以蓝藻果糖-1,6-二磷酸醛缩酶和水解酶为靶标的一剂双靶新型抑藻剂的合理设计与优化研究
批准号:
21572077
项目类别:
面上项目
资助金额:
65.0 万元
负责人:
万坚
依托单位:
学科分类:
药物化学生物学
结题年份:
2019
批准年份:
2015
项目状态:
已结题
项目参与者:
饶立、陈海峰、池波、肖闪、覃念、朱昊、黄运远、吴珏、尚欢
中文摘要
综合运用现代分子模拟方法(包括我们发展的计算策略和方法)、分子生物学技术(克隆表达纯化、定点突变等)、光谱分析技术(荧光、圆二色谱等)、化合物合成技术等,在分子、原子乃至电子的层次上研究蓝藻光合作用卡尔文循环中偶联的关键调控酶Cy-FBA和Cy-FBPase,阐明其结构、功能、性质及其与活性调控分子的相互作用的分子机理。在此基础上,进行多轮循环的全新双靶酶抑制剂的生物合理设计、筛选与合成优化研究,以期最终获得具有高效抑制活性的全新双靶酶抑藻剂先导化合物。本项目有望为我国以光合系统中重要调控酶为新靶标的绿色农药创制工作提供一些建设性的研究思路和前期基础。
英文摘要
Cyanobacteria class II fructose-1,6-bisphoshate aldolase (Cy-FBA) and cyanobacteria fructose-1,6-bisphosphatase (C-FBPase) are two neighboring key regulatory enzymes in the Calvin cycle of the cyanobacteria photosynthesis system. Each of them might be taken as a potential target for designing novel inhibitors to chemically control harmful algal blooms (HABs). In the present project, based upon the structure and catalyic regulatory mechanism,a series of novel dual-targets inhibitors are scheduled to be rationally designed, synthesized, and optimized against both the Cy-FBA and Cy-FBPase for HABs chemical control, and their inhibitory activities are scheduled to be examined both in vitro and in vivo.
蓝藻是地球上最古老的生物物种之一,其光合系统常被视为植物的简化模型。本项目以模式蓝藻--集胞藻PCC 6803的光合系统中的卡尔文循环中偶联的重要调控酶(Cy-FBA和Cy-FBPase)为研究对象,综合运用现代分子模拟方法、分子生物学技术、仪器分析表征技术、有机合成技术等,在分子、原子乃至电子的层次上阐述了其结构、功能、性质及其与活性调控分子的相互作用的分子机理。通过本项的研究,我们取得了如下进展:一、详细探究了金属离子、pH值、温度等因素对Cy-FBA酶活的影响,成功解析了白色念珠菌的II型FBA的晶体结构,这为Cy-FBA晶体结构的生长和解析提供了重要前期研究基础;二、发展了一种高精度靶标蛋白-抑制剂打分策略(CSAMP);三、分别根据Cy-FBPase和Cy-FBA活性中心的关键药效团信息,运用基于碎片药物设计程序从头设计了硫脲类和马来亚胺类(Y系列)新型Cy-FBA抑制剂先导化合物,并探究了其结合模式;运用“一剂双靶”合理设计策略与方法进行全新双靶酶(Cy-FBA和Cy-FBPase)抑制剂(N系列)的生物合理设计、筛选与合成优化研究;四、发现了具有高效抑藻活性的异硫氰酸盐类“绿色”杀藻剂;五、进行了FBPase和FBA酶家族的拓展研究,首次发现了人体FBPase (Hu-FBPase)酶新位点及其“降糖降脂”双功能共价抑制剂,合理设计并优化了新型Ca-FBA抑制剂先导化合物,成功解析了Hu-FBPase与底物的复合物晶体结构。六、发展了一种基于碎片的共价药物从头设计程序(Cov_FB3D)。
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DOX: A new computational protocol for accurate prediction of the protein-ligand binding structures
DOX:一种新的计算协议,用于准确预测蛋白质-配体结合结构
DOI:
10.1002/jcc.24217
发表时间:
2016
期刊:
Journal of Computational Chemistry
影响因子:
3
作者:
[Rao Li, Chi Bo, Ren Yanliang, Li Yongjian, Xu Xin, Wan Jian]
通讯作者:
Wan Jian
Discovery of novel allosteric site and covalent inhibitors of FBPase with potent hypoglycemic effects
发现具有有效降血糖作用的新型变构位点和 FBPase 共价抑制剂
DOI:
10.1016/j.ejmech.2019.111749
发表时间:
2019
期刊:
European Journal of Medicinal Chemistry
影响因子:
6.7
作者:
[Huang Yunyuan, Wei Lin, Han Xinya, Chen Haifeng, Ren Yanliang, Xu Yanhong, Song Rongrong, Rao Li, Su Chen, Peng Chao, Feng Lingling, Wan Jian]
通讯作者:
Wan Jian
A Rational Design, Synthesis, Biological Evaluation and Structure Activity Relationship Study of Novel Inhibitors against Cyanobacterial Fructose-1,6-bisphosphate Aldolase
蓝藻果糖1,6-二磷酸醛缩酶新型抑制剂的合理设计、合成、生物学评价及构效关系研究
DOI:
10.1021/acs.jcim.5b00618
发表时间:
2016
期刊:
Journal of Chemical Information and Modeling
影响因子:
5.6
作者:
[Han Xinya, Zhu Xiuyun, Zhu Shuaihua, Wei Lin, Hong Zongqin, Guo Li, Chen Haifeng, Chi Bo, Liu Yan, Feng Lingling, Ren Yanliang, Wan Jian]
通讯作者:
Wan Jian
Synthesis and biological evaluation of novel inhibitors against 1,3,8-trihydroxynaphthalene reductase from Magnaporthe grisea
新型稻瘟病菌1,3,8-三羟基萘还原酶抑制剂的合成及生物学评价
DOI:
10.1016/j.bmc.2016.01.053
发表时间:
2016-03-15
期刊:
BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY
影响因子:
3.5
作者:
[Chen, Haifeng, Han, Xinya, Wan, Jian]
通讯作者:
Wan, Jian
Design, synthesis and algicides activities of thiourea derivatives as the novel scaffold aldolase inhibitors
新型支架醛缩酶抑制剂硫脲衍生物的设计、合成及其杀藻活性
DOI:
10.1016/j.bmc.2019.01.023
发表时间:
2019
期刊:
Bioorganic & Medicinal Chemistry
影响因子:
3.5
作者:
[Xiao Shan, Wei Lin, Hong Zongqin, Rao Li, Ren Yanliang, Wan Jian, Feng Lingling]
通讯作者:
Feng Lingling
共 9 条
靶向FBPase共价变构新位点C128的新型共价抑制剂的合理设计、合成优化及其调控机理的研究
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批准号:--
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项目类别:面上项目
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资助金额:60万元
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批准年份:2021
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负责人:万坚
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依托单位:
基于CSAMP策略构建准确预测蛋白-配体结合构象新方法的研究
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批准号:21873035
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项目类别:面上项目
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资助金额:66.0万元
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批准年份:2018
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负责人:万坚
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依托单位:
人体肝脏果糖-1,6-二磷酸酶活性中心与活性分子相互作用的机理及其调控研究
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批准号:21373094
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项目类别:面上项目
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资助金额:80.0万元
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批准年份:2013
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负责人:万坚
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依托单位:
“一剂双靶”稻瘟菌新型杀菌剂先导结构的生物合理设计与筛选
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批准号:21172089
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项目类别:面上项目
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资助金额:60.0万元
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批准年份:2011
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负责人:万坚
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依托单位:
II型HMG-CoA还原酶活性中心与其配体相互作用的机理及其高效抑制剂的研究
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批准号:20873049
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项目类别:面上项目
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资助金额:31.0万元
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批准年份:2008
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负责人:万坚
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依托单位:
农作物真菌CYP51活性中心与底物、配体相互作用机理的化学生物学研究
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批准号:20672041
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项目类别:面上项目
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资助金额:28.0万元
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批准年份:2006
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负责人:万坚
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依托单位:
细菌光合作用反应中心的电子激发、转移过程的理论研究
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批准号:20203009
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:20.0万元
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批准年份:2002
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负责人:万坚
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依托单位:
国内基金
海外基金