Molecular detection of cranberry fruit rot fungi and fungicide resistance management

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The worldwide cranberry economy is carried out by 14 countries. Approximately 30% of the global production comes from Canada alone where Québec and British Columbia represent 95% of the production. The most prejudicial disease to this production is cranberry fruit rot (CFR) caused by a complex of 12 fungal species. This disease complex can cause as much as 100% loss of production, leading to severe economic losses. Applications of fungicides are mainly used for disease control. Owing to the negative effects of these methods on biodiversity and public and environmental health, more economic and environmentally-friendly approaches are required to control the impact of CFR. This project will provide the first precise, up-to-date and large-scale description of the composition, distribution, evolution and extent of fungal species causing CFR in cranberry production in all major growing areas in Canada as it also relates to bordering states in the USA. The results will give predictive trends of CFR dynamic owing to climate change based on development disease patterns occurring in cranberry fields. An approach of this magnitude was inconceivable as recently as a few months ago until the development of an innovative molecular test by our team to simultaneously identify all 12 fungi causing CFR. This breakthrough offers partners an unprecedented window into one of the most limiting factors of cranberry production along with tools to develop targeted management strategies to implement integrated control approaches.#(cr)#(lf)La canneberge est cultivée dans 14 pays, dont le Canada qui représente à lui seul 30% de la production mondiale. Les provinces du Québec et de la Colombie Britannique produisent 95% des canneberges canadiennes et sont considérées comme les chefs de file de sa culture. La pourriture du fruit de la canneberge (PFC) qui est causée par un complexe de 12 espèces de champignons pathogènes, est la maladie la plus préjudiciable à la culture de la canneberge. La PFC peut causer jusqu'à 100% de perte de production et conduire à de sévères pertes économiques. L'application de fongicides est la méthode privilégiée pour réprimer la maladie. Considérant leurs effets négatifs sur la biodiversité et la santé publique, des approches plus économiques et respectueuses de l'environnement sont requises pour réduire l'impact de la PFC. Ce projet fournira la première description précise, à jour et à grande échelle de la composition, de la répartition, de l'évolution et de l'étendue des espèces fongiques responsables de la PFC dans la production de canneberges dans toutes les grandes zones de culture au Canada en lien avec la situation dans les états limitrophes des États-Unis. Les résultats donneront des tendances prédictives de la dynamique de la PFC en raison des changements climatiques survenant dans les champs de canneberges. Une approche de cette ampleur était inconcevable, jusqu'à ce que nous développions un test moléculaire permettant d'identifier simultanément les 12 champignons responsables de la PFC. Cette percée offre aux producteurs de canneberges une opportunité sans précédent de gestion sur l'un des facteurs les plus limitant de la production de canneberges. En parallèle, des outils pour élaborer des stratégies ciblées pourront être définis afin de mettre en oeuvre des approches de lutte intégrées.