核小体组蛋白H4被picNuA4复合物选择性乙酰化的结构基础
批准号:
31570731
项目类别:
面上项目
资助金额:
62.0 万元
负责人:
陈柱成
依托单位:
学科分类:
C0501.结构生物学
结题年份:
2019
批准年份:
2015
项目状态:
已结题
项目参与者:
张秋玉、周翠燕
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中文摘要
核小体组蛋白H4的乙酰化是一个被广泛研究的重要的表观遗传调控机制。它主要由NuA4/Tip60类蛋白质复合物催化完成。NuA4的催化中心是Esa1。单独的Esa1对核小体没有活性。只有形成一个NuA4的核心复合物picNuA4,它才能选择性地乙酰化核小体组蛋白H4。目前,已有大量的关于picNuA4的生物化学研究,以及单独的Esa1晶体结构和一个低分辨的picNuA4-核小体复合物的冷冻电镜结构。但是,这些研究并不能揭示picNuA4识别并乙酰化核小体H4的机理。在这个项目中,我们将联合使用x-射线晶体学和电子显微镜学的方法研究酵母picNuA4复合物的结构及其用对核小体的识别。我们将并根据酵母picNuA4的结构信息,进一步考察人源Tip60的工作机理。
英文摘要
Acetylation of nucleosome at histone H4 is a well-established epigenetic control in many nuclear processes, which is catalyzed by the NuA4 and Tip60 complexes in Saccharomyces cerevisiae and animal cells, respectively. While the free catalytic subunit Esa1 is inactive, formation of the picNuA4 core complex with Epl1 and Yng2 greatly enhances its activity and specificity toward the nucleosomal H4. Currently, there are substantial biochemical studies on picNuA4. The crystal structure of the Esa1 alone, and a low-resolution cryo-electron microscopic structure of the picNuA4-nucleosome complex are known. Yet, these studies still can not reveal the mechanism of how picNuA4 selectively acetylates the nucleosomal H4. In this proposal, we will study the structures of picNuA4 complex using X-ray crystallography, and the mechanism of nucleosome recognition using electron microscopy (EM). We will further investigate the mechanism of the human Tip60 complex based on the structural information of the yeast picNuA4.
核小体由147bpDNA缠绕组蛋白八聚体约约1.7圈组成。核小体是染色质的基本重复单元。核小体组蛋白H4的乙酰化是一个被广泛研究的重要的表观遗传调控机制。它主要由NuA4/Tip60类蛋白质复合物催化完成。NuA4的催化中心是Esa1。单独的Esa1对核小体没有活性。只有形成一个NuA4的核心复合物picNuA4,它才能选择性地乙酰化核小体组蛋白H4。目前,已有大量的关于picNuA4的生物化学研究,以及单独的Esa1晶体结构和一个低分辨的picNuA4-核小体复合物的冷冻电镜结构。但是,这些研究并不能揭示picNuA4识别并乙酰化核小体H4的机理。在这个项目中,我们将联合使用x-射线晶体学和电子显微镜学的方法研究酵母picNuA4复合物的结构及其用对核小体的识别。我们将并根据酵母picNuA4的结构信息,进一步考察人源Tip60的工作机理。
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Structures of the ISWI-nucleosome complex reveal a conserved mechanism of chromatin remodeling
ISWI-核小体复合物的结构揭示了染色质重塑的保守机制
DOI:10.1038/s41594-019-0199-9
发表时间:2019-04-01
期刊:NATURE STRUCTURAL & MOLECULAR BIOLOGY
影响因子:16.8
作者:Yan, Lijuan;Wu, Hao;Chen, Zhucheng
通讯作者:Chen, Zhucheng
Mechanism of chromatin remodelling revealed by the Snf2-nucleosome structure
Snf2-核小体结构揭示染色质重塑机制
DOI:10.1038/nature22036
发表时间:2017-04-27
期刊:NATURE
影响因子:64.8
作者:Liu, Xiaoyu;Li, Meijing;Chen, Zhucheng
通讯作者:Chen, Zhucheng
The NuA4 Core Complex Acetylates Nucleosomal Histone H4 through a Double Recognition Mechanism.
NuA4 核心复合物通过双重识别机制乙酰化核小体组蛋白 H4
DOI:10.1016/j.molcel.2016.07.024
发表时间:2016
期刊:Mol Cell
影响因子:--
作者:Xu Peng;Li Chengmin;Chen Zhihong;Jiang Shuanying;Fan Shilong;Wang Jiawei;Dai Junbiao;Zhu Ping;Chen Zhucheng
通讯作者:Chen Zhucheng
Landscape of the regulatory elements for lysine 2-hydroxyisobutyrylation pathway
赖氨酸2-羟基异丁酰化途径的调控元件概况
DOI:10.1038/cr.2017.149
发表时间:2018-01-01
期刊:CELL RESEARCH
影响因子:44.1
作者:Huang, He;Luo, Zhouqing;Zhao, Yingming
通讯作者:Zhao, Yingming
Structure and regulation of the chromatin remodeller ISWI
染色质重塑器 ISWI 的结构和调节。
DOI:10.1038/nature20590
发表时间:2016-12-15
期刊:NATURE
影响因子:64.8
作者:Yan, Lijuan;Wang, Li;Chen, Zhucheng
通讯作者:Chen, Zhucheng
染色质重塑蛋白推动形成核小体阵列的机理研究
- 批准号:32130016
- 项目类别:重点项目
- 资助金额:292万元
- 批准年份:2021
- 负责人:陈柱成
- 依托单位:
调控细胞分裂面位置的胞质分裂关键信号通路的传导机制研究
- 批准号:31630046
- 项目类别:重点项目
- 资助金额:263.0万元
- 批准年份:2016
- 负责人:陈柱成
- 依托单位:
胞质分裂中Anillin作为组织中心的作用机理研究
- 批准号:31270762
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:90.0万元
- 批准年份:2012
- 负责人:陈柱成
- 依托单位:
国内基金
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