Mesure de la méthylation de l'ADN par pyroséquençage

焦化反应中 ADN 甲基化的测量

• 批准号: RTI-2016-00554
• 负责人: Robert, Claude
• 金额: $ 10.42万
• 依托单位: Université Laval
• 依托单位国家: 加拿大
• 项目类别: Research Tools and Instruments
• 财政年份: 2015
• 资助国家: 加拿大
• 起止时间: 2015-01-01 至 2016-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://www.nserc-crsng.gc.ca/ase-oro/Details-Detailles_eng.asp?id=591487
• 关键词: Mesure; de; la; thylation; ADN

Grâce à des percées majeures au niveau technologique, l'efficacité du séquençage d'ADN s'est décuplé au cours de la dernière décennie ce qui en a fait décroître les coûts. Tous les secteurs de recherche bénéficient de ces avancées technologies associées à la génomique. Le défi d'aujourd'hui est de déterminer comment cette séquence d'ADN se traduit en caractéristiques physiques, en performances au niveau de l'élevage des animaux domestiques ou dans le développement de maladies. Au cours des dernières années, un niveau de complexité s'est ajouté au génome alors que l'on réalise que l'environnement dans lequel vit l'organisme peut influencer la façon dont la séquence d'ADN est lue à court et à long terme. Des perturbations environnementales aussi simples que la nutrition maternelle durant la gestation peuvent perturber l'expression des gènes pour la vie entière de la descendance. Ceci offre de nouvelles pistes pour enfin comprendre l'origine développementale des maladies ou comment l'environnement toxicologique ou les conditions d'élevage peuvent influencer le devenir des individus. Nous connaissons présentement plusieurs marques qui se déposent autours du génome pour en influencer l'expression et l'une d'entre elles est la méthylation de l'ADN. L'ajout de ce groupement chimique sur l'ADN influence l'expression des gènes et les membres de notre équipe travaillent à en comprendre les effets. La première étape de notre approche consiste à utiliser une des plateformes génomiques pour sonder le génome rapidement afin d'identifier des régions démontrant des différences de niveaux de méthylation. Lorsque ces régions sont identifiées, nous devons valider nos résultats avec une autre approche méthodologique cette fois-ci plus ciblée pour confirmer les premières observations. Présentement nous n'avons pas accès à l'appareil qui nous permet de le faire. L'appareil demandé est un pyroséquenceur qui permet de "lire" la séquence d'ADN. En traitant le matériel génétique chimiquement, il est possible de transformer toutes les bases d'ADN de type cytosine qui ne sont pas protégées par un groupement méthyl. Lors de la lecture, la présence de cytosines nous indique que ces bases étaient méthylées. En comparant la position et l'abondance des groupements méthyls entre des échantillons associés à des conditions physiologiques différentes, il est possible d'identifier des différences qui deviennent en quelque sorte des marqueurs épigénétique pour ces conditions pour poursuivre l'étude ou pour servir au développement d'un outil diagnostique. Ce manque d'accessibilité nuit grandement à notre compétitivité puisque nous accusons des retards dans l'achèvement de cette étape de validation cruciale pour la publication de nos résultats. L'étude de l'épigénome est en pleine émergence devenant la prochaine révolution génomique pour tous les secteurs de recherche (agriculture, biologie, médecine, etc.).

随着新技术的发展，ADN的安全性在最后一个阶段有所下降。图斯秘书处负责研究与性别有关的先进技术。《今日之战》是对ADN系列的一个决定性的评论，它具有身体特征，在Au的表演中Au能够提高家畜的水平，或者在疾病的预防中。Au cours des dernières années，un niveAu de complexité s'est ajouté Au génome alors que l'on realise que l'enement in l'enquel l'organisme lequel vit peut influencer la façon d'ADN séquence est lue à court et à long泰尔梅.孕妇杜兰特期间的营养扰动也会影响后代完整生命的表达。Ceci offre de nouvelles pestes for enfin comprendre l'origine déciliespementale des maladies or comment l'acetonnement toxicologique or les conditions d'élevage peuvent influencer le devenir des individuals.我们认识到多个品牌的存在，这些品牌对基因表达和基因中心的影响是ADN的甲基化。ADN上化学集团的影响对我们的工作人员和妇女的表达产生了影响。 我们的第一步是利用一个几何平台来快速识别甲基化差异区域。所有这些区域都是不可识别的，我们可以通过一种新的方法来验证我们的结果，这种方法可以用来确认最初的观测结果。请注意我们不能接近我们允许的服装。L'appareil demandé is un pyroséquenceur qui permet de“lire”la séquence d'ADN.在遗传化学物质中，Transformer可能包含胞嘧啶的ADN碱基，而胞嘧啶不是甲基。在演讲中，胞嘧啶的存在表明这些碱基是很好的甲基。通过比较不同生理条件下的药物组合的位置和分布，可以识别出不同类型的特异性标记，以满足Au诊断的条件。Ce manque d'accessibilité nuit grandement à notre compétitivité puisque nous delards dans l'achèvement de cette étape de validation cruciale pour la publication de nos résultats. L'étude de l'épigénome est en pleine émergence devenant la prochaine révolution génomique pour图斯les secretariat de recherche（agriculture，biologie，medicine，etc.）.