番茄疮痂病是严重影响番茄生产的细菌性病害之一，采用抗病品种是防治该病害最经济有效的措施。本项目利用抗病材料Hawaii7981、LA1589、PI128216分别与不同的感病材料杂交获得的F2分离群体或由抗病材料PI114490衍生的回交自交群体，研究了这些材料对疮痂病菌T3小种的抗性遗传规律，并采用分子标记对抗性基因或QTL进行了精细定位。结果显示，不同材料对T3小种的抗性呈现不同的遗传模式，Hawaii7981、LA1589和PI128216对T3小种的抗性都是由位于11号染色体上的一个显性基因控制，而PI114490对T3小种的抗性则由多个基因控制，其中位于11号染色体上的一个QTL贡献了56.5%的抗性。根据番茄基因组序列信息，获得了PI128216所携带的抗性基因的候选基因。利用与基因或QTL紧密连锁的分子标记进行标记辅助选择，获得了抗性材料。同时构建了抗病材料PI28216 和PI114490的基因组BAC文库，为开展抗性基因/QTL克隆、探索番茄疮痂病抗性机理和标记辅助选择奠定基础。另外，培养了4名研究生，两名博士研究生已于2011年毕业，还有1名硕士生和1名博士生将于2013年6月毕业；已发表SCI论文2篇、中文核心期刊论文2篇，还有1篇SCI论文正在审稿中。总的说来，本项目按计划完成了研究目标，部分成果超过了预期目标。