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Novel Algorithms for Detecting the Clonal Composition and Monitoring the Evolution of Tumours via Liquid Biopsies Sequencing Data

通过液体活检测序数据检测克隆组成和监测肿瘤进化的新算法

基本信息

批准号：
RGPIN-2017-05952
负责人：
Hach, Faraz
金额：
$ 1.89万
依托单位：
University of British Columbia
依托单位国家：
加拿大
项目类别：
Discovery Grants Program - Individual
财政年份：
2021
资助国家：
加拿大
起止时间：
2021-01-01 至 2022-12-31
项目状态：
已结题

来源：
https://www.nserc-crsng.gc.ca/ase-oro/Details-Detailles_eng.asp?id=734491
关键词：
Novel Algorithms Detecting Clonal Composition

项目摘要

algorithm design; liquid biopsy sequencing data analysis; next-generation sequencing data; tumour clonality detection; tumour evolution modelling; tumour specific SNV, SV, CNV discovery

算法设计;液体活检测序数据分析;下一代测序数据;肿瘤克隆性检测;肿瘤演变建模;肿瘤特异性SNV、SV、CNV发现

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

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Hach, Faraz其他文献

Structural variation and fusion detection using targeted sequencing data from circulating cell free DNA

DOI：
10.1093/nar/gkz067
发表时间：
2019-04-23
期刊：
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影响因子：
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作者：
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通讯作者：
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DOI：
10.1016/j.isci.2022.104530
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通讯作者：
Hach, Faraz

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发表时间：
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通讯作者：
Hach, Faraz

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DOI：
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通讯作者：
Sahinalp, S. Cenk

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DOI：
10.1038/s41588-022-01168-y
发表时间：
2022-09
期刊：
NATURE GENETICS
影响因子：
30.8
作者：
Baca, Sylvan C.;Singler, Cassandra;Zacharia, Soumya;Seo, Ji-Heui;Morova, Tunc;Hach, Faraz;Ding, Yi;Schwarz, Tommer;Huang, Chia-Chi Flora;Anderson, Jacob;Fay, Andre P.;Kalita, Cynthia;Groha, Stefan;Pomerantz, Mark M.;Wang, Victoria;Linder, Simon;Sweeney, Christopher J.;Zwart, Wilbert;Lack, Nathan A.;Pasaniuc, Bogdan;Takeda, David Y.;Gusev, Alexander;Freedman, Matthew L.
通讯作者：
Freedman, Matthew L.