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烟草依赖RNA 的RNA 聚合酶I(NtRDR1)抑制抗病基因沉默的机理研究

批准号:
31101423
项目类别:
青年科学基金项目
资助金额:
22.0 万元
负责人:
房媛媛
学科分类:
植物病理学
结题年份:
2014
批准年份:
2011
项目状态:
已结题
项目参与者:
董丽、赵建华
关键词:

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项目成果

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中文摘要
在植物中依赖RNA的RNA 聚合酶1(RNA-dependent RNA polymerase1,RDR1)受病毒侵染和SA处理诱导,具有抗病毒作用;RDR6则通过参与病毒诱导的基因沉默起到抗病毒作用。在一种本明烟(Nicotiana benthamiana)烟草中,RDR1基因含有一个72碱基的插入导致功能缺失(NbRDR1m)。我们在本明烟中高表达和NbRDR1m 高度同源的普通烟RDR1(NtRDR1),发现:NtRDR1转基因植物和RDR6被沉默(RDR6i)植物相似,对一些病毒更加敏感;进一步研究发现NtRDR1能抑制依赖RDR6产生的siRNA的沉默活性,而拟南芥RDR1(AtRDR1)则没有沉默抑制效应(PLANT CELL,2010)。本项目旨在深入探究NtRDR1抑制基因沉默的机制;结合对AtRDR1的功能比较研究,探究不同植物RDR1在植物生长发育和抗病途径的功能分化。
英文摘要
基于我们前期研究的发现:NtRDR1抑制RNA沉默作用但不抑制依赖RDR6的siRNAs 的产生,和RNA沉默途径,我们推测NtRDR1作用在siRNAs产生的下游,可能通过结合siRNA,或通过结合AGO蛋白,或抑制siRNA-AGO复合体对靶基因的剪切作用等方式抑制基因沉默。所以本项目的主要研究工作包括:在NtRDR1转基因烟草和拟南芥中,通过CO-IP实验,特异沉淀NtRDR1蛋白,检测NtRDR1与植物内源小RNAs以及AGOs的结合情况,但是实验过程中发现转基因植物中NtRDR1蛋白表达量很低,难以纯化。同时我们构建NtRDR1原核表达载体,希望获得NtRDR1蛋白,体外检测NtRDR1的结合siRNA及与AGOs互作情况,很遗憾的是我们尝试了多种表达条件后,发现NtRDR1主要在包涵体中表达,表达量非常低,难于获得纯化蛋白。不过有趣的是,我们发现在NtRDR1转基因拟南芥中ta-siR255的靶标基因At5G18040的RNA积累水平明显低于野生型,这和我们之前发现的在NtRDR1转基因烟草中syn-tasiRNA靶标基因GFP的积累量明显提高(Ying et al.,2010,Plant Cell)有所不同。我们的结果提示NtRDR1在参与植物沉默内源基因和外源基因的不同作用。相关研究工作仍在进行。另外,我们正利用最新的基因组编辑技术CRISPR/Cas9技术敲除普通烟中的NtRDR1基因,获得转基因植物后将直接研究NtRDR1在植物生长发育和抗病途径的功能分化。. 因研究需要构建小RNAs库;并应邀参与编写分子生物学实验方法一章节-基因沉默核心组分小RNAs的克隆方法。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
DOI: 10.1371/journal.pone.0035306
发表时间: 2012
期刊: PloS one
影响因子: 3.7
作者: [Xu N, Li Y, Zhao YT, Guo L, Fang YY, Zhao JH, Wang XJ, Huang L, Guo HS]
通讯作者: Guo HS
Cloning and profiling of small RNAs from cucumber mosaic virus satellite RNA.
黄瓜花叶病毒卫星 RNA 中小 RNA 的克隆和分析。
DOI: 10.1007/978-1-4939-1743-3_9
发表时间: 2015
期刊: Methods Mol Biol
影响因子: --
作者: [Fang, Yuan-Yuan, Smith, Neil A, Zhao, Jian-Hua, Lee, Joanne R M, Guo, Hui-Shan, Wang, Ming-Bo]
通讯作者: Wang, Ming-Bo
miR1885及其诱导的phasiRNAs在油菜与芜菁花叶病毒TuMV互作中的功能研究
  • 批准号:
    31970157
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    58.0万元
  • 批准年份:
    2019
  • 负责人:
    房媛媛
  • 依托单位:
国内基金
海外基金