INAD/TRP蛋白复合物相互作用的分子机制研究
结题报告
批准号:
31400647
项目类别:
青年科学基金项目
资助金额:
25.0 万元
负责人:
刘伟
依托单位:
学科分类:
C0502.分子生物物理
结题年份:
2017
批准年份:
2014
项目状态:
已结题
项目参与者:
朱海丽、蒋日婷、刘海洋、游霞
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中文摘要
经典的PDZ结构域结合模式是一种较弱的相互作用,解离常数约为数个-数几十μM。在需要结合特异性很高的区域(如神经突触后膜),这种结合模式并不能解释PDZ结构域与目标蛋白结合的高特异性。本课题组在前期工作中发现INAD和TRP的相互作用模式很可能是一种新的PDZ结合模式。因此我们拟采用分子生物学与生物化学的方法,分别表达、纯化和优化INAD与TRP蛋白的相互作用区域,用分析型超速离心技术测定两者相互作用的结合常数,然后以X射线衍射的方法解析INAD/TRP蛋白复合物的晶体结构,最后通过一系列定点突变实验来验证该结构的准确性。通过解析INAD/TRP蛋白复合物结构,本课题组将有望发现一种新的PDZ结合目标蛋白的模式;而这种结合模式,在目前的技术手段下是无法通过传统的大规模筛选得到的。这一预期成果,将为日后筛选新的PDZ结合蛋白提供线索,同时也将为体外重组INAD信号转导复合物的研究打下基础。
英文摘要
The canonical binding mode of PDZ domain is a relative weak interaction. The binding affinity between PDZ domain and its target is about several to tens of μM. In some regions of cell (for example, postsynaptic density), this kind of weak interaction can not explain the high specificity that the PDZ domains required for the interaction with their targets. In our previous study, we found that the interaction mode of INAD/TRP complex may be a novel interaction mode. To test this hypothesis, the binding regions in INAD and TRP protein will be expressed, purified and their boundaries will be optimized. The binding affinity between INAD and TRP will be measured by analytical ultracentrifugation and the INAD/TRP complex structure will be solved by X-ray crystallography method. Finally, point mutations will be used to verify the accuracy of the complex structure. By solving the crystal structure of INAD/TRP complex, we aim to discover a novel binding mode of PDZ/target interaction. And this novel binding mode can not be screened out by traditional phage-display or peptide-array techniques. The discovery of this novel binding mode will provide some clues for screening new PDZ binding targets and also the structural basis for reconstitution of the INAD signal complex in vitro in the future.
经典的PDZ结构域结合模式是一种较弱的相互作用,解离常数约为数个-数几十μM。在需要结合特异性很高的区域(如神经突触后膜),这种结合模式并不能解释PDZ结构域与目标蛋白结合的高特异性。本课题组在前期工作中发现INAD和TRP的相互作用模式很可能是一种新的PDZ结合模式,因此我们通过分子生物学与生物化学的方法,分别表达、纯化和优化了INAD与TRP蛋白的相互作用区域,用分析型超速离心技术测定了两者相互作用的结合常数,然后以X射线衍射的方法解析了INAD/TRP蛋白复合物的晶体结构。通过解析和生化验证INAD/TRP蛋白的复合物结构,我们发现了一种全新的PDZ结合目标蛋白的模式;而这种结合模式,在目前的技术手段下是无法通过传统的大规模筛选得到的。这一成果,将为日后筛选新的PDZ结合蛋白提供了新的线索,同时也将为体外重组INAD信号转导复合物的研究打下了基础。
期刊论文列表
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Myosin III-mediated cross-linking and stimulation of actin bundling activity of Espin
肌球蛋白 III 介导的交联和刺激 Espin 的肌动蛋白成束活性。
DOI:10.7554/elife.12856
发表时间:2016-01-19
期刊:ELIFE
影响因子:7.7
作者:Liu, Haiyang;Li, Jianchao;Zhang, Mingjie
通讯作者:Zhang, Mingjie
Biochemical and structural characterization of MUPP1-PDZ4 domain from Mus musculus.
小家鼠 MUPP1-PDZ4 结构域的生化和结构特征。
DOI:10.1093/abbs/gmv002
发表时间:2015-03
期刊:Acta Biochimica et Biophysica Sinica
影响因子:3.7
作者:Zhu Haili;Liu Zexu;Huang Yuxin;Zhang Chao;Li Gang;Liu Wei
通讯作者:Liu Wei
DOI:--
发表时间:2016
期刊:中国生物化学与分子生物学报
影响因子:--
作者:游霞;刘海洋;刘伟
通讯作者:刘伟
DOI:10.1016/j.bbrc.2016.04.059
发表时间:2016
期刊:Biochemical and Biophysical Research Communications
影响因子:3.1
作者:Wang Yue;Li Qingxia;Zheng Yunhua;Li Gang;Liu Wei
通讯作者:Liu Wei
DOI:--
发表时间:2016
期刊:中国生物化学与分子生物学报
影响因子:--
作者:郑云华;刘伟
通讯作者:刘伟
DKK1棕榈酰化修饰调控膀胱癌发生发展的机制研究
  • 批准号:
    82302920
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    30万元
  • 批准年份:
    2023
  • 负责人:
    刘伟
  • 依托单位:
维生素D通过AMPK/SIRT1/PGC-1α调控线粒体动力学改善2型糖尿病胰岛素抵抗的研究
  • 批准号:
    --
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    30万元
  • 批准年份:
    2022
  • 负责人:
    刘伟
  • 依托单位:
烟曲霉环化酶相关蛋白影响侵袭性曲霉病发生的机制
  • 批准号:
    81971912
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    54.0万元
  • 批准年份:
    2019
  • 负责人:
    刘伟
  • 依托单位:
磷脂酶Cβ介导的光导蛋白质机器装配与调控的分子机理研究
  • 批准号:
    31870746
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    59.0万元
  • 批准年份:
    2018
  • 负责人:
    刘伟
  • 依托单位:
EPH受体SAM结构域介导的SAM-SAM特异性互作的分子机制研究
  • 批准号:
    31670765
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万元
  • 批准年份:
    2016
  • 负责人:
    刘伟
  • 依托单位:
影响病原性曲霉对唑类药物敏感性的新基因编码蛋白及其在耐药性中的作用机制
  • 批准号:
    81671990
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万元
  • 批准年份:
    2016
  • 负责人:
    刘伟
  • 依托单位:
念珠菌血症常见病原真菌对唑类药物耐药性的分子演化研究
  • 批准号:
    81471925
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    80.0万元
  • 批准年份:
    2014
  • 负责人:
    刘伟
  • 依托单位:
以Afyap1调控的信号通路为手段研究烟曲霉对新型药物敏感性改变的新机制
  • 批准号:
    30970131
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    30.0万元
  • 批准年份:
    2009
  • 负责人:
    刘伟
  • 依托单位:
中国古代陶瓷的色度学研究
  • 批准号:
    50572002
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    25.0万元
  • 批准年份:
    2005
  • 负责人:
    刘伟
  • 依托单位:
逆转烟曲霉交叉耐药为敏感的分子机制
  • 批准号:
    30500027
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    28.0万元
  • 批准年份:
    2005
  • 负责人:
    刘伟
  • 依托单位:
国内基金
海外基金