Développement d'outils pour l'identification des espèces de coraux dans des images en support aux suivis de l'état des récifs coralliens.

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L'ONU a déclaré 2010 « Année internationale de la biodiversité » et un des vastes volets est la protection des milieux aquatiques et des organismes vivants qui y habitent. Les effets de l'activité humaine sur cette biodiversité ne sont pas simples à démontrer, et pour bien comprendre le phénomène, diriger et justifier les actions à entreprendre, il est impératif de faire l'acquisition et l'analyse de données quantitatives. Afin d'étudier l'évolution temporelle et spatiale de l'intégrité écologique et de la diversité des récifs coralliens, des milliers de photographies sous marines sont acquises chaque année pour être analysées en vue d'effectuer le suivi d'indices de biodiversité, d'intégrité et de résilience. L'information qui présente une complexité très variable est traitée manuellement. L'automatisation du processus est primordiale pour accélérer le traitement des images et formaliser le processus d'identification afin d'assurer la crédibilité des analyses. La présente demande propose le développement de méthodes automatisées pouvant être utiles au suivi de l'intégrité écologique des récifs coralliens et autres écosystèmes naturels. Cette étude couvrira deux volets importants : 1)la segmentation automatisée de spécimens de corail dans des images numériques et 2)l'identification des espèces dans ces images segmentées. Notre contribution n'est pas de développer de nouveaux indices mais bien de fournir aux chercheurs du domaine de l'écologie les informations (espèces de corail, autres formes de vie, autres structures présentes, superficies occupées, cooccurrence, etc.) menant vers des mesures de la biodiversité, de la santé, de la résilience, de l'intégrité et de la composition de ces écosystèmes. Nous avons élaboré une première ébauche pour la segmentation non-supervisée et la classification des coraux (plus de 200 espèces) dans des images numériques, et croyons possible le développement d'un tel outil pour assister les écologistes dans leur mission.