噬菌体新穿孔素-内溶素双组分系统的鉴定及其裂解水稻细菌性褐条病菌的机制研究
结题报告
批准号:
31872017
项目类别:
面上项目
资助金额:
59.0 万元
负责人:
李斌
依托单位:
学科分类:
C1406.生物防治
结题年份:
2022
批准年份:
2018
项目状态:
已结题
项目参与者:
邱文、陈正贤、张阳、王晓璇、刘梦菊、张丰、陈杰、吴秀芹、刘柳
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中文摘要
为有效利用自然界广泛存在的细菌天敌-噬菌体来生态调控植物细菌病害,迫切需要搞清楚噬菌体复杂且多样化的裂解机制。申请者团队前期国内外首次分离获得水稻细菌性褐条病菌的烈性噬菌体AP1,全基因组测定及生信和生物学分析鉴定出一种具有新裂解机制的穿孔素-内溶素双组分系统,其无信号肽的内溶素单独具溶菌功能,且与不同于目前报道类型的穿孔素互作。本申请项目拟首先分离、纯化和特征化噬菌体AP1的穿孔素和内溶素,明确它们的生物学功能;然后利用全长基因的截短体分别构建穿孔素和内溶素的突变体并比较其和野生型的裂解能力,明确它们在噬菌体AP1裂解水稻褐条病菌中的功能;最后在生物学、细胞学和共表达水平上鉴定穿孔素和内溶素在裂解中的协同增效,结合pull down和BiFC互作分析,以最终明确噬菌体AP1新穿孔素-内溶素双组分系统裂解水稻褐条病菌的机制,为更好地利用这一新裂解系统来生物防治植物细菌病害提供理论依据。
英文摘要
In order to effectively control plant bacterial diseases using the bacteriophages that widely distributed in nature, it is very necessary to make clear the complex and diverse mechanism of bacteriophage lysis. The applicants firstly isolated and obtained lytic bacteriophage AP1 of rice bacterial brown stripe pathogen in the world, furthermore, a new two-component lysis system was successfully identified through complete genome sequencing, bioinformatics analyses and biological test. Prokaryotic expression revealed the lytic function of endolysin without signal peptide and the synergistic effect of holin, while the interaction between them was justified by bacterial two-hybrid analysis. The aim of this project is to clarify their biological function by isolating, purifying and characterizing the holin and endolysin of bacteriophage AP1; and then elucidate the role of holin and endolysin in the lysis of Acidovorax oryzae by comparing the lysis ability between the wild type and the constructed mutants; and finally determinate the mechanism of the new two-component system in the lysis of Acidovorax oryzae by identifying their synergistic effects in biology, cytology and co-expression levels, in combination with the interaction based on the analysis of BiFC and pull down. The result of this study will provide a theoretical basis for the use of the new lysis system in biological control of plant bacterial diseases.
为有效利用自然界广泛存在的细菌天敌-噬菌体来生态调控水稻细菌性褐条病等植物细菌病害,迫切需要搞清楚噬菌体的裂解机制,本项目在前期国内外首次分离获得水稻褐条病菌烈性噬菌体AP1,生信分析发现其存在新型穿孔素-内溶素双组分系统的基础上,首先利用原核表达结合生信分析等手段,分别研究了噬菌体AP1的穿孔素和内溶素,从实验层面明确了穿孔素HolAP定位在细胞膜上,单独表达HolAP不影响细菌生长,其无信号肽的内溶素LysAP单独具溶菌功能;然后构建了LysAP的C端跨膜区域缺失突变体,发现其对细菌生长无明显影响;表达纯化LysAP缺失突变体,发现其不能透过细胞膜到达周质以裂解细胞壁;叠氮化钠抑制菌体裂解证实了LysAP是通过Sec蛋白转运到内膜上,点突变发现保守位点之一的E点突变LysE15A显著影响LysAP的裂解,明确其在噬菌体AP1裂解水稻褐条病菌中的功能;接着鉴定出水稻褐条病菌中存在与LysAP高度同源的蛋白LysAo,通过构建lysAo过表达和缺失突变体,并与野生型对比发现虽然突变没有改变细菌的噬菌体敏感性,但LysAo具有裂解细菌活性,这一现象无疑凸显了水平转移的内溶素基因在噬菌体-宿主细菌互作中的重要性,为全面揭示噬菌体的裂解机制提供了新视野;最后过表达HolAP与LysAP并与单独表达对比,结合细菌双杂等互作分析,在生物学、细胞学和共表达水平上确定了穿孔素和内溶素在裂解细菌中的协同增效,最终明确了噬菌体AP1新穿孔素-内溶素双组分系统裂解水稻褐条病菌的机制,为更好地利用这一新裂解系统来生物防治植物细菌病害提供了理论依据。总之,本项目已顺利完成了各项研究内容和目标,在成功鉴定水稻褐条病菌噬菌体穿孔素-内溶素双组分系统的基础上,基本阐明了其裂解水稻细菌性褐条病菌的复杂机制,为更好地利用噬菌体来生态控制水稻细菌性褐条病提供了坚实的基础。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
DOI:10.3390/ijms23010414
发表时间:2021-12-30
期刊:International journal of molecular sciences
影响因子:5.6
作者:Jiang H;Lv L;Ahmed T;Jin S;Shahid M;Noman M;Osman HH;Wang Y;Sun G;Li X;Li B
通讯作者:Li B
Involvement of non-coding RNAs during infection of rice by Acidovorax oryzae
非编码 RNA 在水稻食酸菌感染过程中的参与
DOI:10.1111/1758-2229.12982
发表时间:2021-06-13
期刊:ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY REPORTS
影响因子:3.3
作者:Cui,Zhouqi;Zhang,Yang;Li,Bin
通讯作者:Li,Bin
DOI:10.2174/0929866528666210218220138
发表时间:2021
期刊:Protein and Peptide Letters
影响因子:--
作者:Temoor Ahmed;Muhammad Shahid;Muhammad Noman;Sher Muhammad;Muhammad Tahir ul Qamar;Arshad Ali;Awais Maqsood;Rahila Hafeez;Solabomi Olaitan Ogunyemi;Bin Li
通讯作者:Bin Li
Beneficial Effect and Potential Risk of Pantoea on Rice Production.
全菌对水稻生产的有益影响及潜在风险
DOI:10.3390/plants11192608
发表时间:2022-10-04
期刊:Plants (Basel, Switzerland)
影响因子:--
作者:Lv L;Luo J;Ahmed T;Zaki HEM;Tian Y;Shahid MS;Chen J;Li B
通讯作者:Li B
Advancements in the Use of Bacteriophages to Combat the Kiwifruit Canker Phytopathogen Pseudomonas syringae pv. actinidiae.
使用噬菌体对抗猕猴桃溃疡病植物病原体丁香假单胞菌的进展。
DOI:10.3390/v14122704
发表时间:2022-12-02
期刊:Viruses
影响因子:--
作者:Luo J;Dai D;Lv L;Ahmed T;Chen L;Wang Y;An Q;Sun G;Li B
通讯作者:Li B
抗稻麦病原真菌环二肽合成的四碳二羧酸调 控机制研究
  • 批准号:
    Z24C140015
  • 项目类别:
    省市级项目
  • 资助金额:
    0.0万元
  • 批准年份:
    2024
  • 负责人:
    李斌
  • 依托单位:
非宿主噬菌体在宿主噬菌体裂解水稻白叶枯病菌中的帮助角色及其自我牺牲机制研究
  • 批准号:
    32372614
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    50万元
  • 批准年份:
    2023
  • 负责人:
    李斌
  • 依托单位:
多孔氢键有机框架材料的可控构筑及低碳烃分离机制研究
  • 批准号:
    LR22E030003
  • 项目类别:
    省市级项目
  • 资助金额:
    0.0万元
  • 批准年份:
    2021
  • 负责人:
    李斌
  • 依托单位:
基于新型多孔氢键-有机框架材料的乙烯/乙烷反转分离性能研究
  • 批准号:
    --
  • 项目类别:
    --
  • 资助金额:
    59万元
  • 批准年份:
    2020
  • 负责人:
    李斌
  • 依托单位:
噬菌体克服水稻细菌性褐条病菌CRISPR/Cas免疫的anti-CRISPR机制研究
  • 批准号:
    --
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    58万元
  • 批准年份:
    2020
  • 负责人:
    李斌
  • 依托单位:
新型阴离子框架多孔材料的构筑和烯烃纯化性能的研究
  • 批准号:
    51803179
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    25.0万元
  • 批准年份:
    2018
  • 负责人:
    李斌
  • 依托单位:
水稻白叶枯病菌前噬菌体高效诱导释放的机制研究
  • 批准号:
    LZ19C140002
  • 项目类别:
    省市级项目
  • 资助金额:
    0.0万元
  • 批准年份:
    2018
  • 负责人:
    李斌
  • 依托单位:
水稻细菌性褐条病菌致病相关non-coding RNAs的鉴定、功能及调控机制研究
  • 批准号:
    31571971
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万元
  • 批准年份:
    2015
  • 负责人:
    李斌
  • 依托单位:
水稻细菌性褐条病菌VI型分泌系统的组成、互作和功能研究
  • 批准号:
    31371904
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    78.0万元
  • 批准年份:
    2013
  • 负责人:
    李斌
  • 依托单位:
林业有害生物一品红细菌性叶斑病菌的生物学特性与遗传变异规律研究
  • 批准号:
    30600475
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    8.0万元
  • 批准年份:
    2006
  • 负责人:
    李斌
  • 依托单位:
国内基金
海外基金