长链非编码RNA-SNRPEP4影响三阴性乳腺癌化疗敏感性的机制研究

批准号:
81672600
项目类别:
面上项目
资助金额:
57.0 万元
负责人:
余科达
依托单位:
学科分类:
H1814.肿瘤化学药物治疗
结题年份:
2020
批准年份:
2016
项目状态:
已结题
项目参与者:
徐晓恩、江一舟、郭雅洁、金希、吉芃
国基评审专家1V1指导 中标率高出同行96.8%
结合最新热点,提供专业选题建议
深度指导申报书撰写,确保创新可行
指导项目中标800+,快速提高中标率
微信扫码咨询
中文摘要
三阴性乳腺癌(TNBC)恶性程度高,缺乏已知治疗靶点,化疗是其唯一可能有效的系统治疗。申请人前期通过分析近300例TNBC标本全基因转录组信息和化疗疗效,建立了10基因疗效预测模型(含2个长链非编码RNA[lncRNA])。其中,lncRNA SNRPEP4高表达与化疗耐药显著相关。按预实验,SNRPEP4是SNRPE的假基因,两者的3’UTR序列高度重合。我们推测SNRPEP4可能具有“miRNA生物海绵”效应,通过清除能抑制SNRPE表达的miRNA而发挥作用。我们将研究SNRPEP4和SNRPE对TNBC细胞化疗敏感性的影响;应用ChIRP技术、荧光报告基因实验等确立SNRPEP4、SNRPE和miRNA三者间交互作用;并明确SNRPEP4调控轴的临床价值。本项目将证实SNRPEP4在TNBC化疗耐药中的地位,为精准逆转TNBC化疗抵抗提供新思路。
英文摘要
Triple-negative breast cancer (TNBC) is one of the most aggressive subtypes of breast cancer. Chemotherapy is the current mainstay of treatment for this subtype. We have analyzed about 300 TNBC sample using transcriptome microarrays to predict the chemo-sensitivity of TNBC and successfully developed an integrated mRNA-long noncoding RNAs (lncRNA) signature based on eight mRNAs and two lncRNAs (HIST2H2BC and SNRPEP4). According to the preliminary experiments such as RNA Pull Down assay, SNRPEP4 does not combine with a specific functional protein. Of note, SNRPEP4 is a pseudogene of SNRPE and shares partial 3’ UTR with SNRPE. Therefore, we speculate that SNRPEP4 might works as a “miRNA sponge”, which could eliminate the miRNAs targeting SNRPE. In this project, we would investigate the effect of SNRPEP4 and SNRPE in chemo-sensitivity of TNBC, reveal the interactions between SNRPEP4, SNRPE, and miRNA using ChIRP and luciferase reporter assays, and determine the clinical relevance of SNRPEP4-miRNA-SNRPE regulation axis. The findings from the present project would help to clarify the effect of SNRPEP4 in chemo-resistance and to develop precise and individualized treatment of TNBC patients.
首先,我们研究了目标基因SNRPEP4的源基因(SNRPE)在TNBC中的作用。我们发现,SNRPE基因在三阴性乳腺癌(TNBC)中高扩增,SNRPE在TNBC细胞系中高表达,在体外体内均能增强TNBC的增殖和侵袭能力。SNRPE高表达时,SNRPE竞争性结合较多的DDX20,而减弱了ETV3对mTOR通路的抑制作用,最终导致mTOR通路的过度激活并促进TNBC进展。其次,我们探索了SNRPEP4与TNBC进展及治疗敏感性的机制。我们收集了近300例接受含紫杉类方案辅助治疗的TNBC患者的新鲜组织,并完成了转录组芯片分析,按患者复发转移与否,建立了包含8个mRNA和2个lncRNA的能预测紫杉类疗效后复发与否的模型;SNRPEP4是其中一个标志性lncRNA,单基因即能较准确反映紫杉类疗效。在SNRPEP4功能研究中,我们发现,SNPREP4毗邻的AK124454,都定位在染色体19p13.3区段上,互相成串联前后排列,而AK124454的表型更加显著。体内和体外实验证实AK124454与TNBC增殖与迁移能力密切相关,裸鼠尾静脉注射稳定敲减AK124454的TNBC细胞后,小鼠肺转移结节数量减少。进一步分子机制揭示AK124454可以通过促进泛素化修饰来导致染色质结合蛋白ZMYND8的降解。后续靶向针对AK124454设计了反义寡核苷酸,为TNBC靶向性治疗提供了实验室基础。本课题发表SCI论文8篇,本人均为通讯或第一作者(含共同)作者。其中主要研究结果发表于Sci Adv(2019,IF 13.1)。项目实施期间,申请人获得2017年NSFC优秀青年研究项目与2020年NSFC面上项目的资助;成果获得上海市科技进步一等奖、中国抗癌协会科技进步一等奖。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
Effect of Ki-67 Expression Levels and Histological Grade on Breast Cancer Early Relapse in Patients with Different Immunohistochemical-based Subtypes
Ki-67 表达水平和组织学分级对不同免疫组织化学亚型患者乳腺癌早期复发的影响。
DOI:10.1038/s41598-020-64523-1
发表时间:2020-05-06
期刊:SCIENTIFIC REPORTS
影响因子:4.6
作者:Liang, Qin;Ma, Ding;Yu, Ke-Da
通讯作者:Yu, Ke-Da
Concurrent neoadjuvant chemotherapy and estrogen deprivation in patients with estrogen receptor-positive, human epidermal growth factor receptor 2-negative breast cancer (CBCSG-036): A randomized, controlled, multicenter trial
雌激素受体阳性、人表皮生长因子受体 2 阴性乳腺癌患者同步新辅助化疗和雌激素剥夺 (CBCSG-036):一项随机、对照、多中心试验
DOI:10.1002/cncr.32057
发表时间:2019
期刊:Cancer
影响因子:6.2
作者:Yu Ke Da;Wu Si Yu;Liu Guang Yu;Wu Jiong;Di Gen Hong;Hu Zhen;Hou Yi Feng;Chen Can Ming;Fan Lei;Tang Li Chen;Shen Zhen Zhou;Wu Ke Jin;Zhuang Zhi Gang;Zhang Hong Wei;Shao Zhi Ming
通讯作者:Shao Zhi Ming
Association of adjuvant aromatase inhibitor with cataract risk in postmenopausal women with breast cancer
辅助芳香酶抑制剂与绝经后乳腺癌女性白内障风险的关联。
DOI:10.21037/atm.2020.02.112
发表时间:2020-03-01
期刊:ANNALS OF TRANSLATIONAL MEDICINE
影响因子:--
作者:Chen, Han;Shao, Zhi-Ming;Xu, Ge-Zhi
通讯作者:Xu, Ge-Zhi
Immune-Activated Regional Lymph Nodes Predict Favorable Survival in Early-Stage Triple-Negative Breast Cancer.
免疫激活的区域淋巴结可预测早期三阴性乳腺癌的良好生存率。
DOI:10.3389/fonc.2020.570981
发表时间:2020
期刊:Frontiers in oncology
影响因子:4.7
作者:Chen YY;Ge JY;Ma D;Yu KD
通讯作者:Yu KD
The endogenous retrovirus-derived long noncoding RNA TROJAN promotes triple-negative breast cancer progression via ZMYND8 degradation
内源性逆转录病毒衍生的长非编码RNA TROJAN通过ZMYND8降解促进三阴性乳腺癌进展
DOI:10.1126/sciadv.aat9820
发表时间:2019-03-01
期刊:SCIENCE ADVANCES
影响因子:13.6
作者:Jin, Xi;Xu, Xiao-En;Shao, Zhi-Ming
通讯作者:Shao, Zhi-Ming
拷贝数扩增基因ENSA通过与HSP90结合促进LAR型三阴性乳腺癌增殖与耐药的机制研究
- 批准号:--
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:55万元
- 批准年份:2020
- 负责人:余科达
- 依托单位:
趋化因子诱骗受体DARC通过清除微环境中CCL28抑制MSL型三阴性乳腺癌增殖侵袭的机制研究
- 批准号:81370075
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:78.0万元
- 批准年份:2013
- 负责人:余科达
- 依托单位:
揭示微环境中趋化因子Decoy受体的功能性基因多态对乳腺癌转移潜能的影响
- 批准号:81001169
- 项目类别:青年科学基金项目
- 资助金额:22.0万元
- 批准年份:2010
- 负责人:余科达
- 依托单位:
国内基金
海外基金
