抗结核药相关药物性肝损伤的基因标记及其遗传机制研究

批准号:
81773818
项目类别:
面上项目
资助金额:
54.0 万元
负责人:
秦胜营
依托单位:
学科分类:
H3511.临床药理
结题年份:
2021
批准年份:
2017
项目状态:
已结题
项目参与者:
沈陆、怀聪、李沫、周伟、杜慧慧、张素丽、韦雨琦、欧阳君、周强
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中文摘要
药物性肝损伤是抗结核治疗中最常见、最严重的不良反应之一,严重时可致肝坏死甚至危及生命,是治疗中断及失败的重要原因。目前尚缺乏统一、有效的临床诊断和预测指标。国内外研究表明,遗传因素对抗结核治疗中药物性肝损伤的发生起到重要的影响作用,但既往研究大多存在样本量少、分型通量低、缺乏系统性分析等不足,至今未找到其有效基因标记。本课题中我们将在与国际严重药物不良反应联盟前期合作研究结果基础上,进一步扩大收集抗结核用药导致严重肝损伤的病例及其相应对照样本,采用序列捕获及二代测序的手段,通过基于信号通路的多基因系统性分析策略,深入挖掘中国汉族人群抗结核药物引起肝损伤相关基因标记,进而对其进行大样本量验证及体内外功能机制研究,筛选出准确有效的基因标记,基于先前建立的基因分型芯片技术,研制中国汉族人群抗结核药引起肝损伤的预测技术体系,为结核病患者的个体化用药及未来预防性药物的开发提供理论依据。
英文摘要
Anti-Tuberculosis Drug-Induced Liver Injury (ATLI) is one of the most common and serious adverse reactions in anti-tuberculosis therapy. It usually causes the interruption or failure of the therapy and leads to hepatonecrosis or death in the worst cases. At present, there is a lack of unified and effective marker for clinical diagnosis and prediction. Previous studies revealed that genetic factors may play an important role in the occurrence of ATLI. However, effective genetic markers of ATLI have not been found so far due to the limitation of sample size, genotyping through-put and the lack of systematic analysis in previous reports. In this project, based on the collaboration results with the International Serious Adverse Event Consortium (iSAEC), we are going to expand the sample size of ATLI cases and matched control samples, comprehensively discover the genetic markers of ATLI in Chinese Han population through pathway-based multi-gene systematically association analysis method by target enrichment and next generation sequencing. Then, effective genetic markers will be furtherly verified by larger sample validation, in vitro and in vivo function study. Based on our previously established microarray genotyping method, a prediction system of ATLI in Chinese Han population will be developed, which will lay the foundation for the personalized medicine of anti-tuberculosis drug and future preventive drug discovery in Chinese Han population.
药物性肝损伤是抗结核治疗中最常见、最严重的不良反应之一,也是抗结核治疗中断及失败的重要原因,严重时可致肝坏死甚至危及生命。目前尚缺乏统一、有效的临床诊断和预测指标。为了深入了解中国汉族人群中抗结核药物引发肝损伤 (Anti-Tuberculosis Drug-Induced Liver Injury, ATLI) 的分子机制,探索其有效的早期诊断和预测分子标志物,本项目开展了基于人群的ATLI分子标记物研究和细胞水平的抗结核药物导致细胞损伤的机制研究。其中病例-对照关联研究筛选出了指示ATLI高风险的基因组分子标志物 UGT1A4 rs2011404 (χ2=4.6809, 矫正P=0.0305) 和位于SLC8A2、AK2、PSTPIP2等基因区域的4个关键的DNA甲基化标志物;进而我们构建了对特异性基因变异位点进行靶向修饰和表型检测的肝细胞平台,验证了上述所发现重要分子标志物的功能。随后,在细胞水平上我们进行了抗结核药关键响应基因的筛选,基于分别携带不同基因敲除的HepaRG肝细胞文库进行了利福平、异烟肼、吡嗪酰胺等抗结核药处理下的阴性筛选,最终揭示了五个与抗结核药引起的肝细胞损伤广泛相关的基因,并通过通路分析发现了核糖体组装通路对抗结核药物的迅速响应,这些可作为潜在的预防和治疗靶点。此外,本研究利用英国生物银行中的中国人群数据进行了肝功能指标相关基因位点的全基因组关联研究,确认了与中国人群总胆红素等五个肝指标相关的基因变异;最终综合上述发现的风险位点构建了中国人群抗结核药物用药风险预测体系。本项目揭示了基于患者外周血基因组的ATLI预测DNA甲基化标记,该指标有较高的稳定性,在将来指导中国人群抗结核个体化用药的临床转化中具有较好的应用前景;所发现的抗结核药物致肝损伤的新机制,为研究广泛药物致肝损伤的共有机制奠定了良好基础;肝功能指标相关基因变异位点的发现为从遗传角度理解中国人群肝指标的个体差异性和肝功能指标临床精准检测提供了参考数据。结合上述项目研究内容,目前已发表学术论文9篇,申请国家发明专利1项。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
Genome-Wide Analysis of DNA Methylation and Antituberculosis Drug-Induced Liver Injury in the Han Chinese Population
中国汉族人群 DNA 甲基化与抗结核药物性肝损伤的全基因组分析
DOI:10.1002/cpt.1563
发表时间:2019-08-06
期刊:CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
影响因子:6.7
作者:Huai, Cong;Wei, Yuqi;Qin, Shengying
通讯作者:Qin, Shengying
A novel wide-range microfluidic dilution device for drug screening
一种用于药物筛选的新型宽范围微流体稀释装置
DOI:10.1063/1.5085865
发表时间:2019
期刊:Biomicrofluidics
影响因子:3.2
作者:Wang Cong;Zhao Shikun;Zhao Xianglong;Chen Luan;Tian Zhengan;Chen Xiang;Qin Shengying
通讯作者:Qin Shengying
A methylation functional detection hepatic cell system validates correlation between DNA methylation and drug-induced liver injury
甲基化功能检测肝细胞系统验证DNA甲基化与药物性肝损伤之间的相关性
DOI:10.1038/s41397-020-0160-7
发表时间:2020-02
期刊:The Pharmacogenomics Journal
影响因子:--
作者:Wei Yuqi;Huai Cong;Zhou Chenxi;Gao Yaqi;Chen Luan;Zhou Wei;Wei Muyun;Qin Shengying
通讯作者:Qin Shengying
A next generation sequencing combined genome-wide association study identifies novel tuberculosis susceptibility loci in Chinese population
下一代测序结合全基因组关联研究确定了中国人群中新的结核病易感位点
DOI:10.1016/j.ygeno.2021.05.035
发表时间:2021
期刊:Genomics
影响因子:4.4
作者:Li Mo;Hu Yi;Zhao Baihui;Chen Luan;Huang Hailiang;Huai Cong;Zhang Xiaoqing;Zhang Jinghong;Zhou Wei;Shen Lu;Zhen Qi;Li Bao;Wang Wenjun;He Lin;Qin Shengying
通讯作者:Qin Shengying
Discovery of Novel Biomarkers of Therapeutic Responses in Han Chinese Pemetrexed-Based Treated Advanced NSCLC Patients
在汉族培美曲塞治疗的晚期 NSCLC 患者中发现治疗反应的新型生物标志物
DOI:10.3389/fphar.2019.00944
发表时间:2019-08
期刊:Frontiers in Pharmacology
影响因子:5.6
作者:Zhang Xiaoqing;Zhang Di;Huang Lihua;Li Guorong;Chen Luan;Ma Jingsong;Li Mo;Wei Muyun;Zhou Wei;Zhou Chenxi;Zhu Jinhang;Wang Zhanhui;Qin Shengying
通讯作者:Qin Shengying
抗精神病药物所致代谢综合征分子标记物挖掘及其机制研究
- 批准号:--
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:52万元
- 批准年份:2022
- 负责人:秦胜营
- 依托单位:
2019年度NSFC-FDCT精准医疗学术研讨会
- 批准号:81981260348
- 项目类别:国际(地区)合作与交流项目
- 资助金额:2.53万元
- 批准年份:2019
- 负责人:秦胜营
- 依托单位:
中国人群奥氮平药物反应相关遗传学及表观遗传学标记的综合性研究
- 批准号:81273596
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:75.0万元
- 批准年份:2012
- 负责人:秦胜营
- 依托单位:
中国人群利培酮药效相关多态性标记的系统性研究及其检测芯片的研制
- 批准号:30900799
- 项目类别:青年科学基金项目
- 资助金额:20.0万元
- 批准年份:2009
- 负责人:秦胜营
- 依托单位:
国内基金
海外基金
