Data Science
数据科学
基本信息
- 批准号:CRC-2018-00136
- 负责人:
- 金额:$ 8.74万
- 依托单位:
- 依托单位国家:加拿大
- 项目类别:Canada Research Chairs
- 财政年份:2021
- 资助国家:加拿大
- 起止时间:2021-01-01 至 2022-12-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
Recent genome sequencing technologies are generating unprecedented amounts of data. Unambiguous computational analysis of genomic data is of key importance for precision medicine. Here we propose novel algorithmic and data science methods that can infer important clinical information within the ambiguous parts of sequencing data in fast and cost-efficient manner. We also propose a comprehensive domain-specific framework for developing high-performance computational tools that can produce fast and scalable data processing software for different computer architectures. In collaboration with local and international research centers, we envision that the proposed methods will boost Canadian health care and research capabilities.
最近的基因组测序技术正在生成前所未有的数据。基因组数据的明确计算分析对于精确医学至关重要。在这里,我们提出了新颖的算法和数据科学方法,这些方法可以以快速且具有成本效益的方式在测序数据的模棱两可的部分中推断出重要的临床信息。我们还提出了一个全面的特定领域框架,用于开发高性能计算工具,该工具可以为不同的计算机架构生成快速且可扩展的数据处理软件。与地方和国际研究中心合作,我们设想提出的方法将提高加拿大的医疗保健和研究能力。
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
Numanagic, Ibrahim其他文献
ORMAN: Optimal resolution of ambiguous RNA-Seq multimappings in the presence of novel isoforms
- DOI:
10.1093/bioinformatics/btt591 - 发表时间:
2014-03-01 - 期刊:
- 影响因子:5.8
- 作者:
Dao, Phuong;Numanagic, Ibrahim;Sahinalp, S. Cenk - 通讯作者:
Sahinalp, S. Cenk
Seq: A High-Performance Language for Bioinformatics
- DOI:
10.1145/3360551 - 发表时间:
2019-10-01 - 期刊:
- 影响因子:1.8
- 作者:
Shajii, Ariya;Numanagic, Ibrahim;Amarasinghe, Saman - 通讯作者:
Amarasinghe, Saman
Allelic decomposition and exact genotyping of highly polymorphic and structurally variant genes
- DOI:
10.1038/s41467-018-03273-1 - 发表时间:
2018-02-26 - 期刊:
- 影响因子:16.6
- 作者:
Numanagic, Ibrahim;Malikic, Salem;Sahinalp, S. Cenk - 通讯作者:
Sahinalp, S. Cenk
SCALCE: boosting sequence compression algorithms using locally consistent encoding
- DOI:
10.1093/bioinformatics/bts593 - 发表时间:
2012-12-01 - 期刊:
- 影响因子:5.8
- 作者:
Hach, Faraz;Numanagic, Ibrahim;Sahinalp, S. Cenk - 通讯作者:
Sahinalp, S. Cenk
Cypiripi: exact genotyping of CYP2D6 using high-throughput sequencing data
- DOI:
10.1093/bioinformatics/btv232 - 发表时间:
2015-06-15 - 期刊:
- 影响因子:5.8
- 作者:
Numanagic, Ibrahim;Malikic, Salem;Sahinalp, S. Cenk - 通讯作者:
Sahinalp, S. Cenk
Numanagic, Ibrahim的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('Numanagic, Ibrahim', 18)}}的其他基金
Novel domain-specific languages and compiler optimization methods for computational biology
计算生物学的新颖的特定领域语言和编译器优化方法
- 批准号:
RGPIN-2019-04973 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 8.74万 - 项目类别:
Discovery Grants Program - Individual
Novel domain-specific languages and compiler optimization methods for computational biology
计算生物学的新颖的特定领域语言和编译器优化方法
- 批准号:
RGPIN-2019-04973 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 8.74万 - 项目类别:
Discovery Grants Program - Individual
Novel domain-specific languages and compiler optimization methods for computational biology
计算生物学的新颖的特定领域语言和编译器优化方法
- 批准号:
RGPIN-2019-04973 - 财政年份:2020
- 资助金额:
$ 8.74万 - 项目类别:
Discovery Grants Program - Individual
Novel domain-specific languages and compiler optimization methods for computational biology
计算生物学的新颖的特定领域语言和编译器优化方法
- 批准号:
DGECR-2019-00329 - 财政年份:2019
- 资助金额:
$ 8.74万 - 项目类别:
Discovery Launch Supplement
Novel domain-specific languages and compiler optimization methods for computational biology
计算生物学的新颖的特定领域语言和编译器优化方法
- 批准号:
RGPIN-2019-04973 - 财政年份:2019
- 资助金额:
$ 8.74万 - 项目类别:
Discovery Grants Program - Individual
Boosting compression of sequencing data using reordering
使用重新排序增强测序数据的压缩
- 批准号:
452424-2013 - 财政年份:2015
- 资助金额:
$ 8.74万 - 项目类别:
Vanier Canada Graduate Scholarship Tri-Council - Doctoral 3 years
Boosting compression of sequencing data using reordering
使用重新排序增强测序数据的压缩
- 批准号:
452424-2013 - 财政年份:2014
- 资助金额:
$ 8.74万 - 项目类别:
Vanier Canada Graduate Scholarship Tri-Council - Doctoral 3 years
相似国自然基金
网络即数据——基于生成式神经网络的高光谱图像压缩
- 批准号:42301437
- 批准年份:2023
- 资助金额:30.00 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
基于海量数据的地震智能检测方法及其在密集地震序列中的应用研究
- 批准号:42374081
- 批准年份:2023
- 资助金额:52.00 万元
- 项目类别:面上项目
利用FAST漂移扫描多科学目标同时巡天宽带谱线数据研究星系中性氢质量函数
- 批准号:12373012
- 批准年份:2023
- 资助金额:52.00 万元
- 项目类别:面上项目
地学数据中尺度转换关键科学问题研究及地学应用
- 批准号:
- 批准年份:2022
- 资助金额:273 万元
- 项目类别:重点项目
基于开源社区群体智能的数据科学程序性能优化技术研究
- 批准号:62202213
- 批准年份:2022
- 资助金额:30.00 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
相似海外基金
Opening Spaces and Places for the Inclusion of Indigenous Knowledge, Voice and Identity: Moving Indigenous People out of the Margins
为包容土著知识、声音和身份提供开放的空间和场所:使土著人民走出边缘
- 批准号:
477924 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 8.74万 - 项目类别:
Salary Programs
Data Science Course Hub: ボトムアップアプローチによるデータサイエンス教育の改善
数据科学课程中心:通过自下而上的方法改进数据科学教育
- 批准号:
24K15234 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 8.74万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
The role of nigrostriatal and striatal cell subtype signaling in behavioral impairments related to schizophrenia
黑质纹状体和纹状体细胞亚型信号传导在精神分裂症相关行为障碍中的作用
- 批准号:
10751224 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 8.74万 - 项目类别:
CAREER: Leveraging Data Science & Policy to Promote Sustainable Development Via Resource Recovery
职业:利用数据科学
- 批准号:
2339025 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 8.74万 - 项目类别:
Continuing Grant
CREST HBCU-RISE: Advancing Theoretical Artificial Intelligence Infrastructure for Modern Data Science Challenges
CREST HBCU-RISE:推进理论人工智能基础设施应对现代数据科学挑战
- 批准号:
2409093 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 8.74万 - 项目类别:
Continuing Grant