Gene discovery in primary dystonia using whole exome sequencing

使用全外显子组测序发现原发性肌张力障碍的基因

基本信息

项目摘要

DESCRIPTION (provided by applicant): ABSTRACT Primary torsion dystonias (PTD) are a group of movement disorders characterized by twisting muscle contractures, where dystonia is the only clinical sign and there is no evidence of neuronal degeneration or an acquired cause. There are eight PTD loci assigned (DYT1, 2, 4, 6, 7, 13, 17 and 21), but only two of the genes (TOR1A-DYT1 and THAP1-DYT6) have been isolated. Apparent locus heterogeneity, reduced penetrance and significant phenotypic overlap between different forms of PTD limit the success of positional cloning approaches for dystonia gene discovery. New second generation sequencing technologies combined with whole exome capture libraries have revolutionized our ability to identify disease-causing mutations. Exome sequencing is based on capturing all exons of an individual's genome and sequencing them to an average 30X depth of coverage. We propose to apply exome sequencing to discover causative mutations in four multi- generation dystonia families. We will identify coding changes shared by a group of affected individuals in each family. These changes will be further tested for co-segregation with the disease in the remaining family members. The identified genes will be confirmed by screening for additional mutations in a collection of phenotypically similar small PTD families. Finally, in order to define the phenotypic spectrum associated with mutations, each gene will be examined in a large cohort of singleton PTD cases. The proposed research will lead to the identification of novel PTD genes and pathogenic mutations thus providing a key to understanding the molecular pathophysiology of the disease and the foundation for devising new therapeutic interventions.
描述(由申请人提供): 原发性扭转肌张力障碍(PTD)是一组以扭转肌肉挛缩为特征的运动障碍,其中肌张力障碍是唯一的临床体征,没有神经元变性或后天原因的证据。有8个PTD基因座(DYT 1、2、4、6、7、13、17和21),但只有两个基因(TOR 1A-DYT 1和THAP 1-DYT 6)已被分离。明显的基因座异质性,降低的多态性和不同形式的PTD之间的显着表型重叠限制了肌张力障碍基因发现的定位克隆方法的成功。新的第二代测序技术与全外显子组捕获文库相结合,彻底改变了我们识别致病突变的能力。外显子组测序基于捕获个体基因组的所有外显子并将其测序到平均30 X覆盖深度。我们建议应用外显子组测序来发现四个多代肌张力障碍家族的致病突变。我们将确定每个家庭中一组受影响的个体共享的编码变化。这些变化将进一步测试与其余家庭成员中的疾病的共分离。将通过在一组表型相似的小PTD家族中筛选其他突变来确认所鉴定的基因。最后,为了确定与突变相关的表型谱,将在单个PTD病例的大队列中检查每个基因。拟议的研究将导致新的PTD基因和致病性突变的鉴定,从而为理解该疾病的分子病理生理学提供关键,并为设计新的治疗干预措施奠定基础。

项目成果

期刊论文数量(1)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Genetics in dystonia: an update.
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

Laurie J. Ozelius其他文献

Rapid-onset dystonia-parkinsonism: case report
  • DOI:
    10.1007/s00415-009-5385-y
  • 发表时间:
    2009-11-20
  • 期刊:
  • 影响因子:
    4.600
  • 作者:
    Marina Svetel;Laurie J. Ozelius;Amber Buckley;Katja Lohmann;Lela Brajković;Christine Klein;Vladimir S. Kostić
  • 通讯作者:
    Vladimir S. Kostić
Gender differences in the IL6 −174G>C and ESR2 1730G>A polymorphisms and the risk of Parkinson's disease
IL6 -174G>C 和 ESR2 1730G>A 多态性的性别差异与帕金森病的风险
  • DOI:
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
  • 影响因子:
    2.5
  • 作者:
    M. S. Luciano;Laurie J. Ozelius;R. Lipton;D. Raymond;S. Bressman;R. Saunders;R. Saunders
  • 通讯作者:
    R. Saunders
Clinical-genetic spectrum of primary dystonia.
原发性肌张力障碍的临床遗传谱。
  • DOI:
  • 发表时间:
    1998
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    S. Bressman;D. Leon;D. Raymond;Laurie J. Ozelius;X. Breakefield;T. G. Nygaard;L. Almasy;N. Risch;P. Kramer
  • 通讯作者:
    P. Kramer
Isolated dystonia: clinical and genetic updates
  • DOI:
    10.1007/s00702-020-02268-x
  • 发表时间:
    2020-11-27
  • 期刊:
  • 影响因子:
    4.000
  • 作者:
    Aloysius Domingo;Rachita Yadav;Laurie J. Ozelius
  • 通讯作者:
    Laurie J. Ozelius
Adult onset idiopathic torsion dystonia is excluded from the DYT 1 region (9q34) in a Swedish family.
在一个瑞典家庭中,成人发病的特发性扭转肌张力障碍被排除在 DYT 1 区域 (9q34) 之外。
  • DOI:
    10.1136/jnnp.59.2.178
  • 发表时间:
    1995
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Gösta Holmgren;Laurie J. Ozelius;Lars Forsgren;Bela G.L. Almay;M. Holmberg;Patricia L. Kramer;S. Fahn;X. Breakefield
  • 通讯作者:
    X. Breakefield

Laurie J. Ozelius的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('Laurie J. Ozelius', 18)}}的其他基金

Dissecting Oligogenic Biomarkers in Ashkenazi Jews with Parkinson Disease
剖析患有帕金森病的德系犹太人的寡基因生物标志物
  • 批准号:
    10402022
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 24.54万
  • 项目类别:
Dissecting Oligogenic Biomarkers in Ashkenazi Jews with Parkinson Disease
剖析患有帕金森病的德系犹太人的寡基因生物标志物
  • 批准号:
    9917851
  • 财政年份:
    2019
  • 资助金额:
    $ 24.54万
  • 项目类别:
Dissecting Oligogenic Biomarkers in Ashkenazi Jews with Parkinson Disease
剖析患有帕金森病的德系犹太人的寡基因生物标志物
  • 批准号:
    10369016
  • 财政年份:
    2019
  • 资助金额:
    $ 24.54万
  • 项目类别:
Dissecting Oligogenic Biomarkers in Ashkenazi Jews with Parkinson Disease
剖析患有帕金森病的德系犹太人的寡基因生物标志物
  • 批准号:
    10597884
  • 财政年份:
    2019
  • 资助金额:
    $ 24.54万
  • 项目类别:
Gene discovery in primary dystonia using whole exome sequencing
使用全外显子组测序发现原发性肌张力障碍的基因
  • 批准号:
    8300554
  • 财政年份:
    2012
  • 资助金额:
    $ 24.54万
  • 项目类别:
Creation of mouse models for DYT6 dystonia
DYT6 肌张力障碍小鼠模型的创建
  • 批准号:
    7788350
  • 财政年份:
    2010
  • 资助金额:
    $ 24.54万
  • 项目类别:
Creation of mouse models for DYT6 dystonia
DYT6 肌张力障碍小鼠模型的创建
  • 批准号:
    8037041
  • 财政年份:
    2010
  • 资助金额:
    $ 24.54万
  • 项目类别:
Generation of Mouse Models for Early Onset Dystonia
早发性肌张力障碍小鼠模型的生成
  • 批准号:
    6803360
  • 财政年份:
    2004
  • 资助金额:
    $ 24.54万
  • 项目类别:
CORE--GENETICS
核心--遗传学
  • 批准号:
    6825144
  • 财政年份:
    2003
  • 资助金额:
    $ 24.54万
  • 项目类别:
ROLE OF TORSIN GENE FAMILY IN DYSTONIA AND GENETIC DETERMINANTS OF PENETRANCE
Torsin 基因家族在肌张力障碍中的作用和外显率的遗传决定因素
  • 批准号:
    6565253
  • 财政年份:
    2002
  • 资助金额:
    $ 24.54万
  • 项目类别:

相似海外基金

RII Track-4:NSF: From the Ground Up to the Air Above Coastal Dunes: How Groundwater and Evaporation Affect the Mechanism of Wind Erosion
RII Track-4:NSF:从地面到沿海沙丘上方的空气:地下水和蒸发如何影响风蚀机制
  • 批准号:
    2327346
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 24.54万
  • 项目类别:
    Standard Grant
BRC-BIO: Establishing Astrangia poculata as a study system to understand how multi-partner symbiotic interactions affect pathogen response in cnidarians
BRC-BIO:建立 Astrangia poculata 作为研究系统,以了解多伙伴共生相互作用如何影响刺胞动物的病原体反应
  • 批准号:
    2312555
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 24.54万
  • 项目类别:
    Standard Grant
How Does Particle Material Properties Insoluble and Partially Soluble Affect Sensory Perception Of Fat based Products
不溶性和部分可溶的颗粒材料特性如何影响脂肪基产品的感官知觉
  • 批准号:
    BB/Z514391/1
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 24.54万
  • 项目类别:
    Training Grant
Graduating in Austerity: Do Welfare Cuts Affect the Career Path of University Students?
紧缩毕业:福利削减会影响大学生的职业道路吗?
  • 批准号:
    ES/Z502595/1
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 24.54万
  • 项目类别:
    Fellowship
Insecure lives and the policy disconnect: How multiple insecurities affect Levelling Up and what joined-up policy can do to help
不安全的生活和政策脱节:多种不安全因素如何影响升级以及联合政策可以提供哪些帮助
  • 批准号:
    ES/Z000149/1
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 24.54万
  • 项目类别:
    Research Grant
感性個人差指標 Affect-X の構築とビスポークAIサービスの基盤確立
建立个人敏感度指数 Affect-X 并为定制人工智能服务奠定基础
  • 批准号:
    23K24936
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 24.54万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
How does metal binding affect the function of proteins targeted by a devastating pathogen of cereal crops?
金属结合如何影响谷类作物毁灭性病原体靶向的蛋白质的功能?
  • 批准号:
    2901648
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 24.54万
  • 项目类别:
    Studentship
ERI: Developing a Trust-supporting Design Framework with Affect for Human-AI Collaboration
ERI:开发一个支持信任的设计框架,影响人类与人工智能的协作
  • 批准号:
    2301846
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 24.54万
  • 项目类别:
    Standard Grant
Investigating how double-negative T cells affect anti-leukemic and GvHD-inducing activities of conventional T cells
研究双阴性 T 细胞如何影响传统 T 细胞的抗白血病和 GvHD 诱导活性
  • 批准号:
    488039
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 24.54万
  • 项目类别:
    Operating Grants
How motor impairments due to neurodegenerative diseases affect masticatory movements
神经退行性疾病引起的运动障碍如何影响咀嚼运动
  • 批准号:
    23K16076
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 24.54万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了