APPLICATION OF PTMAP2 FOR PROTEIN POSTTRANSLATIONAL MODIFICATION ANALYSIS
PTMAP2 在蛋白质翻译后修饰分析中的应用
基本信息
- 批准号:8364316
- 负责人:
- 金额:$ 0.1万
- 依托单位:
- 依托单位国家:美国
- 项目类别:
- 财政年份:2011
- 资助国家:美国
- 起止时间:2011-09-15 至 2013-07-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:Biomedical ResearchCell physiologyData FilesEscherichia coli ProteinsFundingGrantHigh Performance ComputingMass Spectrum AnalysisNational Center for Research ResourcesOrganismPlayPost-Translational Protein ProcessingPrincipal InvestigatorProtein DatabasesProteinsResearchResearch InfrastructureResourcesRoleSourceTestingUnited States National Institutes of Healthcostgenome-wideprotein functiontool
项目摘要
This subproject is one of many research subprojects utilizing the resources
provided by a Center grant funded by NIH/NCRR. Primary support for the subproject
and the subproject's principal investigator may have been provided by other sources,
including other NIH sources. The Total Cost listed for the subproject likely
represents the estimated amount of Center infrastructure utilized by the subproject,
not direct funding provided by the NCRR grant to the subproject or subproject staff.
Posttranslational modifications (PTMs) play essential roles in protein function and cellular physiology. Unrestrictive identification of all types of PTMs using mass spectrometry is a powerful approach. Previous efforts have allowed us to successfully develop PTMap v2.0, a tool for genome-wide characterization of protein posttranslational modifications. Initial tests demonstrate that PTMap2 is capable to identify all types of PTMs in E. coli protein database from a single mass spectrometry data file. Here we propose to extend the application of PTMap2 tool to identify unknown PTMs in diverse cellular organisms.
这个子项目是许多利用资源的研究子项目之一
由NIH/NCRR资助的中心拨款提供。子项目的主要支持
而子项目的主要调查员可能是由其他来源提供的,
包括其它NIH来源。 列出的子项目总成本可能
代表子项目使用的中心基础设施的估计数量,
而不是由NCRR赠款提供给子项目或子项目工作人员的直接资金。
翻译后修饰在蛋白质功能和细胞生理中起着重要作用。使用质谱法对所有类型的PTM进行非限制性鉴定是一种强有力的方法。先前的努力使我们能够成功地开发PTMap v2.0,这是一种用于蛋白质翻译后修饰的全基因组表征的工具。初步测试表明,PTMap 2能够识别大肠杆菌中所有类型的PTM。coli蛋白质数据库中从单个质谱数据文件。在这里,我们建议扩展PTMap 2工具的应用,以确定未知的PTM在不同的细胞生物体。
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
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