, which work closely together. Uniquely in the UK, both teams are dedicated solely to virology and consist of experts in a wide range of topics relevant to the CVR research portfolio. Our research will be split into two overall objectives: (1) integration of genomic, evolutionary and phenotypic dimensions of viral infection (including the use of existing public data) in collaboration with the CVR research programmes and (2), with the Preparedness platform, response to outbreaks & enhanced surveillance

基因组测序和相关的基于计算机的分析和方法从根本上改变了我们对病毒及其引起的疾病的理解。整合病毒基因组学和生物信息学（iVGB）平台的目的是支持CVR研究人员和外部合作者进行一系列以病毒为重点的研究项目，为更广泛的英国和国际病毒学社区提供专业知识，资源和培训。该平台由密切合作的基因组学和生物信息学团队组成。在英国是独一无二的，这两个团队都专门致力于病毒学，并由与CVR研究组合相关的广泛主题的专家组成。我们的研究将分为两个总体目标：（1）与CVR研究计划合作，整合病毒感染的基因组，进化和表型维度（包括使用现有的公共数据），以及（2）与准备平台，应对疫情和加强监测

项目成果

期刊论文数量（10）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Agua Salud Alphavirus Infection, Dissemination and Transmission in Aedes aegypti Mosquitoes.

DOI：
10.3390/v15051113
发表时间：
2023-05-03
期刊：
Viruses
影响因子：
0
作者：
Jagtap SV;Brink J;Frank SC;Badusche M;Leggewie M;Sreenu VB;Fuss J;Schnettler E;Altinli M
通讯作者：
Altinli M

Isolation and genome sequencing of cytomegaloviruses from Natal multimammate mice (Mastomys natalensis).

DOI：
10.1099/jgv.0.001873
发表时间：
2023-08
期刊：
JOURNAL OF GENERAL VIROLOGY
影响因子：
3.8
作者：
Hansen, Frederick;Vucak, Matej;Nichols, Jenna;Hughes, Joseph;Bane, Sidy;Camiolo, Salvatore;Filipe, Ana da Silva;Ostermann, Eleonore;Staliunaite, Laura;Chan, Baca;Mauch, Thekla;Sogoba, Nafomon;Streblow, Daniel N.;Voigt, Sebastian;Oestereich, Lisa;Ehlers, Bernhard;Redwood, Alec J.;Feldmann, Heinz;Brune, Wolfram;Rosenke, Kyle;Jarvis, Michael A.;Davison, Andrew J.
通讯作者：
Davison, Andrew J.

Single-cell dissection of cervical cancer reveals key subsets of the tumor immune microenvironment

DOI：
10.15252/embj.2022110757
发表时间：
2023-07-10
期刊：
EMBO JOURNAL
影响因子：
11.4
作者：
Cao, Guangxu;Yue, Jiali;Li, Fang
通讯作者：
Li, Fang

SARS-CoV-2 in Domestic UK Cats from Alpha to Omicron: Swab Surveillance and Case Reports.

DOI：
10.3390/v15081769
发表时间：
2023-08-19
期刊：
Viruses
影响因子：
0
作者：
Jones S;Tyson GB;Orton RJ;Smollett K;Manna F;Kwok K;Suárez NM;Logan N;McDonald M;Bowie A;Filipe ADS;Willett BJ;Weir W;Hosie MJ
通讯作者：
Hosie MJ

Simulating the Evolutionary Response of a Viral Pandemic to Behaviour Change

模拟病毒大流行对行为改变的进化反应

DOI：
10.1162/isal_a_00691
发表时间：
2023
期刊：
影响因子：
0
作者：
Hinsch M
通讯作者：
Hinsch M

DOI：
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David Robertson其他文献

Ideology, Strategy and Party Change: Spatial Analyses of Post-War Election Programmes in 19 Democracies: Do parties differ, and how? Comparative discriminant and factor analyses.

意识形态、战略和政党变革：19 个民主国家战后选举计划的空间分析：政党是否存在差异，有何不同？

DOI：
10.1017/cbo9780511558771.019
发表时间：
1987
期刊：
影响因子：
0
作者：
I. Budge;David Robertson
通讯作者：
David Robertson

Airway response to sublingual nitroglycerin in acute asthma.

急性哮喘舌下含服硝酸甘油的气道反应。

DOI：
10.1001/jama.1981.03320020037020
发表时间：
1981
期刊：
JAMA
影响因子：
0
作者：
Thomas P. Kennedy;Warren R. Summer;Jimmie Sylvester;David Robertson
通讯作者：
David Robertson

Bioinformatics experimentation in the OpenKnowledge peer to peer infrastructure

OpenKnowledge 点对点基础设施中的生物信息学实验

DOI：
发表时间：
2008
期刊：
影响因子：
0
作者：
Xueping Quan;Paolo Besana;Siu;David Robertson;D. Gerloff
通讯作者：
D. Gerloff

Elevation of follicular phase inhibin and luteinizing hormone levels in mothers of dizygotic twins suggests nonovarian control of human multiple ovulation.

异卵双胞胎母亲的卵泡期抑制素和黄体生成素水平升高表明非卵巢控制人类多次排卵。

DOI：
发表时间：
1991
期刊：
Fertility and Sterility
影响因子：
6.7
作者：
Nicholas G. Martin;Nicholas G. Martin;David Robertson;David Robertson;Georgia Chenevix;Georgia Chenevix;D. M. D. Kretser;D. M. D. Kretser;John Osborne;John Osborne;Henry G. Burger;Henry G. Burger
通讯作者：
Henry G. Burger

Serum immunoactive inhibin levels in early pregnancy after in vitro fertilization and embryo transfer.

体外受精和胚胎移植后妊娠早期血清免疫活性抑制素水平。

DOI：
10.1016/s0015-0282(16)55932-9
发表时间：
1993
期刊：
Fertility and sterility
影响因子：
6.7
作者：
Takashi Yohkaichiya;David W. Polson;Edward G. Hughes;V. Maclachlan;David Robertson;David L. Healy;David M. de Kretser
通讯作者：
David M. de Kretser