以地衣为主的植被约占全球地面植被的8%，地衣区系与地衣多样性的调查研究对全面理解陆地生态系统的结构和功能是不可或缺的。选择分别位于我国自然地理三个不同台阶，又属于具有国际意义的陆地生物多样性关键地区的四川贡嘎山、陕西太白山和吉林长白山进行大型地衣多样性比较研究，一方面可在查清我国这三个关键地区的地衣种类、数量、化学成分、地理分布及其经济价值的基础上，确定各个地区的优势种、濒危种、关键种、特有种及资源种，为其资源的合理利用及有效保护提供可靠的信息；另一方面可为东亚北美地衣区系的比较研究、及地衣型真菌的系统演化研究积累基本科学资料。在研究过程中将采取整体的物种多样性比较、在各个垂直分布带设置样方进行物种组成的比较以及地衣多样性与高等植物区系相结合的比较研究方法。预计累计鉴定10,000号地衣标本，涉及50－60科，100－120属，450－500种的大型地衣及在分类学上重要的微型地衣种类。