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PHF6调控核糖体基因编码区转录沉默的机制研究
结题报告
批准号:
31871312
项目类别:
面上项目
资助金额:
60.0 万元
负责人:
陶伟
依托单位:
学科分类:
C0602.基因表达及非编码序列调控
结题年份:
2022
批准年份:
2018
项目状态:
已结题
项目参与者:
张丽君、黄晓科、管仪婷、黄莉、张超、徐斐凡
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中文摘要
组蛋白修饰阅读器蛋白能够结合特定修饰的染色质进而招募其他表观遗传修饰酶以及转录因子等来达到特异性地抑制或激活基因转录的目的。作为一个阅读器蛋白,PHF6的突变与多种癌症疾病密切相关。已知PHF6是一个核仁蛋白,参与调控核糖体基因的转录活动。本申请项目试图研究PHF6抑制核糖体基因转录的机制,尤其是探究PHF6沉默核糖体编码区转录的功能机制,研究编码区DNA甲基化抑制PHF6结合的方式,探索PHF6识别组蛋白修饰的种类,分析它参与反义RNA转录的作用方式,验证PHF6通过反义RNA介导的H4K20me3修饰从而抑制编码区转录的功能作用关系,为深入了解PHF6对基因转录的控制机制及其在相关疾病发生的作用提供新的研究信息。
英文摘要
Histone reader proteins can bind specific modified chromatin. Then they recruit epigenetic modification enzymes and transcription factors to achieve the purpose of given inhibiting or activating gene transcription. As a reader protein, mutations in PHF6 are closely related to a variety of cancer diseases. Furthermore, PHF6 is known to be a nucleolar protein involved in the regulation of the transcriptional activity of ribosomal genes. This project attempts to investigate the mechanism by which PHF6 inhibits the transcription of ribosomal genes. In particular, it explores the functional mechanism of PHF6 in transcription of the silenced ribosomal coding region and explores the histone modifications it recognizes and analyzes its role in the antisense RNA transcriptome. This project identifies the mechanism that PHF6 through the antisense RNA-mediated H4K20me3 modification to inhibit the transcriptional function of the coding region. It provides a new insight into the mechanism by which PHF6 regulates gene transcription and its role in related diseases.
组蛋白修饰阅读器蛋白能够结合特定修饰的染色质进而招募其他表观遗传修饰酶以及转录因子等来达到特异性地抑制或激活基因转录的目的。作为一个阅读器蛋白,本课题试图研究核仁蛋白PPHF6抑制核糖体基因转录的表观遗传机制。研究发现PHF6能够在核糖体的基因体(gene body)上,招募H4K20me3甲基化酶,从而导致rDNA上发生H4K20me3的修饰,从而抑制了核糖体基因的转录。当Dnmt1结合在rDNA基因体上水平下降,则DNA甲基化水平下降,从而造成PHF6结合上升,招募H4K20me3的表观修饰酶,导致基因体H4K20me3的修饰水平上升,以及核糖体基因的转录抑制。本研究为表观遗传调控基因转录提够了新的信息。 ....
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
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专利列表
Senescence-activated enhancer landscape orchestrates the senescence-associated secretory phenotype in murine fibroblasts.
衰老激活的增强子景观协调小鼠成纤维细胞中衰老相关的分泌表型
DOI:10.1093/nar/gkaa858
发表时间:2020-11-04
期刊:Nucleic acids research
影响因子:14.9
作者:Guan Y;Zhang C;Lyu G;Huang X;Zhang X;Zhuang T;Jia L;Zhang L;Zhang C;Li C;Tao W
通讯作者:Tao W
ATF3 drives senescence by reconstructing accessible chromatin profiles.
ATF3 通过重建可接近的染色质谱来驱动衰老
DOI:10.1111/acel.13315
发表时间:2021-03
期刊:Aging cell
影响因子:7.8
作者:Zhang C;Zhang X;Huang L;Guan Y;Huang X;Tian XL;Zhang L;Tao W
通讯作者:Tao W
Gene body methylation safeguards ribosomal DNA transcription by preventing PHF6-mediated enrichment of repressive histone mark H4K20me3.
基因体甲基化通过阻止 PHF6 介导的抑制性组蛋白标记 H4K20me3 的富集来保护核糖体 DNA 转录
DOI:10.1016/j.jbc.2021.101195
发表时间:2021-10
期刊:The Journal of biological chemistry
影响因子:--
作者:Huang X;Zhang X;Zong L;Gao Q;Zhang C;Wei R;Guan Y;Huang L;Zhang L;Lyu G;Tao W
通讯作者:Tao W
基于代谢—表观遗传学调控轴研究组蛋白乳酰化调控衰老机制
  • 批准号:
    32241006
  • 项目类别:
    专项项目
  • 资助金额:
    63.00万元
  • 批准年份:
    2022
  • 负责人:
    陶伟
  • 依托单位:
TGF-β/Smad信号通路通过控制组蛋白H4K20甲基化修饰调控细胞复制性衰老研究
  • 批准号:
    31671426
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    62.0万元
  • 批准年份:
    2016
  • 负责人:
    陶伟
  • 依托单位:
组蛋白去甲基化酶KDM3B调控细胞衰老的功能机制
  • 批准号:
    31471205
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    80.0万元
  • 批准年份:
    2014
  • 负责人:
    陶伟
  • 依托单位:
DNA甲基化调控核糖体基因转录延长的功能机制研究
  • 批准号:
    91219101
  • 项目类别:
    重大研究计划
  • 资助金额:
    100.0万元
  • 批准年份:
    2012
  • 负责人:
    陶伟
  • 依托单位:
染色质改构因子调控RNA聚合酶I转录起始的研究
  • 批准号:
    31171255
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    70.0万元
  • 批准年份:
    2011
  • 负责人:
    陶伟
  • 依托单位:
体细胞重编程为多潜能干细胞中核糖体基因转录调控的表观遗传学机制
  • 批准号:
    31071116
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    35.0万元
  • 批准年份:
    2010
  • 负责人:
    陶伟
  • 依托单位:
Mi-2/NuRD 复合体调控rDNA转录的分子机制研究
  • 批准号:
    30871377
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    33.0万元
  • 批准年份:
    2008
  • 负责人:
    陶伟
  • 依托单位:
纺锤体组装中maskin蛋白的功能与机制研究
  • 批准号:
    30671063
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    32.0万元
  • 批准年份:
    2006
  • 负责人:
    陶伟
  • 依托单位:
植物细胞核仁结构与功能区域化研究
  • 批准号:
    30270081
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    25.0万元
  • 批准年份:
    2002
  • 负责人:
    陶伟
  • 依托单位:
国内基金
海外基金