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利用全外显子捕获测序技术寻找中国人2型糖尿病的易感基因
结题报告
批准号:
81170735
项目类别:
面上项目
资助金额:
58.0 万元
负责人:
胡承
依托单位:
学科分类:
H0708.糖尿病
结题年份:
2015
批准年份:
2011
项目状态:
已结题
项目参与者:
沈丽、王婕、魏伟、华飞、沈云岳、虞伟慧、秦雯、王申奇
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中文摘要
2型糖尿病是一个由遗传和环境因素共同参与的复杂疾病。尽管全基因组关联研究已发现43个2型糖尿病易感基因,它们也仅仅能解释不到10%的疾病遗传易感性。因此,使用新的研究方法,系统的寻找2型糖尿病易感位点是亟需解决的科学难题。课题组自2010年开始探索性的开展了中国人2型糖尿病全外显子捕获测序实验。初步结果显示,部分可导致氨基酸改变的新变异可能是潜在的2型糖尿病易感位点。本课题拟以此重要发现为基础,首先在6774例病例-对照样本中对这些候选易感位点进行检测和遗传关联分析,发现疾病易感位点。同时,再入选235个2型糖尿病家系进行家系关联研究进一步验证,经确定的易感位点,将开展初步的功能实验,为阐明其参与疾病发生的分子机制奠定基础。本研究对认识中国人2型糖尿病遗传机制具有重要理论意义,并将推动2 型糖尿病病因学研究及中国人2型糖尿病遗传流行病学研究的进程。
英文摘要
本项目主要聚焦于通过全外显子组测序寻找中国人2型糖尿病的“致病”位点。我们对31个具备特殊糖尿病表型、携带2型糖尿病已知易感位点少的患者,进行了全外显子组测序,发现一个具有严重糖尿病临床特征的患者携带INS基因信号肽上的一个错义突变p.Ala2Thr (A2T)。随后,在大样本病例-对照人群(6523个病例和4635个对照)中进行验证,发现该变异占病例人群的0.06%,而在对照组中未发现该突变。对A2T突变的功能学研究发现A2T突变胰岛素较野生型胰岛素相比,大量蓄积于内质网中,引起内质网分子伴侣(CRT、Calreticulum、BIP)以及内质网应激通路的激活 (PERK-p-eIF2α-ATF4,p-IRE1α-sXBP1)。因此,我们推测INS基因的A2T突变通过引起内质网应激导致2型糖尿病的发生,是中国人2型糖尿病的“致病”突变。此外,我们还进行了中国人2型糖尿病及其并发症的遗传学研究。通过全基因组关联研究发现了中国人2型糖尿病新易感基因PAX4,其rs10229583位点与2型糖尿病密切相关(P = 2.6×10-8);验证发现ZNRF1,COLEC12, SCYL1BP1及API5与中国人糖尿病视网膜病变及病变程度相关。药物基因组学方面,发现PAX4、KCNQ1、PSMD6基因影响罗格列酮或者瑞格列奈的药物降糖疗效。以上原创性研究成果进一步了解析中国人2型糖尿病遗传特点,并为深入揭示其遗传机制奠定了基础,亦为转化应用于指导临床个体化治疗提供了理论指导。本项目累计发表SCI论文17篇,其中IF>5分为6篇,培养硕博士研究生共7名。获省部级科技进步一等奖两项。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
DOI:10.1155/2014/912052
发表时间:2014
期刊:BioMed research international
影响因子:--
作者:Zhao Y;Hong N;Liu X;Wu B;Tang S;Yang J;Hu C;Jia W
通讯作者:Jia W
DOI:10.1111/j.1464-5491.2012.03758.x
发表时间:2013-01
期刊:Diabetic Medicine
影响因子:3.5
作者:Rong Zhang;Fusong Jiang;Cheng Hu;Weihui Yu;J. Wang;Congrong Wang;Xiaojing Ma;Sheng Tang;
通讯作者:Rong Zhang;Fusong Jiang;Cheng Hu;Weihui Yu;J. Wang;Congrong Wang;Xiaojing Ma;Sheng Tang;
Genome-wide association meta-analysis identifies novel variants associated with fasting plasma glucose in East Asians.
全基因组关联荟萃分析发现了与东亚人空腹血糖相关的新变异。
DOI:10.2337/db14-0563
发表时间:2015-01
期刊:Diabetes
影响因子:7.7
作者:Hwang JY;Sim X;Wu Y;Liang J;Tabara Y;Hu C;Hara K;Tam CH;Cai Q;Zhao Q;Jee S;Takeuchi F;Go MJ;Ong RT;Ohkubo T;Kim YJ;Zhang R;Yamauchi T;So WY;Long J;Gu D;Lee NR;Kim S;Katsuya T;Oh JH;Liu J;Umemura S;Kim YJ;Jiang F;Maeda S;Chan JC;Lu W;Hixson JE;Adair LS;Jung KJ;Nabika T;Bae JB;Lee MH;Seielstad M;Young TL;Teo YY;Kita Y;Takashima N;Osawa H;Lee SH;Shin MH;Shin DH;Choi BY;Shi J;Gao YT;Xiang YB;Zheng W;Kato N;Yoon M;He J;Shu XO;Ma RC;Kadowaki T;Jia W;Miki T;Qi L;Tai ES;Mohlke KL;Han BG;Cho YS;Kim BJ
通讯作者:Kim BJ
Association of PAX4 genetic variants with oral antidiabetic drugs efficacy in Chinese type 2 diabetes patients
中国2型糖尿病患者PAX4基因变异与口服降糖药疗效的关系
DOI:10.1038/tpj.2014.18
发表时间:2014-10-01
期刊:PHARMACOGENOMICS JOURNAL
影响因子:2.8
作者:Chen, M.;Hu, C.;Jia, W.
通讯作者:Jia, W.
Genome-wide association study identifies three novel loci for type 2 diabetes
全基因组关联研究确定了 2 型糖尿病的三个新位点
DOI:10.1093/hmg/ddt399
发表时间:2014-01-01
期刊:HUMAN MOLECULAR GENETICS
影响因子:3.5
作者:Hara, Kazuo;Fujita, Hayato;Kadowaki, Takashi
通讯作者:Kadowaki, Takashi
下丘脑血管内皮铁稳态在糖脂代谢中作用及机制的研究
  • 批准号:
    --
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    52万元
  • 批准年份:
    2022
  • 负责人:
    胡承
  • 依托单位:
IL-22调控FXR影响肝脏胆汁酸及糖脂代谢改善2型糖尿病机制研究
  • 批准号:
    81974118
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    59.0万元
  • 批准年份:
    2019
  • 负责人:
    胡承
  • 依托单位:
CDKN2A基因在胰岛β细胞衰老致2型糖尿病的机制及其致病变异定位
  • 批准号:
    91649112
  • 项目类别:
    重大研究计划
  • 资助金额:
    60.0万元
  • 批准年份:
    2016
  • 负责人:
    胡承
  • 依托单位:
中国人2型糖尿病易感位点7q32中致病位点的定位及其机制研究
  • 批准号:
    81570713
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    58.0万元
  • 批准年份:
    2015
  • 负责人:
    胡承
  • 依托单位:
中国人2型糖尿病全基因组关联研究中发现易感位点的大样本关联研究
  • 批准号:
    30800617
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    20.0万元
  • 批准年份:
    2008
  • 负责人:
    胡承
  • 依托单位:
国内基金
海外基金