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seqFISH core for in situ cell type identification

seqFISH core for in situ cell type identification
用于原位细胞类型鉴定的 seqFISH 核心
批准号：
10438690
负责人：
Long Cai
金额：
$37.27万
依托单位：
COLUMBIA UNIVERSITY HEALTH SCIENCES
依托单位国家：
美国
项目类别：
财政年份：
2018
资助国家：
美国
项目状态：
已结题
起止时间：
2018-09-15 至 2024-06-30
来源：
https://reporter.nih.gov/project-details/10438690
关键词：
3-DimensionalBackBiochemistryBiological AssayBrainCalciumCell CommunicationCellsChickensComplementComplexComputer softwareDataData Science CoreData SetDetectionDevelopmentEmbryoEnvironmentFluorescent in Situ HybridizationGene ExpressionGene Expression ProfileGenesGenomic approachGenomicsGoalsHippocampus (Brain)HumanImageIn SituIn VitroInterneuronsLabelLocationMapsMeasurementMessenger RNAMethodsModelingMolecularMusNatureNeuronsPancreasPatternPhysiologicalPopulationProcessProtocols documentationRNAResearchResolutionResourcesSamplingSliceTechnologyTimeTissue SampleTissuesTranslatingV1 neuronValidationVisualWorkZebrafisharea striatabiological systemscell typeexperimental studyimaging studyin vivoin vivo calcium imaginginnovative technologiesinstrumentmultiplexed imagingrelating to nervous systemresponsesingle moleculesingle-cell RNA sequencingtool

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
项目摘要 这个核心的目标是系统地表征不同的分子身份 使用连接学和尖端技术相结合的皮质内神经元群 SeqFISH方法用于单细胞RNA的多重检测。蔡氏实验室最近 开发了一种使用顺序杂交和单分子FISH技术来多重 在复杂的组织样本中，大量的mRNA分子直接存在于单个细胞中。一个 哥伦比亚大学、加州大学伯克利分校和加州理工学院的协作团队将应用这项技术来识别 活体钙成像实验后小鼠脑内不同细胞类型的原位研究 以及体外连接性测量。
英文摘要
Project Summary The goal of this core is to systematically characterize the molecular identities of distinct neuronal populations within the cortex using a combination of connectomics and cutting edge seqFISH methods to multiplex RNA detection in single cells. The Cai lab has recently developed a technology using sequential hybridization and single molecule FISH to multiplex a large number of mRNA molecules directly in single cells in complex tissue samples. A collaborative team at Columbia, UC Berkeley and at Caltech will apply this technology to identify distinct cell types in the mouse brain in situ following in vivo live calcium imaging experiments as well as in vitro connectivity measurements.
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Single cell analysis of the kinome
Single cell analysis of the kinome
A regulome and transcriptome atlas of fetal and adult human neurogenesis
Dynamics of chromosome organization and chromatin states in single cells
国内基金
海外基金
患者依从性与脑卒中后跌倒风险相关性及“Teach-Back ”护理干预效应研究
  • 批准号：
    2026JJ81464
  • 项目类别：
    省市级项目
  • 资助金额：
    --
  • 批准年份：
    2026
  • 负责人：
    叶婷
  • 依托单位：
    岳阳市中医医院
基于Teach-back药学科普模式的慢阻肺患者吸入用药依从性及疗效研究
  • 批准号：
    2024KP61
  • 项目类别：
    省市级项目
  • 资助金额：
    --
  • 批准年份：
    2024
  • 负责人：
    余丹
  • 依托单位：
    清远市中医院
基于Quench-Back保护的超导螺线管磁体失超过程数值模拟研究
  • 批准号：
    51307073
  • 项目类别：
    青年科学基金项目
  • 资助金额：
    25.0万元
  • 批准年份：
    2013
  • 负责人：
    郭兴龙
  • 依托单位：
    江苏大学