中国人群X染色体上STR和InDel遗传标记的多态性研究

批准号:
81302620
项目类别:
青年科学基金项目
资助金额:
23.0 万元
负责人:
张素华
依托单位:
学科分类:
H2502.法医物证学及法医人类学
结题年份:
2016
批准年份:
2013
项目状态:
已结题
项目参与者:
孙宽、赵珍敏、胡真、赵书民
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中文摘要
亲缘关系鉴定是法医物证学研究的主要内容之一。依托短串联重复序列STR标记,基于毛细管电泳技术平台的多重荧光复合扩增分型技术是目前国内外的主要技术手段。目前,国内外所普遍使用的STR分型试剂盒主要局限在人类常染色体上,对于一些诸如缺少参照样本的祖母与孙女、同父姐妹等类型的案件,尚不能够提供有效的遗传信息。X染色体由于其独特的遗传规律,在上述类型的案件鉴定中具有重要的应用价值。目前,国内外对于X染色体上遗传标记的研究尚不多见。本课题拟在前期工作基础上,系统研究中国人群X染色体上的STR和InDel遗传标记,筛选出一组具有良好法医学应用价值在中国主要民族中具有通用性的X-STR基因座和X-InDel位点并建立相应的分型体系,不仅丰富了X染色体上的遗传信息,更能为特殊亲缘关系鉴定提供新的技术手段。
英文摘要
Paternity testing is one of the major contents of forensic genetics. Based on the platform of capillary electrophoresis, the multiple fluorescent PCR and genotyping technology is the main method for STR analysis. Nowadays, the generally applied STR genotyping kits were principally focused on studying of auto-chromosomes, which can’t provide effective genetic information for special cases such as the judgement of relationships between grandmother and granddaughter without any references or half-sib sisters with the same father, et al. By virtue of the unique genetic law of X chromosome, it plays an important role in the cases mentioned above. However, not so much studies were observed in the research of genetic markers on X chromosome today, national or international. Based on the previous working experiences, we intend to study genetic markers of STR and InDel on X chromosome in Chinese population systematically. Screening out a group of X-STR and X-InDel markers with excellent forensic application values which can be generally applied in the main nations of China and building a genotyping system accordingly is our final aim, which can not only enrich the genetic information study on X chromosome, but also provide a new technological method for special paternity testing.
亲缘关系鉴定是法医物证学研究的主要内容之一。依托短串联重复序列STR标记,基于毛细管电泳技术平台的多重荧光复合扩增分型技术是目前国内外的主要技术手段。目前,国内外所普遍使用的STR分型试剂盒主要局限在人类常染色体上,对于一些诸如缺少参照样本的祖母与孙女、同父姐妹等类型的案件,尚不能够提供有效的遗传信息。X染色体由于其独特的遗传规律,在上述类型的案件鉴定中具有重要的应用价值。目前,国内外对于X染色体上的遗传标记的研究尚不多见。针对X染色体遗传标记开发的国际商业化试剂盒仅有一个(德国Qiagen公司的Investigator X-12试剂盒)。本研究在前期工作基础上,系统研究中国人群X染色体上的STR和InDel遗传标记,筛选出一组具有良好法医学应用价值在中国主要民族中具有通用性的X-STR基因座和X-InDel位点并建立相应的分型体系,从灵敏度、特异性、准确性、重复性、样本的适用性、对混合物的分型能力这几个方面着手,对试剂盒进行了优化及评估。这一优化体系的构建为法医学进一步丰富了X染色体上的遗传信息,可为特殊亲缘关系鉴定提供新的技术手段。
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Population genetic study of 34 X-Chromosome markers in 5 main ethnic groups of China.
中国5个主要民族34个X染色体标记的群体遗传学研究。
DOI:10.1038/srep17711
发表时间:2015-12-04
期刊:Scientific reports
影响因子:4.6
作者:Zhang S;Bian Y;Li L;Sun K;Wang Z;Zhao Q;Zha L;Cai J;Gao Y;Ji C;Li C
通讯作者:Li C
DOI:--
发表时间:--
期刊:法医学杂志
影响因子:--
作者:张素华
通讯作者:张素华
Developmental validation of a custom panel including 273 SNPs for forensic application using Ion Torrent PGM
使用 Ion Torrent PGM 对包含 273 个 SNP 的定制面板进行开发验证,用于法医应用
DOI:10.1016/j.fsigen.2016.12.003
发表时间:2017
期刊:Forensic Science International-Genetics
影响因子:3.1
作者:Zhang Suhua;Bian Yingnan;Chen Anqi;Zheng Hancheng;Gao Yuzhen;Hou Yiping;Li Chengtao
通讯作者:Li Chengtao
Developmental validation of an X-Insertion/Deletion polymorphism panel and application in HAN population of China.
X-插入/缺失多态性panel的开发验证及其在中国汉族人群中的应用。
DOI:10.1038/srep18336
发表时间:2015-12-14
期刊:Scientific reports
影响因子:4.6
作者:Zhang S;Sun K;Bian Y;Zhao Q;Wang Z;Ji C;Li C
通讯作者:Li C
Parallel Analysis of 124 Universal SNPs for Human Identification by Targeted Semiconductor Sequencing.
通过靶向半导体测序对 124 个用于人类识别的通用 SNP 进行并行分析。
DOI:10.1038/srep18683
发表时间:2015-12-22
期刊:Scientific reports
影响因子:4.6
作者:Zhang S;Bian Y;Zhang Z;Zheng H;Wang Z;Zha L;Cai J;Gao Y;Ji C;Hou Y;Li C
通讯作者:Li C
基于multi-SNP标记及不拆分策略的复杂混合样本身份溯源研究
- 批准号:--
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:56万元
- 批准年份:2020
- 负责人:张素华
- 依托单位:
联合应用CE和MPS技术分析法医学混合样本的探索研究
- 批准号:81772028
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:55.0万元
- 批准年份:2017
- 负责人:张素华
- 依托单位:
国内基金
海外基金
