牛脂肪细胞增殖分化过程中关键候选lncRNA BADLNRs 的功能及其调控机制研究
批准号:
31672400
项目类别:
面上项目
资助金额:
62.0 万元
负责人:
蓝贤勇
依托单位:
学科分类:
家畜种质资源与遗传育种学
结题年份:
2020
批准年份:
2016
项目状态:
已结题
项目参与者:
潘传英、王小龙、杨欣、费攀锋、蔡含芳、孙晓梅、李辉、张晓燕、张思欢
中文摘要
脂肪细胞增殖分化是影响肉牛生长发育与肉质的重要因素之一,其机理研究有利于解决我国当前地方黄牛品种生长慢、产肉率低等问题。长链非编码RNA(lncRNAs)在物种间保守性低,对牛脂肪细胞增殖分化具有重要调控作用,但存在哪些关键lncRNAs及其功能、调控机制如何,尚不清楚。因此,本项目以秦川牛为对象,在已有前体脂肪细胞分化过程中差异表达lncRNA数据的基础上,鉴定出4个新lncRNA BADLNRs(即BADLNR1~4),利用功能获得与缺失策略研究它们对脂肪细胞增殖分化的调控作用,探索lncRNA-miRNA的共调控机理;此外,借助RIP、ChIRP等技术研究与BADLNRs相互作用的蛋白和染色质,阐明关键lncRNA-miRNA-靶蛋白对牛脂肪细胞增殖分化的具体调控机制。该项目旨在阐明关键候选lncRNAs在脂肪增殖分化过程中的功能与调控机制,为肉牛快速生长与肉质改良奠定基础。
英文摘要
Proliferation and differentiation of adipocyte is one of the most important factors for growth and development and meat quality in beef cattle. Its mechanism understanding will help us solve the problems of low growth rate and meat production in Chinese yellow cattle. Long non-coding RNAs (lncRNAs), which are not very conserved across species, play a significant role during the cattle preadipocyte proliferation and differentiation. However, we do not know the detailed crucial lncRNAs in adipocyte proliferation and differentiation, as well as their function and regulation mechanism are still unknown. Base on above facts, we intend to combine the existing data we have obtained from screening differentially expressed lncRNAs in progress of preadipocyte maturation, and we will identify four novel lncRNA BADLNRs (bovine adipocyte differentiation lncRNAs), namely, BADLNR1~4. Using overexpression and silence strategy, the function and regulation mechanisms of these candidate lncRNAs will be studied in adipocyte proliferation and differentiation, as well as their co-regulation mechanism with lncRNA-miRNA will be analyzed. In addition, the RIP and ChIRP techniques will be used to detect those proteins and chromatins interacting with BADLNRs, to elucidate the regulation mechanisms of lncRNA-miRNA-target protein process controlling the cattle adipocyte proliferation and differentiation. Briefly, this study aims to clarify functions and regulatory mechanisms of the key candidate lncRNAs in the preadipocyte proliferation and differentiation. These results will provide a solid theoretical foundation to improve beef cattle growth rate and meat quality.
本项目以牛脂肪细胞为主要研究实验对象,探讨脂肪发育过程中关键候选lncRNA对脂肪发育的调控作用及功能机制。本项目在实验室前期牛脂肪细胞lncRNA测序结果中筛选了候选lncRNAs,同时结合秦川牛脂肪细胞的miRNA高通量测序结果,筛选并鉴定了脂肪发育过程中关键lncRNAs功能及其竞争性吸附miRNAs调控脂肪沉积的分子机制。本研究成功克隆了牛脂肪细胞增殖分化相关6个lncRNA 全长,并解析了其分子特征,并发现它们在物种间保守性低;利用功能获得与缺失策略研究了lncRNA BADLNR1、BADLNR2、BADLNR4、BADLNR5、lncCCPG1和lncSLC30A9等对脂肪细胞增殖分化和凋亡的调控作用,并解析了lncRNA BADLNR4-miR-204、lncCCPG1-miR-93、lncSLC30A9-miR-93共调控脂肪沉积的机理;借助ChIRP-Seq等技术发现了lncSLC30A9-FOS蛋白、lncCCPG1-FOS蛋白以及BADLNCR1-GLRX5等互作调控脂肪细胞的增殖分化。本研究阐明了关键lncRNAs-miRNA以及lncRNAs-miRNA-靶蛋白对牛脂肪细胞增殖分化的具体调控机制,为提高肉牛生长速度与肉质提供科学资料。此外,为推进脂肪增殖分化相关lncRNA及靶基因的育种应用,本研究还揭示BADLNR4、BADLNR5、miR-204和sirt1基因遗传变异与牛体重等性状显著相关,可作为选育的有效遗传标记,为肉牛快速生长与肉质改良奠定基础。基于以上研究成果,本项目已发表SCI论文16篇,其中IF>5.0的SCI论文4篇,中科院大类二区及以上SCI论文8篇,授权国家发明专利2项、获批软件著作权4项。
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DOI:
10.3969/j.issn.1674-7968.2017.03.016
发表时间:
2017
期刊:
农业生物技术学报
影响因子:
作者:
[周凤燕, 杨青, 朱熙春, 蓝贤勇, 陈宏]
通讯作者:
陈宏
The 10 bp duplication insertion/deletion in the promoter region within paired box 7 gene is associated with growth traits in cattle
配对框 7 基因内启动子区域的 10 bp 重复插入/缺失与牛的生长性状相关
DOI:
10.5194/aab-59-469-2016
发表时间:
2016-11
期刊:
Archives Animal Breeding
影响因子:
1.8
作者:
[Jin Yunyun, Cai Hanfang, Liu Jiming, Lin Fengpeng, Qi Xinglei, Bai Yueyu, Lei Chuzhao, Chen Hong, Lan Xianyong]
通讯作者:
Lan Xianyong
Identification of a Novel Polymorphism in Bovine lncRNA ADNCR Gene and Its Association with Growth Traits
牛lncRNA ADNCR基因新多态性的鉴定及其与生长性状的关联
DOI:
10.1080/10495398.2018.1456446
发表时间:
2019-04-03
期刊:
ANIMAL BIOTECHNOLOGY
影响因子:
3.7
作者:
[Jin, Yunyun, Yang, Qing, Lan, Xianyong]
通讯作者:
Lan, Xianyong
The developmental transcriptome sequencing of bovine skeletal muscle reveals a long noncoding RNA, lncMD, promotes muscle differentiation by sponging miR-125b
牛骨骼肌发育转录组测序揭示长非编码 RNA lncMD 通过海绵 miR-125b 促进肌肉分化
DOI:
10.1016/j.bbamcr.2016.08.014
发表时间:
2016-11-01
期刊:
BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-MOLECULAR CELL RESEARCH
影响因子:
5.1
作者:
[Sun, Xiaomei, Li, Mingxun, Chen, Hong]
通讯作者:
Chen, Hong
DOI:
--
发表时间:
2017
期刊:
农业生物技术学报
影响因子:
--
作者:
[周凤燕, 杨青, 朱熙春, 蓝贤勇, 陈宏]
通讯作者:
陈宏
共 20 条
牛前体脂肪细胞增殖分化过程中可翻译circRNAs鉴定及其功能与调控机制研究
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批准号:32372852
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项目类别:面上项目
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资助金额:50万元
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批准年份:2023
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负责人:蓝贤勇
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依托单位:
牛前体脂肪细胞增殖分化过程中关键环状RNA circADs的鉴定及调控机制研究
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批准号:31872331
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项目类别:面上项目
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资助金额:59.0万元
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批准年份:2018
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负责人:蓝贤勇
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依托单位:
奶山羊HPA轴关键基因甲基化修饰的时空特征及其与SNP共调控泌乳性能研究
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批准号:31172184
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项目类别:面上项目
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资助金额:62.0万元
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批准年份:2011
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负责人:蓝贤勇
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依托单位:
国内基金
海外基金