海南省药用植物资源丰富，是名副其实的“天然南药宝库”。目前，有关海南南药内生菌的研究相对较少。本项目从海南省各地采集南药样品，样品涉及槟榔、砂仁、益智和阴香等20余种，从中共分离内生菌200余株，以热区危害严重的植物病原真菌为受试菌，从中筛选出16株具有较高拮抗活性的菌株，其中内生细菌8株，内生真菌8株，通过鉴定发现它们具有较好的生物多样性，抗菌谱较广。对LYM3、DYSJ3、JLR6等部分菌株的发酵条件进行了优化，获得了其最适培养基组成和培养条件，研究了活性成分的提取工艺，多数活性产物粗提物较容易制备，拮抗活性高，且具有较好的稳定性。盆栽试验或活体接种试验发现DYSJ5、WYG5和SR06等菌株对香蕉枯萎病、芒果炭疽病及香蕉炭疽病具有较好的防效，并初步获得了相应菌株的应用方法。利用活性跟踪的方法，从LYM3、DYSJ3、SR05等菌株中共分离得到抗菌活性化合物12个，其中从内生细菌LYM3的发酵液中分离出三种环状脂肽类化合物，分属于伊枯草菌素和表面活性素两类，对香蕉炭疽菌具有较强的抑制作用；从杂色曲霉DYSJ3的菌丝体中分离出4中抗菌活性产物，其中化合物DYSJ3-3和DYSJ3-4为首次从该菌种中分离，可能为新化合物，DYSJ3-4对香蕉炭疽菌和芒果炭疽菌具有较强的抑制作用，可有效的防控炭疽病在果实上的发生。本研究为海南南药内生菌的开发和利用奠定了一定的基础。