DETERMINANTS OF SPECIFICITY IN PROTEIN/RNA INTERACTIONS
DETERMINANTS OF SPECIFICITY IN PROTEIN/RNA INTERACTIONS
批准号:
2447992
负责人:
JACK D KEENE
金额:
$9.24万
依托单位:
依托单位国家:
美国
项目类别:
财政年份:
1993
资助国家:
美国
项目状态:
已结题
起止时间:
1993-04-01 至 1998-04-30
关键词:
3T3 cells RNA RNA binding protein RNase protection assay X ray crystallography cell growth regulation chemical binding gel mobility shift assay gene expression high performance liquid chromatography immunoprecipitation messenger RNA molecular site mutant nuclear magnetic resonance spectroscopy nucleic acid chemical synthesis nucleic acid metabolism nucleic acid sequence protein purification protein sequence protein structure function protooncogene recombinant proteins site directed mutagenesis small nuclear ribonucleoproteins structural biology synthetic nucleotide tissue /cell culture transfection
中文摘要
该项目旨在阐明RNA的作用机制,
RNA结合蛋白家族(RRM家族)的识别,
一个共同的序列基序 RRM家族的新成员将是
使用简并核酸探测和抗体反应性分离。
分子遗传学和生物物理学方法将用于阐明氨基酸
RRM家族参与RNA结合特异性的酸性决定簇
在转录(La和Ro)和RNA加工中起作用的成员
(U1和U2 snRNP蛋白)。 其中一个目标将集中在一个新的神经元上-
我们发现一种称为Hel-N1特异性RRM蛋白能够影响细胞
当在培养的细胞中表达时增殖和分化。 我们
数据表明,Hel-N1可以结合RNA "不稳定序列",
癌蛋白和淋巴因子信息的非编码区,包括c-
myc、c-fos和GM-CSF。 我们建议研究Hel-N1和其他
RNA结合蛋白在RNA稳定性、生长控制和细胞增殖中的作用
转型 因此,这些研究将解决基本的
RNA识别和结合机制在许多水平上发挥作用
调节核酸-蛋白质
交互.
英文摘要
This project is directed at the elucidation of mechanisms of RNA
recognition by a family of RNA-binding proteins (RRM family) which have
a common sequence motif. Novel members of the RRM family will be
isolated using degenerate nucleic acid probing and antibody reactivity.
Molecular genetic and biophysical methods will be used to elucidate amino
acid determinants involved in RNA binding specificity by RRM family
members which function in transcription (La and Ro) and RNA processing
(U1 and U2 snRNP proteins). One aim will focus on a novel neuron-
specific RRM protein, termed Hel-N1, which we have found can affect cell
proliferation and differentiation when expressed in cultured cells. Our
data indicate that Hel-N1 can bind to RNA "instability sequences" in the
noncoding regions of oncoprotein and lymphokine messages, including c-
myc, c-fos and GM-CSF. We propose to study the role of Hel-N1 and other
RNA binding proteins in RNA stability, growth control and cellular
transformation. Therefore, these studies will address fundamental
mechanisms of RNA recognition and binding which function at many levels
of nucleic acid metabolism and which regulate nucleic acid-protein
interactions.
期刊论文(7)
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科研奖励(0)
会议论文
Overexpression of the arginine-rich carboxy-terminal region of U1 snRNP 70K inhibits both splicing and nucleocytoplasmic transport of mRNA.
U1 snRNP 70K 富含精氨酸的羧基末端区域的过度表达会抑制 mRNA 的剪接和核质转运。
DOI:
10.1101/gad.9.11.1400
发表时间:
1995
期刊:
Genes & development
影响因子:
10.5
作者:
[Romac,JM, Keene,JD]
通讯作者:
Keene,JD
The U1 small nuclear ribonucleoprotein (snRNP) 70K protein is transported independently of U1 snRNP particles via a nuclear localization signal in the RNA-binding domain.
U1 小核核糖核蛋白 (snRNP) 70K 蛋白通过 RNA 结合域中的核定位信号独立于 U1 snRNP 颗粒进行运输。
DOI:
10.1128/mcb.14.7.4662-4670.1994
发表时间:
1994
期刊:
Molecular and cellular biology
影响因子:
5.3
作者:
[Romac,JM, Graff,DH, Keene,JD]
通讯作者:
Keene,JD
Autoimmune epitopes in messenger RNA.
信使 RNA 中的自身免疫表位。
DOI:
10.1017/s1355838202021507
发表时间:
2002
期刊:
RNA (New York, N.Y.)
影响因子:
--
作者:
[Lipes,BarbaraD, Keene,JackD]
通讯作者:
Keene,JackD
RNA Dynamics of Transient Macromolecular Complexes in Cancer Cells
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批准号:9079771
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项目类别:
-
资助金额:$6.73万
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财政年份:2011
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负责人:JACK D KEENE
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依托单位:
RNA Dynamics of Transient Macromolecular Complexes in Cancer Cells
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批准号:8701882
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项目类别:
-
资助金额:$31.6万
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财政年份:2011
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负责人:JACK D KEENE
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依托单位:
RNA Dynamics of Transient Macromolecular Complexes in Cancer Cells
-
批准号:8309938
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项目类别:
-
资助金额:$32.58万
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财政年份:2011
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负责人:JACK D KEENE
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依托单位:
RNA Dynamics of Transient Macromolecular Complexes in Cancer Cells
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批准号:8504813
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项目类别:
-
资助金额:$30.62万
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财政年份:2011
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负责人:JACK D KEENE
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依托单位:
RNA Dynamics of Transient Macromolecular Complexes in Cancer Cells
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批准号:8147997
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项目类别:
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资助金额:$32.58万
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财政年份:2011
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负责人:JACK D KEENE
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依托单位:
POSTTRANSCRIPTIONAL GENE REGULATION IN T CELL ACTIVATION
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批准号:6194598
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项目类别:
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资助金额:$30.8万
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财政年份:2000
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负责人:JACK D KEENE
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依托单位:
POSTTRANSCRIPTIONAL GENE REGULATION IN T CELL ACTIVATION
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批准号:6604179
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项目类别:
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资助金额:$30.8万
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财政年份:2000
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负责人:JACK D KEENE
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依托单位:
POSTTRANSCRIPTIONAL GENE REGULATION IN T CELL ACTIVATION
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批准号:6510938
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项目类别:
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资助金额:$29.26万
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财政年份:2000
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负责人:JACK D KEENE
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依托单位:
POSTTRANSCRIPTIONAL GENE REGULATION IN T CELL ACTIVATION
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批准号:6374361
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项目类别:
-
资助金额:$30.8万
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财政年份:2000
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负责人:JACK D KEENE
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依托单位:
POSTTRANSCRIPTIONAL GENE REGULATION IN T CELL ACTIVATION
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批准号:6744055
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项目类别:
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资助金额:$30.8万
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财政年份:2000
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负责人:JACK D KEENE
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依托单位:
FUNCTION OF MAMMALIAN ELAV RNA BINDING PROTEINS
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批准号:6376979
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项目类别:
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资助金额:$31.16万
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财政年份:1999
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负责人:JACK D KEENE
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依托单位:
FUNCTION OF MAMMALIAN ELAV RNA BINDING PROTEINS
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批准号:6633326
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项目类别:
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资助金额:$32.67万
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财政年份:1999
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负责人:JACK D KEENE
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依托单位:
FUNCTION OF MAMMALIAN ELAV RNA BINDING PROTEINS
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批准号:6173739
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项目类别:
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资助金额:$30.44万
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财政年份:1999
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负责人:JACK D KEENE
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依托单位:
FUNCTION OF MAMMALIAN ELAV RNA BINDING PROTEINS
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批准号:6513435
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项目类别:
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资助金额:$31.91万
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财政年份:1999
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负责人:JACK D KEENE
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依托单位:
FUNCTION OF MAMMALIAN ELAV RNA BINDING PROTEINS
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批准号:2909860
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项目类别:
-
资助金额:$26.3万
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财政年份:1999
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负责人:JACK D KEENE
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依托单位:
DETERMINANTS OF SPECIFICITY IN PROTEIN-RNA INTERACTIONS
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批准号:2100696
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项目类别:
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资助金额:$33.49万
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财政年份:1993
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负责人:JACK D KEENE
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依托单位:
DETERMINANTS OF SPECIFICITY IN PROTEIN-RNA INTERACTIONS
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批准号:2100697
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项目类别:
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资助金额:$36.08万
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财政年份:1993
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负责人:JACK D KEENE
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依托单位:
DETERMINANTS OF SPECIFICITY IN PROTEIN-RNA INTERACTIONS
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批准号:2100698
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项目类别:
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资助金额:$37.73万
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财政年份:1993
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负责人:JACK D KEENE
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依托单位:
DETERMINANTS OF SPECIFICITY IN PROTEIN-RNA INTERACTIONS
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批准号:3203864
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项目类别:
-
资助金额:$34.2万
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财政年份:1993
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负责人:JACK D KEENE
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依托单位:
REPLICATIVE MECHANISMS OF THE NEGATIVE STRAND VIRUSES
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批准号:3126557
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项目类别:
-
资助金额:$19.83万
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财政年份:1979
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负责人:JACK D KEENE
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依托单位:
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RNA m6A修饰通过调控FDX1介导的铜死亡参与补阳还五汤抗脑缺血再灌注损伤作用机制的研究
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批准号:2026JJ81091
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批准号:2026JJ50010
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项目类别:省市级项目
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批准年份:2026
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负责人:应站明
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依托单位:
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项目类别:省市级项目
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批准号:JCZRLH202600588
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批准年份:2026
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