以具"古稀有种"特征的南方红豆杉（Taxus wallichiana var. mairei）为材料，通过测定核、叶绿体及线粒体基因组的非编码区序列和进行AFLP、ISSR及SSR分子标记分析，研究其天然种群的遗传变异水平与分配状况、基因流、突变-漂变平衡、种群分化程度和历史过程；阐明复合种群网络的特征与类型，估测复合种群的遗传变异动态，并根据所了解的亚种群间的迁移式样鉴定出重要繁殖群；基于核苷酸多样性、单倍型多样性、重建的单倍型谱系关系和系统发育地理分析结果，推测种群的迁移路线、遗传过程及进化事件可能发生的时间，探讨影响种群分布格局形成的关键因素。这些研究将为南方红豆杉的保护和管理提供重要的理论依据。