WU-SN-TMC Bio-Analysis Core
WU-SN-TMC 生物分析核心
基本信息
- 批准号:10376527
- 负责人:
- 金额:$ 93.68万
- 依托单位:
- 依托单位国家:美国
- 项目类别:
- 财政年份:2021
- 资助国家:美国
- 起止时间:2021-09-30 至 2026-08-31
- 项目状态:未结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
Biological Analysis Core Summary/Abstract
Senescence is implicated in many human diseases and the elimination of senescent cells in model organisms
slows, and in some cases reverses many diseases. These findings raise hope that a detailed mechanistic
understanding of senescence will lead to novel therapies to treat human disease. Despite the importance of
cellular senescence, we lack robust methods to identify, isolate, and manipulate senescent cells. New
approaches and technologies position our team to comprehensively identify senescent cells. This, in turn, will
enable in-depth analyses of biomarkers, spatial distribution, behavior, and function of senescent cells across
human tissues and time in a high throughput manner. The primary goal for the Biological Analysis Core (BAC)
within Washington University Senescence Mapping Center (WU-SN-TMC) is to generate multi-omics and
imaging data to build high resolution, multi-dimensional atlases of cellular senescence across tissue types and
lifespan to facilitate basic and translational research. Although senescent cells are tracked by several known
markers, it is increasingly clear that not all senescent cells express the same set of markers and the usefulness
of individual senescent markers may be limited. Static universal tissue agnostic senescence markers may not
exist. Instead, there are likely dynamic senescence signatures (gene expression patterns anchored by frequent,
but unobligated presence of some of the “known” markers and others yet to be identified), that may differ with
cell type, age, and environmental stimuli. We propose using cutting edge enabling technologies at necessary
scale, depth, and resolution to identify such signatures while mapping senescent cells in various tissue
environments at different ages. We will map senescent cells and their associated phenotypes in four tissues
(bone marrow, breast, liver, and colon), chosen for their clinical importance, diversity, relevance to
senescence, and availability. We will utilize the highly successful infrastructure we have developed for several
large-scale projects as a springboard, combined with in-house expertise in senescence research, to generate
cellular senescence atlases with transcriptome-wide coverage, single cell resolution, and spatial registration.
We will use our experience in single cell omics to establish a comprehensive epigenetic and transcriptomic
landscape in targeted tissues. We will add the spatial dimension to build 2D and 3D molecular atlases by
incorporating spatial transcriptomics, CODEX, and light sheet microscopy. We will also use proteomics to study
the biomarkers and secretome of senescent cells. To validate our results, we will use established and newly
developed mouse models to track senescent cells at different ages with or without perturbations. These studies
will allow us to improve detection methods for senescent cells and validate biomarker signatures identified in
human studies. BAC will work closely with the other Cores within WU-SN-TMC to produce multi-dimensional
molecular and cellular senescence tissue atlases at unprecedented cellular resolution and gene coverage with
the highest efficiency possible.
生物学分析核心摘要/摘要
衰老与许多人类疾病和模式生物中衰老细胞的消除有关
减缓,在某些情况下逆转许多疾病。这些发现给我们带来了希望,
对衰老的理解将导致治疗人类疾病的新疗法。尽管重要的是
细胞衰老,我们缺乏可靠的方法来识别,分离和操纵衰老细胞。新
方法和技术使我们的团队能够全面识别衰老细胞。反过来,这将
能够深入分析衰老细胞的生物标志物、空间分布、行为和功能,
人组织和时间。生物分析核心(BAC)的主要目标
在华盛顿大学衰老绘图中心(WU-SN-TMC)内,
成像数据,以建立跨组织类型的细胞衰老的高分辨率、多维图谱,
生命周期,以促进基础和转化研究。尽管衰老细胞被几种已知的
随着标记物的增加,越来越清楚的是,并非所有的衰老细胞都表达相同的标记物组,
可能是有限的。静态通用组织不可知衰老标记物可能不会
存在.相反,可能存在动态衰老特征(基因表达模式由频繁,
但是一些“已知”标记和其他尚未鉴定的标记的非强制性存在),这可能与
细胞类型年龄和环境刺激。我们建议在必要时使用最先进的技术
在绘制各种组织中的衰老细胞时识别这些特征的尺度、深度和分辨率
不同年龄的环境。我们将绘制四种组织中的衰老细胞及其相关表型
(bone骨髓、乳腺、肝脏和结肠),根据其临床重要性、多样性、与
衰老和可用性。我们将利用我们多年来开发的非常成功的基础设施
以大型项目为跳板,结合衰老研究方面的内部专业知识,
具有转录组范围覆盖、单细胞分辨率和空间配准的细胞衰老图谱。
我们将利用我们在单细胞组学方面的经验,建立一个全面的表观遗传学和转录组学。
靶组织中的景观。我们将添加空间维度来构建2D和3D分子图谱,
整合了空间转录组学、CODEX和光片显微镜。我们还将使用蛋白质组学来研究
衰老细胞的生物标志物和分泌组。为了验证我们的结果,我们将使用现有的和新的
开发了小鼠模型来跟踪不同年龄的衰老细胞,有或没有扰动。这些研究
这将使我们能够改进衰老细胞的检测方法,并验证衰老细胞中鉴定的生物标志物特征。
人类研究BAC将与WU-SN-TMC内的其他核心密切合作,
以前所未有的细胞分辨率和基因覆盖率绘制分子和细胞衰老组织图谱,
尽可能高的效率。
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
FENG CHEN其他文献
FENG CHEN的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('FENG CHEN', 18)}}的其他基金
Impact of cancer predisposition on oncogenic process, microenvironment, and treatment
癌症易感性对致癌过程、微环境和治疗的影响
- 批准号:
10544995 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 93.68万 - 项目类别:
Impact of cancer predisposition on oncogenic process, microenvironment, and treatment
癌症易感性对致癌过程、微环境和治疗的影响
- 批准号:
10367242 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 93.68万 - 项目类别:
Creating high-resolution multi-omics molecular atlases for developing urogenital organs
创建用于发育泌尿生殖器官的高分辨率多组学分子图谱
- 批准号:
10356306 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 93.68万 - 项目类别:
Washington University Senescence Tissue Mapping Center (WU-SN-TMC)
华盛顿大学衰老组织图谱中心 (WU-SN-TMC)
- 批准号:
10376523 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 93.68万 - 项目类别:
Creating high-resolution multi-omics molecular atlases for developing urogenital organs
创建用于发育泌尿生殖器官的高分辨率多组学分子图谱
- 批准号:
10491224 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 93.68万 - 项目类别:
Washington University Senescence Tissue Mapping Center (WU-SN-TMC)
华盛顿大学衰老组织图谱中心 (WU-SN-TMC)
- 批准号:
10685417 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 93.68万 - 项目类别:
Creating high-resolution multi-omics molecular atlases for developing urogenital organs
创建用于发育泌尿生殖器官的高分辨率多组学分子图谱
- 批准号:
10673765 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 93.68万 - 项目类别:
Pathogenic Variant Discovery Across a Broad Spectrum of Human Diseases
跨多种人类疾病的致病变异发现
- 批准号:
9376872 - 财政年份:2017
- 资助金额:
$ 93.68万 - 项目类别:
相似国自然基金
自旋轨道力矩驱动非共线反铁磁Mn3Sn磁矩翻转研究
- 批准号:
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
Ti-Al-Sn-Zr-Mo-Si系高温钛合金的成分优化与服役行为研究
- 批准号:2025JJ30018
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
花岗岩中长石巨晶的成因与岩浆演化、成矿关系研究——以湘东地区W、Sn、Li、Ta成矿岩体为例
- 批准号:2025JJ80034
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
利用快时间阵列测量100Sn附近原子核激发态寿命
- 批准号:
- 批准年份:2025
- 资助金额:10.0 万元
- 项目类别:省市级项目
非谐作用下kagome金属ScV6Sn6及其类似
物中电荷密度波相关的多序相互作用的
第一性原理研究
- 批准号:
- 批准年份:2025
- 资助金额:10.0 万元
- 项目类别:省市级项目
基于简单共轭有机分子的有机-无机杂化Sn4+基金属卤化物磷光闪烁体的制备及高性能、柔性X射线成像研究
- 批准号:
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
Cu-15Ni-2.5Sn-1V-0.9Al-0.3Ti合金涂层的激光熔覆制备工艺与组织性能研究
- 批准号:2025JJ70339
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
极端温度环境下TiO2纳米颗粒增强Sn-Ag-Cu微焊点可靠性研究
- 批准号:
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
NAc-VP和NAc-SN投射通路中参与自愿运动的多巴胺受体类型神经元亚型及功能研究
- 批准号:JCZRLH202500838
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
基于合成生物学技术的裂殖壶菌sn-2DHA高效生产底盘构建与机制研究
- 批准号:
- 批准年份:2024
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
相似海外基金
Snペロブスカイト太陽電池の高効率化と高耐久化を実現する材料開発および界面制御
材料开发和界面控制以实现锡钙钛矿太阳能电池的更高效率和耐用性
- 批准号:
24KF0053 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 93.68万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
価数制御とシェル構築による高性能Sn系Pbフリーペロブスカイト量子ドットの創出
通过价态控制和壳层构建制备高性能锡基无铅钙钛矿量子点
- 批准号:
24KJ0453 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 93.68万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
Sn基合金を利用した新規正極活物質の開拓
使用锡基合金开发新型正极活性材料
- 批准号:
24K17518 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 93.68万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
トポロジカル結晶絶縁体(Pb,Sn)Teにおけるスピン軌道トルクの制御と応用
拓扑晶体绝缘体(Pb,Sn)Te中自旋轨道力矩的控制及应用
- 批准号:
23K23200 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 93.68万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Sn系ペロブスカイト半導体の薄膜界面の電子・構造制御
锡基钙钛矿半导体薄膜界面的电子和结构控制
- 批准号:
24H00481 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 93.68万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
分子技術を駆使したSN-38二量体設計と新規抗がん用ナノ薬剤の創出
利用分子技术设计SN-38二聚体并创建新型抗癌纳米药物
- 批准号:
22KF0036 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 93.68万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
大環状円盤型有機半導体を用いたSnペロブスカイト太陽電池の高性能化
利用大环盘状有机半导体提高锡钙钛矿太阳能电池的性能
- 批准号:
22KJ1747 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 93.68万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
Forecasting SN shells using deep learning for video predictions toward higher-resolution galaxy simulations
使用深度学习进行视频预测以实现更高分辨率的星系模拟来预测 SN 壳
- 批准号:
22KJ1153 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 93.68万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
Systematic investigations of low temperature Sn-Bi based solder alloys
低温Sn-Bi基焊料合金的系统研究
- 批准号:
LP210301248 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 93.68万 - 项目类别:
Linkage Projects
Precise measurement of charge density distribution of Sn unstable isotopes by advanced innovative SCRIT electron scattering
通过先进的创新 SCIT 电子散射精确测量 Sn 不稳定同位素的电荷密度分布
- 批准号:
23H05436 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 93.68万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (S)