DEVELOPMENT OF PTMAP20 FOR GENOME-WIDE PROTEIN POSTTRANSLATIONAL MODIFICATION
用于全基因组蛋白质翻译后修饰的 PTMAP20 的开发
基本信息
- 批准号:7956366
- 负责人:
- 金额:$ 0.08万
- 依托单位:
- 依托单位国家:美国
- 项目类别:
- 财政年份:2009
- 资助国家:美国
- 起止时间:2009-08-01 至 2010-07-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:Biomedical ResearchCellsChemicalsComputer Retrieval of Information on Scientific Projects DatabaseComputersDataDevelopmentFundingGoalsGrantHigh Performance ComputingInstitutionMass Spectrum AnalysisModificationPost-Translational Protein ProcessingProteinsResearchResearch PersonnelResourcesSoftware ToolsSourceSystemUnited States National Institutes of Healthabstractinggenome-wideparallel computingprotein functiontool
项目摘要
This subproject is one of many research subprojects utilizing the
resources provided by a Center grant funded by NIH/NCRR. The subproject and
investigator (PI) may have received primary funding from another NIH source,
and thus could be represented in other CRISP entries. The institution listed is
for the Center, which is not necessarily the institution for the investigator.
No Abstract AvailablePosttranslational modifications (PTMs) are essential for protein functions in cell. Mass spectrometry is capable to identify PTMs with high sensitivity comparing to traditional chemical approach. We have developed a new software tool, called PTMap, that is capable to identify all-types of PTMs in a single protein from mass spectrometry data. Here, we propose to combine PTMap with the powerful computer clusters from Teragrid system and extend PTM analysis by PTMap through large-scale parallel computation. Our goal is to develop PTMap2.0 tool for a genome-wide characterization of protein posttranslational modifications.
这个子项目是许多研究子项目中的一个
由NIH/NCRR资助的中心赠款提供的资源。子项目和
研究者(PI)可能从另一个NIH来源获得了主要资金,
因此可以在其他CRISP条目中表示。所列机构为
研究中心,而研究中心不一定是研究者所在的机构。
翻译后修饰(Posttranslational modifications,PTM)是细胞内蛋白质功能的重要组成部分.与传统的化学方法相比,质谱法能够以高灵敏度鉴定PTM。我们开发了一种新的软件工具,称为PTMap,它能够从质谱数据中识别单个蛋白质中所有类型的PTM。在这里,我们建议将联合收割机PTMap与Teragrid系统的强大计算机集群相结合,通过大规模并行计算扩展PTMap的PTM分析。我们的目标是开发PTMap2.0工具,用于全基因组蛋白质翻译后修饰的表征。
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
YINGMING ZHAO其他文献
YINGMING ZHAO的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('YINGMING ZHAO', 18)}}的其他基金
Systematic screening for new histone marks and studying their epigenetic function
系统筛选新组蛋白标记并研究其表观遗传功能
- 批准号:
10579280 - 财政年份:2020
- 资助金额:
$ 0.08万 - 项目类别:
Systematic screening for new histone marks and studying their epigenetic function
系统筛选新组蛋白标记并研究其表观遗传功能
- 批准号:
10401345 - 财政年份:2020
- 资助金额:
$ 0.08万 - 项目类别:
Systems-wide analysis of histone lysine 2-hydroxyisobutyrylation pathway
组蛋白赖氨酸 2-羟基异丁酰化途径的全系统分析
- 批准号:
9458207 - 财政年份:2016
- 资助金额:
$ 0.08万 - 项目类别:
APPLICATION OF PTMAP2 FOR PROTEIN POSTTRANSLATIONAL MODIFICATION ANALYSIS
PTMAP2 在蛋白质翻译后修饰分析中的应用
- 批准号:
8364316 - 财政年份:2011
- 资助金额:
$ 0.08万 - 项目类别:
APPLICATION OF PTMAP2 FOR PROTEIN POSTTRANSLATIONAL MODIFICATION ANALYSIS
PTMAP2 在蛋白质翻译后修饰分析中的应用
- 批准号:
8171932 - 财政年份:2010
- 资助金额:
$ 0.08万 - 项目类别:
DEVELOPMENT OF PTMAP20 FOR GENOME-WIDE PROTEIN POSTTRANSLATIONAL MODIFICATION
用于全基因组蛋白质翻译后修饰的 PTMAP20 的开发
- 批准号:
8171905 - 财政年份:2010
- 资助金额:
$ 0.08万 - 项目类别:
Global characterization of lysine acetylation in cancer by a proteomics approach
通过蛋白质组学方法对癌症中赖氨酸乙酰化进行整体表征
- 批准号:
7817093 - 财政年份:2008
- 资助金额:
$ 0.08万 - 项目类别:
相似国自然基金
分化肌细胞脱细胞ECM-cells sheet 3D
支架构建及其促进容积性肌组织缺损再
生修复应用及机制研究
- 批准号:
- 批准年份:2025
- 资助金额:10.0 万元
- 项目类别:省市级项目
CAFs-TAMs-tumor cells调控在HRHPV感染致癌中的作用机制研究及AI可追溯预测模型建立
- 批准号:
- 批准年份:2020
- 资助金额:56 万元
- 项目类别:面上项目
S100A8/A9--Myeloid cells特异性可溶性表氧化物水解酶(sEH)基因敲除改善胰岛素抵抗的新靶点
- 批准号:82070825
- 批准年份:2020
- 资助金额:53 万元
- 项目类别:面上项目
Leader cells通过CCL5调控糖酵解及基质硬度促进结直肠癌集体侵袭的 作用机制
- 批准号:81903002
- 批准年份:2019
- 资助金额:20.5 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
HA/CD44在乳腺癌转移“先导细胞”(leader cells)侵袭中的作用及机制研究
- 批准号:81402419
- 批准年份:2014
- 资助金额:23.0 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
双模式编码的慢病毒载体转染C6 Glioma Cells的影像学研究
- 批准号:81271563
- 批准年份:2012
- 资助金额:60.0 万元
- 项目类别:面上项目
树突状细胞(Dendritic cells,DCs)介导的黏膜免疫对猪轮状病毒(PRV)感染的分子作用机制研究
- 批准号:31272541
- 批准年份:2012
- 资助金额:82.0 万元
- 项目类别:面上项目
MTA2在睾丸支持细胞(Sertoli cells)中的功能和机制研究
- 批准号:31271248
- 批准年份:2012
- 资助金额:80.0 万元
- 项目类别:面上项目
无外源性基因iPS cells向肠细胞分化及对肠损伤的修复
- 批准号:81160050
- 批准年份:2011
- 资助金额:49.0 万元
- 项目类别:地区科学基金项目
相似海外基金
Toxic Effects of Extracellular Vesicles(Exosomes) from the cells exposed to Environmental Chemicals
暴露于环境化学物质的细胞的细胞外囊泡(外泌体)的毒性作用
- 批准号:
21K19836 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 0.08万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
Defining the Effects of Endocrine-Disrupting Chemicals on the Cellular Metabolism of Inflammatory Cells
定义内分泌干扰化学物质对炎症细胞代谢的影响
- 批准号:
RGPIN-2015-05413 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 0.08万 - 项目类别:
Discovery Grants Program - Individual
Functional analysis and application of hematopoietic stem cells to chemicals that replacement for albumin function
造血干细胞替代白蛋白功能的化学物质的功能分析及应用
- 批准号:
20H03707 - 财政年份:2020
- 资助金额:
$ 0.08万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Defining the Effects of Endocrine-Disrupting Chemicals on the Cellular Metabolism of Inflammatory Cells
定义内分泌干扰化学物质对炎症细胞代谢的影响
- 批准号:
RGPIN-2015-05413 - 财政年份:2020
- 资助金额:
$ 0.08万 - 项目类别:
Discovery Grants Program - Individual
Effects of microplastic-derived chemicals on functions of regulatory T cells via nuclear receptor Nr4a.
微塑料衍生化学物质通过核受体 Nr4a 对调节性 T 细胞功能的影响。
- 批准号:
19K10611 - 财政年份:2019
- 资助金额:
$ 0.08万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Defining the Effects of Endocrine-Disrupting Chemicals on the Cellular Metabolism of Inflammatory Cells
定义内分泌干扰化学物质对炎症细胞代谢的影响
- 批准号:
RGPIN-2015-05413 - 财政年份:2019
- 资助金额:
$ 0.08万 - 项目类别:
Discovery Grants Program - Individual
Defining the Effects of Endocrine-Disrupting Chemicals on the Cellular Metabolism of Inflammatory Cells
定义内分泌干扰化学物质对炎症细胞代谢的影响
- 批准号:
RGPIN-2015-05413 - 财政年份:2018
- 资助金额:
$ 0.08万 - 项目类别:
Discovery Grants Program - Individual
In Situ Sensing of Chemicals Inside Three-dimensional Bacterial Matrices using Artificial Cells
使用人工细胞对三维细菌基质内的化学物质进行原位传感
- 批准号:
1808237 - 财政年份:2018
- 资助金额:
$ 0.08万 - 项目类别:
Standard Grant
NPIF: Cultured plant cells as platforms for the production of high value chemicals
NPIF:培养植物细胞作为生产高价值化学品的平台
- 批准号:
1948578 - 财政年份:2017
- 资助金额:
$ 0.08万 - 项目类别:
Studentship
Defining the Effects of Endocrine-Disrupting Chemicals on the Cellular Metabolism of Inflammatory Cells
定义内分泌干扰化学物质对炎症细胞代谢的影响
- 批准号:
RGPIN-2015-05413 - 财政年份:2017
- 资助金额:
$ 0.08万 - 项目类别:
Discovery Grants Program - Individual