USE OF 18O LABELS TO MONITOR DEAMIDATION DURING SAMPLE PROCESSING

使用 18O 标签监测样品处理过程中的脱酰胺作用

基本信息

  • 批准号:
    7955974
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.18万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    美国
  • 项目类别:
  • 财政年份:
    2009
  • 资助国家:
    美国
  • 起止时间:
    2009-06-01 至 2010-05-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

This subproject is one of many research subprojects utilizing the resources provided by a Center grant funded by NIH/NCRR. The subproject and investigator (PI) may have received primary funding from another NIH source, and thus could be represented in other CRISP entries. The institution listed is for the Center, which is not necessarily the institution for the investigator. Deamidation may occur as an artifact during sample processing, particularly when using typical tryptic digestion protocols. We have developed an 18O labeling approach to monitor these artificial deamidations, where the enzymatic digestion was carried out in 18O labeled water. While in vivo deamidation causes a +1 Da mass shift per deamidation site due to the substitution of the -NH2 group by the -OH group, those occurred during digestion lead to a +3 Da mass shift, with the extra +2 Da arising from the incorporation of one 18O atom. This study has recently been published (Li et al., 2008) in the Journal of the American Society for Mass Spectrometry, 2008, 19, 855-864.
该子项目是利用该技术的众多研究子项目之一 资源由 NIH/NCRR 资助的中心拨款提供。子项目和 研究者 (PI) 可能已从 NIH 的另一个来源获得主要资金, 因此可以在其他 CRISP 条目中表示。列出的机构是 对于中心来说,它不一定是研究者的机构。 在样品处理过程中,脱酰胺可能会作为伪影发生,特别是在使用典型的胰蛋白酶消化方案时。我们开发了一种 18O 标记方法来监测这些人工脱酰胺,其中酶消化是在 18O 标记水中进行的。虽然体内脱酰胺作用由于 -NH2 基团被 -OH 基团取代而导致每个脱酰胺位点产生 +1 Da 质量位移,但消化过程中发生的那些导致 +3 Da 质量位移,其中由于一个 18O 原子的掺入而产生额外的 +2 Da 质量位移。这项研究最近发表在美国质谱学会杂志 (Journal of the American Society for Mass Spectrometry), 2008, 19, 855-864 上 (Li et al., 2008)。

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

PETER B. O'CONNOR其他文献

PETER B. O'CONNOR的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('PETER B. O'CONNOR', 18)}}的其他基金

FTMS SYSTEM UPGRADES
FTMS 系统升级
  • 批准号:
    7955883
  • 财政年份:
    2009
  • 资助金额:
    $ 1.18万
  • 项目类别:
DEVELOPMENT OF AN AMPLITUDE AND FREQUENCY STABILIZED HIGH POWER OSCILLATOR
稳幅稳频大功率振荡器的研制
  • 批准号:
    7955976
  • 财政年份:
    2009
  • 资助金额:
    $ 1.18万
  • 项目类别:
IMPROVED PREAMPLIFIER FOR FTICRMS
改进的 FTICRMS 前置放大器
  • 批准号:
    7955923
  • 财政年份:
    2009
  • 资助金额:
    $ 1.18万
  • 项目类别:
ARTIFACTS IN FOURIER TRANSFORM MASS SPECTROMETRY
傅里叶变换质谱中的伪影
  • 批准号:
    7955973
  • 财政年份:
    2009
  • 资助金额:
    $ 1.18万
  • 项目类别:
DOUBLE RESONANCE ECD
双共振ECD
  • 批准号:
    7955943
  • 财政年份:
    2009
  • 资助金额:
    $ 1.18万
  • 项目类别:
THE EFFECT OF FIXED CHARGE MODIFICATION ON ECD
固定收费修改对 ECD 的影响
  • 批准号:
    7955975
  • 财政年份:
    2009
  • 资助金额:
    $ 1.18万
  • 项目类别:
DIFFERENTIATION OF ISOMERIC AMINO ACID RESIDUES IN PEPTIDES USING ECD
使用 ECD 区分肽中的异构氨基酸残基
  • 批准号:
    7955921
  • 财政年份:
    2009
  • 资助金额:
    $ 1.18万
  • 项目类别:
ECD AND EDD OF NATIVE AND PERMETHYLATED GLYCANS
天然和全甲基化聚糖的 ECD 和 EDD
  • 批准号:
    7955963
  • 财政年份:
    2009
  • 资助金额:
    $ 1.18万
  • 项目类别:
TESTING APPLICATION OF THE FILTER DIAGONALIZATION METHOD TO FTMS
滤波器对角化方法在FTMS中的测试应用
  • 批准号:
    7955922
  • 财政年份:
    2009
  • 资助金额:
    $ 1.18万
  • 项目类别:
VIBRATIONALLY COOLED MATRIX-ASSIST LASER DESORPTION/IONIZATION FTMS
振动冷却基质辅助激光解吸/电离 FTMS
  • 批准号:
    7955884
  • 财政年份:
    2009
  • 资助金额:
    $ 1.18万
  • 项目类别:

相似国自然基金

Journal of Integrative Plant Biology
  • 批准号:
    31024801
  • 批准年份:
    2010
  • 资助金额:
    24.0 万元
  • 项目类别:
    专项基金项目

相似海外基金

An engineering biology approach for sustainable production of omega 3 and pigments from microalgae
一种利用微藻可持续生产 omega 3 和色素的工程生物学方法
  • 批准号:
    10107393
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.18万
  • 项目类别:
    Launchpad
FLF Next generation atomistic modelling for medicinal chemistry and biology
FLF 下一代药物化学和生物学原子建模
  • 批准号:
    MR/Y019601/1
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.18万
  • 项目类别:
    Fellowship
Sustainable Style for Clean Growth: Innovating Textile Production through Engineering Biology
清洁增长的可持续方式:通过工程生物学创新纺织品生产
  • 批准号:
    BB/Y007735/1
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.18万
  • 项目类别:
    Research Grant
Preventing Plastic Pollution with Engineering Biology (P3EB) Mission Hub
利用工程生物学 (P3EB) 任务中心预防塑料污染
  • 批准号:
    BB/Y007972/1
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.18万
  • 项目类别:
    Research Grant
GlycoCell Engineering Biology Mission Hub: Transforming glycan biomanufacture for health
GlycoCell 工程生物学任务中心:转变聚糖生物制造以促进健康
  • 批准号:
    BB/Y008472/1
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.18万
  • 项目类别:
    Research Grant
Postdoctoral Fellowship: STEMEdIPRF: Understanding instructor and student concepts of race to measure the prevalence of race essentialism in biology education
博士后奖学金:STEMEdIPRF:了解教师和学生的种族概念,以衡量生物教育中种族本质主义的流行程度
  • 批准号:
    2327488
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.18万
  • 项目类别:
    Standard Grant
CAREER: Hybridization and radiation: Integrating across phylogenomics, ancestral niche evolution, and pollination biology
职业:杂交和辐射:系统基因组学、祖先生态位进化和授粉生物学的整合
  • 批准号:
    2337784
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.18万
  • 项目类别:
    Continuing Grant
Collaborative Research: IMPLEMENTATION: Broadening participation of marginalized individuals to transform SABER and biology education
合作研究:实施:扩大边缘化个人的参与,以改变 SABER 和生物教育
  • 批准号:
    2334954
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.18万
  • 项目类别:
    Standard Grant
Collaborative Research: REU Site: Summer Undergraduate Research Program in RNA and Genome Biology (REU-RGB)
合作研究:REU 网站:RNA 和基因组生物学暑期本科生研究计划 (REU-RGB)
  • 批准号:
    2349255
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.18万
  • 项目类别:
    Continuing Grant
REU Site: Nature's machinery through the prism of Physics, Biology, Chemistry and Engineering
REU 网站:通过物理、生物、化学和工程学的棱镜观察自然的机器
  • 批准号:
    2349368
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.18万
  • 项目类别:
    Standard Grant
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了